Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470812
• Subject: XM_011534647.3
• Aligned Length: 1100
• Identities: 960
• Gaps: 118

Alignment

Query    1  ATGGATCG---CTACAACGTCACCACCTCCAAGCAGCTCTACACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAAA  71
            |||..|.|   ||||...|           .||||||      |.||||               ||.||.|   
Sbjct    1  ATGTGTTGTATCTACTGTG-----------GAGCAGC------CTGTGG---------------TGGTTAC---  39

Query   72  CGGAGTTTCGCTCTTATCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCACCTCCCAG  145
                  |||   ||||||.|||   ||.|   |||   ||||||   .||   ||.|.||           |.|
Sbjct   40  ------TTC---CTTATCTCCC---CTAA---GCA---GCATGA---GAG---ATGGGAA-----------CTG  78

Query  146  GTTC--AAGCAATTCTCCTGCTTCAGCGCCCCACCCCCCACCCACACCGCCCCAAGTAGCTGAGACTACAGGTA  217
            |.||  |.|||.||                                         |.|||||.||  .||||||
Sbjct   79  GGTCAGAGGCACTT-----------------------------------------GCAGCTGGGA--GCAGGTA  109

Query  218  AGTTCGAGGATCGGGAAGACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAAC  291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  110  AGTTCGAGGATCGGGAAGACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAAC  183

Query  292  TTCACCCTCACCAAGAAGGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCT  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  184  TTCACCCTCACCAAGAAGGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCT  257

Query  366  GCCCACGCCTGCCCACTTCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCT  439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  258  GCCCACGCCTGCCCACTTCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCT  331

Query  440  GGCCCACCACCTGCCCCCGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTG  513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  332  GGCCCACCACCTGCCCCCGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTG  405

Query  514  CAAGATCACATATTCTACAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCT  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  406  CAAGATCACATATTCTACAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCT  479

Query  588  GCAGCTTTCTCCCTACTGGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTA  661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480  GCAGCTTTCTCCCTACTGGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTA  553

Query  662  TTGAAATCCTGCTGGTAGTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATG  735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  554  TTGAAATCCTGCTGGTAGTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATG  627

Query  736  GTGCCCGGCACACCCCCCACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGC  809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  628  GTGCCCGGCACACCCCCCACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGC  701

Query  810  GACCACCCTGGCACAGTTCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACC  883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  702  GACCACCCTGGCACAGTTCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACC  775

Query  884  GTTCAGGGAGCCTGCTCTCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGAT  957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  776  GTTCAGGGAGCCTGCTCTCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGAT  849

Query  958  ATGTGTCCCGTGCCCGTCCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGC  1031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  850  ATGTGTCCCGTGCCCGTCCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGC  923

Query 1032  CACCACCTATGGAAGCAGCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  924  CACCACCTATGGAAGCAGCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA  987