Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470812
- Subject:
- NM_001045530.2
- Aligned Length:
- 1206
- Identities:
- 905
- Gaps:
- 156
Alignment
Query 1 ATGGAT----CG--------------------CTACAACGT-CAC--CAC-CTCC--------------AAGCA 32
|||||| || ||...|||| ||| ||| ||.| ||||.
Sbjct 1 ATGGATGAGCCGTGGTGGGAAGGGCGCGTCGCCTCGGACGTACACTGCACTCTGCGCGAGAAGGAACTGAAGCT 74
Query 33 GCTCTAC--ACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAAACGGAG----------TTT-----CGCTCTTATC 89
|| |.|| .|||| |||..||||...|||||| || ||| ||| |..|||
Sbjct 75 GC-CCACCTTCCGT-GCCCACTCCCCGCTCCTG-----AA---GAGCCGTCGATTCTTTGTAGACATTCT---- 134
Query 90 GCCCAGGCTGAAGTGCAG----TGGCATGATCTCAGCTCAT------TGCAACCT--CCACCTCCCAGGTTCAA 151
|.||..||||| |||| ||.| |||||.||.|.| .|| |||| |||.||.||
Sbjct 135 GACCCTGCTGA---GCAGACACTGCC---ATCTCTGCCCCTCGGCCCGGC-ACCTGGCCATCTACC-------- 193
Query 152 GCAATTCT---CCTGCTTCAGCGCCC----CACC--CCCCACCCACACCGCCCCAAGTAGCTG-AGACT----- 210
|||| || .|||||..|.|| ||.| |.|||| |.|||||.||||| |.|||
Sbjct 194 ----TTCTGGACC-ACTTCATGGACCAGTACAACATCACCAC--------CTCCAAGCAGCTGTATACTGTGGC 254
Query 211 -------------------ACAGGTAAGTTCGAGGATCGGGAAGACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACA 265
.||.|||||||.||.||..|||||||||.|||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 255 TGTCTCCTGCCTCCTGCTGGCAAGTAAGTTTGAAGACAGGGAAGACCGCGTGCCTAAATTGGAGCAGATAAACA 328
Query 266 GCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAACTTCACCCTCACCAAGAAGGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTG 339
..||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||.||.|||||||||
Sbjct 329 ATACAAGGATCCTGAGCAGCCAAAACTTCTCCCTCACCAAGAAGGAGCTGCTGACCACAGAACTTCTGCTCCTG 402
Query 340 GAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCTGCCCACGCCTGCCCACTTCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAG 413
|||||.|||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 403 GAGGCTTTCAGCTGGGACCTTTGCCTGCCCACGCCCGCCCACTTTCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCATCAG 476
Query 414 CCAGAAGGACCACCACTGCCACACCTGGCCCACCACCTGCCCCCGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATG 487
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 CCAGAAGGACCACCACTGCCACGCCTGGCCCACCACCTGCCTCCGAAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATG 550
Query 488 CCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTGCAAGATCACATATTCTACAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCC 561
|.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 551 CTCACTACTTCCTAGAAGTTACCCTGCAAGATCATATATTTTACAAATTCCAGCCTTCCGTGGTTGCTGCAGCC 624
Query 562 TGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCTGCAGCTTTCTCCCTACTGGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTA 635
||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.||||.|||||
Sbjct 625 TGTGTTGGGGCCTCCAGGATCTGCCTTCAGCTGTCTCCCTACTGGACCAGAGACTTGCAGAGGGTCTCGAGCTA 698
Query 636 TTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTATTGAAATCCTGCTGGTAGTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAG 709
.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||..||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 699 CTCCCTAGAGCATCTCAGCACGTGTATCGAAATCCTGCTGGTAGCCTATGACAATGTCCTCAAGGATGCCGTTG 772
Query 710 CCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATGGTGCCCGGCACACCCCCCACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCA 783
|.||||||||||||.|..||||.||||||||.|||.||.|..|..|.|||.|.||||||||||||||.||.||.
Sbjct 773 CAGTCAAGAGCCAGACGCTGGCCATGGTGCCGGGCTCATCATCAGCTCCCGCCCAAGTGCTGTTCCAACCGCCC 846
Query 784 GCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGCG---ACCACCCTGGCACAGTTCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTT 854
.||||||||.|.|||.||||||||.|| ||.||.||.||.||||||||||..||.|.|||||||.|.|||||
Sbjct 847 ACCTACCCGACTCTCAGCCAGCCACCGCCAACAACTCTAGCCCAGTTCCAGAGTCCAGCGCAGGACTTGTGCTT 920
Query 855 GGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACCGTTCAGGGAGCCTGCTCTCGGGGAGTACA--GGCTCATCCCTCCA 926
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||| .|||| ||| ||..||||||||||
Sbjct 921 GGCATATCGGGACTCGTTGCAGGCCCACCGTTCAGGGGGCCTGCTCTC-AGGAG-ACACTGGTCCATCCCTCCA 992
Query 927 CACCCCGTA-CCAACCGCTGCAGCCCTTGGATATGTGTCCCGTGCCCGTCCCTGCATCCCTTAGCATGCATATG 999
|||.||.|| |||||| ||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 993 CACGCCATACCCAACC-CTCCAGCCCTTGGATATGTGTCCTGTGCCCGTCCCTGCATCCCTTAGCATGCAGATG 1065
Query 1000 GCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGCCACCACCTATGGAAGCAGCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTT 1073
|||||.||||||||.||||||||||||||..|..||.||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1066 GCCATAGCAGCTGAACCCAGGCACTGCCTTACGGCCTCCTACGGAAGCAGCTACTTCAGCGGCAGCCATATGTT 1139
Query 1074 CCCCACCGGCTGCTTTGACAGA 1095
|||..|.|||||.||.|||||.
Sbjct 1140 CCCTGCAGGCTGTTTCGACAGC 1161