Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470842
• Subject: XM_006722611.2
• Aligned Length: 1272
• Identities: 962
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  ATGGCCTCAGCCTGCCCAGGCTCTGATTTCACGTCTATCCATTCAGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCT--TGGA  72
            |||     ||             |||.|.||.|  .|.|||   || ||.|.|.||||||   |||||  ||||
Sbjct    1  ATG-----AG-------------TGACTCCAAG--GAACCA---AG-GGTGCAGCAGCTG---GGCCTCCTGGA  47

Query   73  -----------------------------TTCCGACAGAC-------TCGAG--GAT--------ACAAGAG--  98
                                         ||||.|.||||       ||.||  |||        |||||||  
Sbjct   48  AGATCCAACAACCAGTGGCATCAGACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCAGATACATGGCCACAAGAGCT  121

Query   99  -----------CTTAGC---------------------------------------------------------  104
                       |||.||                                                         
Sbjct  122  CTACAGGGTGTCTTGGCCATGGCGCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCATGCTCTTGGCTGGGGTCCTGGTG  195

Query  105  --------------AGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAAGACGCGATCTACCA  164
                          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||.||||||||
Sbjct  196  GCCATCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTACCA  269

Query  165  GAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGC  238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  GAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGC  343

Query  239  TGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACC  312
            |||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  TGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACC  417

Query  313  CGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTGGCT  386
            ||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  418  CGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCT  491

Query  387  GAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGATGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACTCGGCTGAAGG  460
            |||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  492  GAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGG  565

Query  461  CTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCA  534
            ||||||||||||||.|.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||...|||||||||||||
Sbjct  566  CTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCA  639

Query  535  GTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGG  608
            |||||||||.|.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  640  GTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGG  713

Query  609  TGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGAACGCC  682
            ||||.|.|||||..|.||.|||||||||.|.|||||.||.||.||||||.|..|||||.|||||.|.|||||||
Sbjct  714  TGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGACTGCATTTGAACGCC  787

Query  683  TGTGCCACCCCTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAAC  756
            ||||||.||.|||||||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  TGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAAC  861

Query  757  TGGCACGACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGTGCTGAGGAGCAGAA  830
            ||||||||||||.|||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  862  TGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAA  935

Query  831  CTTCCTACAGCTGCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTTCAGATCTAAATCAGGAAGGCA  904
            ||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  936  CTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCA  1009

Query  905  CGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTTGCCCAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAGGAGAGCCCAACAAC  978
            ||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|||.||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1010  CGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAAT  1083

Query  979  GTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAATGGCTGGAACGACGACAAATGTAATCTTGCCAAATTCTG  1052
            ...|||.|.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.|...||||.|..|||.|||.|.|||
Sbjct 1084  AGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTG  1157

Query 1053  GATCTGCAAAAAGTCCGCAGCCTCCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGCCCCTGCCACCCCAA  1126
            |||||||||||||.||||||   ||||||.|||.||.|||                                  
Sbjct 1158  GATCTGCAAAAAGCCCGCAG---CCTGCTTCAGAGACGAA----------------------------------  1194

Query 1127  ACCCCCCTCCTGCG  1140
                          
Sbjct 1195  --------------  1194