Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470306
• Subject: XM_005268073.4
• Aligned Length: 1314
• Identities: 918
• Gaps: 396

Alignment

Query    1  ATGAGAATGTCTTCAAAGTTTCCATCACCACCTCTACCAATTTTTCTTCCACCGGAGCCAGTGGACTTAGGTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAATGTCTTCAAAGTTTCCATCACCACCTCTACCAATTTTTCTTCCACCGGAGCCAGTGGACTTAGGTTC  74

Query   75  CATAACAAGCTCCTCTTGTTCACTGAATGAGCTAGACAATATTTCCCACCTTTTAAGGAAAATATCAGCTGATA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATAACAAGCTCCTCTTGTTCACTGAATGAGCTAGACAATATTTCCCACCTTTTAAGGAAAATATCAGCTGATA  148

Query  149  TCAATGAAATTAAAGGAATGAAAGCAGCTATTTTGACAGTGGAAGCAAATCTTTTTGATCTAAATGTTAGAGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAATGAAATTAAAGGAATGAAAGCAGCTATTTTGACAGTGGAAGCAAATCTTTTTGATCTAAATGTTAGAGTG  222

Query  223  TCCAAGAATGAAGCAAAAATTTCATCTTTGGAGGTTAAAATGAATGAATATTCAACAACATATGAATGCAACAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCAAGAATGAAGCAAAAATTTCATCTTTGGAGGTTAAAATGAATGAATATTCAACAACATATGAATGCAACAG  296

Query  297  ACAGTTTGAAGATCAAGAAGAAGATACTGAATCACAGTCAAGAACTACTGATGTAAAAATAATCGGCTTCCTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACAGTTTGAAGATCAAGAAGAAGATACTGAATCACAGTCAAGAACTACTGATGTAAAAATAATCGGCTTCCTTA  370

Query  371  GAAACGTTGAGAAAGGAACTCAACAGAGGCAATTATTATCCCGACTGCAAATCGACCCAGTAATGGCAGAAACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAACGTTGAGAAAGGAACTCAACAGAGGCAATTATTATCCCGACTGCAAATCGACCCAGTAATGGCAGAAACT  444

Query  445  CTGCAGATGAGTCAA-----------------------------------------------------------  459
            |||||||||||||||                                                           
Sbjct  445  CTGCAGATGAGTCAAGATTACTATGACATGGAATCCATGGTCCATGCAGACACAAGATCATTTATTCTGAAGAA  518

Query  460  --------------------------------------------------------------------------  459
                                                                                      
Sbjct  519  GCCAAAGCTGTCTGAGGAAGTAGTAGTGGCACCAAACCAAGAGTCGGGGATGAAGACTGCAGATTCCCTTCGGG  592

Query  460  --------------------------------------------------------------------------  459
                                                                                      
Sbjct  593  TACTTTCAGGACACCTTATGCAGACACGAGATCTTGTACAACCAGATAAACCTGCAAGTCCCAAGTTTATAGTG  666

Query  460  --------------------------------------------------------------------------  459
                                                                                      
Sbjct  667  ACGCTGGATGGTGTCCCCAGCCCCCCAGGATACATGTCAGATCAAGAGGAGGACATGTGCTTTGAAGGAATGAA  740

Query  460  --------------------------------------------------------------------------  459
                                                                                      
Sbjct  741  ACCCGTAAACCAAACTGCAGCCTCAAACAAGGGACTCAGAGGTCTCCTCCACCCACAGCAGTTGCACTTGCTGA  814

Query  460  --------------------------------------GCTGAGATGAGTGAACTGAGTGTGGCACAGAAACCA  495
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGGCAGCTTGAGGACCCAAATGGTAGCTTTTCTAACGCTGAGATGAGTGAACTGAGTGTGGCACAGAAACCA  888

Query  496  GAAAAACTTTTGGAGCGCTGCAAGTACTGGCCTGCTTGTAAAAATGGGGATGAGTGTGCCTACCATCACCCCAT  569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAAAACTTTTGGAGCGCTGCAAGTACTGGCCTGCTTGTAAAAATGGGGATGAGTGTGCCTACCATCACCCCAT  962

Query  570  CTCACCCTGCAAAGCCTTCCCCAATTGTAAATTTGCTGAAAAATGTTTGTTTGTTCACCCAAATTGTAAATATG  643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCACCCTGCAAAGCCTTCCCCAATTGTAAATTTGCTGAAAAATGTTTGTTTGTTCACCCAAATTGTAAATATG  1036

Query  644  ATGCAAAGTGTACTAAACCAGATTGTCCCTTCACTCATGTGAGTAGAAGAATTCCAGTACTGTCTCCAAAAC--  715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1037  ATGCAAAGTGTACTAAACCAGATTGTCCCTTCACTCATGTGAGTAGAAGAATTCCAGTACTGTCTCCAAAACCA  1110

Query  716  -CAGTTGCACCACCAGCACCACCTTCCAGTAGTCAGCTCTGCCGTTACTTCCCTGCTTGTAAGAAGATGGAATG  788
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCAGTTGCACCACCAGCACCACCTTCCAGTAGTCAGCTCTGCCGTTACTTCCCTGCTTGTAAGAAGATGGAATG  1184

Query  789  TCCCTTCTATCATCCAAAACATTGTAGGTTTAACACTCAATGTACAAGACCGGACTGCACATTCTACCATCCCA  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCCCTTCTATCATCCAAAACATTGTAGGTTTAACACTCAATGTACAAGACCGGACTGCACATTCTACCATCCCA  1258

Query  863  CCATTAATGTCCCACCACGACATGCCTTGAAATGGATTCGACCTCAAACCAGCGAA  918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCATTAATGTCCCACCACGACATGCCTTGAAATGGATTCGACCTCAAACCAGCGAA  1314