Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470842
• Subject: XM_006722614.3
• Aligned Length: 1154
• Identities: 918
• Gaps: 139

Alignment

Query    1  ATGGCCTCAGCCTGCCCAGGCTCTGATTTCACGTCTATCCATTCAGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCTTGGATT  74
                                                                                   || 
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------------AT-  2

Query   75  CCGACAGACT-CGAGGATACAAGAGCTTAGCA-------------GTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCA  134
              ||..|||| |.||||..||||.|...||||             |||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct    3  --GAGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCCTAAGTCA  74

Query  135  GGAACAATCCAGGCAAGACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGA  208
            ||||||||||..|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGA  148

Query  209  AATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCT  282
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.
Sbjct  149  AATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCC  222

Query  283  AAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCT  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||
Sbjct  223  AAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCT  296

Query  357  GCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGATGCAGG  430
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||.||||||
Sbjct  297  GCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGG  370

Query  431  AGATCTACCAGGAGCTGACTCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATC  504
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct  371  AGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATC  444

Query  505  TACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCA  578
            ||||||||||||||...||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct  445  TACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCA  518

Query  579  GGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGC  652
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||.|.|||||..|.||.|||||||||.|.|||||.||.||.|
Sbjct  519  GGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAAC  592

Query  653  TGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGAACGCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCCAAGGAAAC  726
            |||||.|..|||||.|||||.|.|||||||||||||.||.|||||||..|||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGACCGATTTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAAC  666

Query  727  TGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGGGCCCAGCT  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||.||||||||||
Sbjct  667  TGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCT  740

Query  801  CGTCGTAATCAAAAGTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTTCACCTGGA  874
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.||||||
Sbjct  741  CGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGA  814

Query  875  TGGGACTTTCAGATCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTTGCCCAGCTTCAAG  948
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||.||
Sbjct  815  TGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAG  888

Query  949  CAGTATTGGAACAGAGGAGAGCCCAACAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAATGGCTGGAA  1022
            |.|||.||||||||.|||||.||||||||....|||.|.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  889  CGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAA  962

Query 1023  CGACGACAAATGTAATCTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCCTCCTGCTCCAGGGATGAAGAAC  1096
            ||||.|...||||.|..|||.|||.|.||||||||||||||||.||||||   ||||||.|||.||.|||    
Sbjct  963  CGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAG---CCTGCTTCAGAGACGAA----  1029

Query 1097  AGTTTCTTTCTCCAGCCCCTGCCACCCCAAACCCCCCTCCTGCG  1140
                                                        
Sbjct 1030  --------------------------------------------  1029