Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470627
• Subject: NM_029705.3
• Aligned Length: 1113
• Identities: 935
• Gaps: 51

Alignment

Query    1  ATGGAGTCCATCTTCCACGAGAAACAAGAAGGCTCACTTTGTGCTCAACATTGCCTGAATAACTTATTGCAAGG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTCCATCTTCCACGAGAAACAAGAAGGCTCACTTTGTGCTCAGCATTGCCTGAATAACCTATTGCAAGG  74

Query   75  AGAATATTTTAGCCCCGTGGAATTATCCTCAATTGCACATCAGCTGGATGAGGAGGAGAGGATGAGAATGGCAG  148
            |||.|||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct   75  AGAGTATTTTAGCCCTGTGGAGCTATCCTCAATTGCACACCAGCTGGATGAAGAGGAGAGGCTGAGAATGGCAG  148

Query  149  AAGGAGGAGTTACTAGTGAAGATTATCGCACGTTTTTACAGCAGCCTTCTGGAAATATGGATGACAGTGGTTTT  222
            ||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  149  AAGGGGGAGTCACTAGTGAAGACTACCGCACATTTTTACAGCAGCCTTCTGGAAATATGGATGACAGCGGCTTT  222

Query  223  TTCTCTATTCAGGTTATAAGCAATGCCTTGAAAGTTTGGGGTTTAGAACTAATCCTGTTCAACAGTCCAGAGTA  296
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCTCTATTCAAGTTATAAGCAATGCTTTGAAAGTTTGGGGTTTAGAACTAATCCTGTTCAACAGTCCAGAGTA  296

Query  297  TCAGAGGCTCAGGATCGATCCTATAAATGAAAGATCATTTATATGCAATTATAAGGAACACTGGTTTACAGTTA  370
            .|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGAGGCTCAGAATTGATCCTATAAACGAAAGATCCTTTATATGCAATTATAAAGAACACTGGTTTACAGTTA  370

Query  371  GAAAATTAGGAAAACAGTGGTTTAACTTGAATTCTCTCTTGACGGGTCCAGAATTAATATCAGATACATATCTT  444
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  371  GAAAATTAGGCAAGCAGTGGTTTAACTTGAATTCTCTGTTGACGGGTCCAGAATTAATATCAGATACATACCTC  444

Query  445  GCACTTTTCTTGGCTCAATTACAACAGGAAGGTTATTCTATATTTGTCGTTAAGGGTGATCTGCCAGATTGCGA  518
            |||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  GCACTATTCTTGGCTCAATTACAGCAAGAAGGTTATTCTATATTTGTTGTTAAGGGTGATCTGCCAGATTGTGA  518

Query  519  AGCTGACCAACTCCTGCAGATGATTAGGGTCCAACAGATGCATCGACCAAAACTTATTGGAGAAGAATTAGCAC  592
            ||||||||||||..||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||
Sbjct  519  AGCTGACCAACTTTTGCAGATGATCAAGGTCCAACAGATGCATCGACCAAAACTTATTGGAGAGGAACTTGCAC  592

Query  593  AACTAAAAGAGCAAAGAGTCCATAAAACAGACCTGGAACGAGTGTTAGAAGCAAATGATGGCTCAGGAATGTTA  666
            |.||.||||||||.||.|.||..|||.||||||||||.||.||.|||||||||..||||||.||.||.||.||.
Sbjct  593  ATCTGAAAGAGCAGAGTGCCCTCAAAGCAGACCTGGAGCGCGTCTTAGAAGCAGCTGATGGGTCGGGCATATTT  666

Query  667  GACGAAGATGAGGAGGATTTGCAGAGGGCTCTGGCACTAAGTCGCCAAGAAATTGACATGGAAGATGAGGAAGC  740
            ||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||..||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  667  GATGAAGATGAGGATGATTTACAGAGGGCTCTAGCCATAAGTCGCCAGGAAATCGACATGGAGGATGAAGAAGC  740

Query  741  AGATCTCCGCAGGGCTATTCAGCTAAGTATGCAAGGTAGTTCCAGAAACATATCTCAAGATATGACACAGACAT  814
            .||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||..||.|.|.||.|||...|||||||||
Sbjct  741  TGATCTCCGCAGGGCCATTCAGCTCAGTATGCAAGGTAGTTCCAGAAGTATGTGTGAAAATAGTCCACAGACAT  814

Query  815  CAGGTACAAATCTTACTTCAGAAGAGCTTCGGAAGAGACGAGAAGCCTACTTTGAAAAACAGCAGCAAAAGCAG  888
            ||.||.||.||||..|||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||                 
Sbjct  815  CAAGTCCAGATCTCTCTTCAGAAGAGCTGCGGAGGAGACGAGAAGCCTACTTTGAAA-----------------  871

Query  889  CAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGACCTATCAGGACAGAG  962
                                           ||||.|||||||||||||||.|||..||||.|.|.||||....
Sbjct  872  -------------------------------AGCAACAGCAGCAGCAGCAGGAGGTAGACCGACCTGGACCCCT  914

Query  963  TTCACATCCATGTGAAAGGCCAGCCACCAGTTCAGGAGCACTTGGGAGTGATC---TAGGTGATGCTATGAGTG  1033
            ||||.|||||.|||||||.||..||||.||||||||||.||.|.||||.||.|   .|||.||.|||.||||||
Sbjct  915  TTCATATCCACGTGAAAGACCGACCACAAGTTCAGGAGGACGTAGGAGCGACCAAGGAGGCGACGCTGTGAGTG  988

Query 1034  AAGAAGACATGCTTCAGGCAGCTGTGACCATGTCTTTAGAAACTGTCAGAAATGATTAGAAAACAAAAGGAAAA  1107
            ||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.|.|..|.|.||||.||.||.|||||
Sbjct  989  AAGAGGACATGCTTCGGGCAGCTGTGACCATGTCTTTAGAAACTGCTAAAGACAACTTGAAAGCAGAAAGAAAA  1062

Query 1108  AAA  1110
            |||
Sbjct 1063  AAA  1065