Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470849
• Subject: NM_001286194.1
• Aligned Length: 3948
• Identities: 3811
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCGCAGCCGCTGCTGCCAGCGCTTCCTCCTCTGTCTTCGCCGAGCGGGGCTGGTTCCTGCGGCCCGAGCGG  74

Query    1  -------------------------------------------------------------ATGGAGGCCGTGA  13
                                                                         |||||||||||||
Sbjct   75  CGGGGAGTGCAGTGGCCGCCGCCTCTTCCGCCGCCGGGCTCGGGGCCTCCGCAGCGACAACATGGAGGCCGTGA  148

Query   14  AGACCTTCAATAGCGAGTTGTATTCCCTGAATGACTATAAACCACCCATTTCGAAAGCGAAAATGACCCAAATT  87
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGACCTTCAATAGCGAGTTGTATTCCCTGAATGACTATAAACCACCCATTTCGAAAGCGAAAATGACCCAAATT  222

Query   88  ACTAAGGCAGCCATCAAAGCTATTAAGTTCTATAAACATGTGGTACAGAGTGTTGAGAAGTTTATTCAGAAATG  161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTAAGGCAGCCATCAAAGCTATTAAGTTCTATAAACATGTGGTACAGAGTGTTGAGAAGTTTATTCAGAAATG  296

Query  162  TAAACCAGAATACAAAGTACCTGGACTTTATGTTATTGACTCCATTGTGCGACAATCCCGACATCAGTTTGGTC  235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAAACCAGAATACAAAGTACCTGGACTTTATGTTATTGACTCCATTGTGCGACAATCCCGACATCAGTTTGGTC  370

Query  236  AAGAAAAGGATGTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCACTTTCCAGAATTTATATCGTTGCCCT  309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGAAAAGGATGTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCACTTTCCAGAATTTATATCGTTGCCCT  444

Query  310  GGGGATGACAAGAGTAAAATAGTGAGAGTACTAAACTTATGGCAGAAGAATAATGTATTTAAGAGTGAGATTAT  383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGGATGACAAGAGTAAAATAGTGAGAGTACTAAACTTATGGCAGAAGAATAATGTATTTAAGAGTGAGATTAT  518

Query  384  TCAGCCCCTTTTGGATATGGCAGCCGGGATTCCGCCTCCAGTTGTCACACCTGTTTTGGCCAGCACTACCACTG  457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAGCCCCTTTTGGATATGGCAGCCGGGATTCCGCCTCCAGTTGTCACACCTGTTTTGGCCAGCACTACCACTG  592

Query  458  CTATGAGCAATACTCCAGGAACTCCTGTGACACCTGTTACTCCGGCCAATGTGGTCCAAGGCTTACCTGATCCG  531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTATGAGCAATACTCCAGGAACTCCTGTGACACCTGTTACTCCGGCCAATGTGGTCCAAGGCTTACCTGATCCG  666

Query  532  TGGGTATCTCAGATAACAAATACAGATACACTTGCGGCTGTAGCTCAGATCTTGCAAAGTCCTCAAGGCCAGCA  605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGGGTATCTCAGATAACAAATACAGATACACTTGCGGCTGTAGCTCAGATCTTGCAAAGTCCTCAAGGCCAGCA  740

Query  606  GCTTCAACAATTAATACAAACCTTACAGATACAACAACAGAAGCCCCAGCCTTCCATTCTGCAGGCCCTAGATG  679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTTCAACAATTAATACAAACCTTACAGATACAACAACAGAAGCCCCAGCCTTCCATTCTGCAGGCCCTAGATG  814

Query  680  CTGGTCTTGTTGTTCAGTTGCAAGCTCTTACGGCACAACTTACAGCTGCAGCTGCAGCTGCCAACACTCTTACT  753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGGTCTTGTTGTTCAGTTGCAAGCTCTTACGGCACAACTTACAGCTGCAGCTGCAGCTGCCAACACTCTTACT  888

Query  754  CCCTTAGAACAGGGAGTCTCCTTTAACAAGAAGTTGATGGATAGGTTTGATTTTGGGGAAGACTCTGAGCATAG  827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCCTTAGAACAGGGAGTCTCCTTTAACAAGAAGTTGATGGATAGGTTTGATTTTGGGGAAGACTCTGAGCATAG  962

Query  828  TGAAGAACCCAAAAAGGAAATTCCAGCTTCACAACTTTCTCACGTTTCAGAATCTGTGAACATTTCCATTTTTC  901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  963  TGAAGAACCCAAAAAGGAAATTCCAGCTTCACAACTTTCTCACGTTTCAGAATCTGTGAACAATTCCATTTTTC  1036

Query  902  ATCAGATAGCAGAACAACTACAACAGCAAAACCTAGAACATCTCAGACAGCAGCTCTTGGAGCAGCAACAGCCT  975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATCAGATAGCAGAACAACTACAACAGCAAAACCTAGAACATCTCAGACAGCAGCTCTTGGAGCAGCAACAGCCT  1110

Query  976  CAAAAGGCCACTCCTCAGGATAGTCAGGAAGGAACCTTTGGGTCAGAGCATTCAGCGTCACCATCACAAGGGAG  1049
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAAAAGGCCACTCCTCAGGATAGTCAGGAAGGAACCTTTGGGTCAGAGCATTCAGCGTCACCATCACAAGGGAG  1184

Query 1050  TAGTCAGCAGCATTTTCTTGAACCTGAAGTCAATTTGGATGATTCCATAGATATTCAGCAACAGGATATGGATA  1123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAGTCAGCAGCATTTTCTTGAACCTGAAGTCAATTTGGATGATTCCATAGATATTCAGCAACAGGATATGGATA  1258

Query 1124  TAGATGAAGGGCAAGATGGAGTGGAAGAGGAGGTCTTTGAACAAGAAGCTAAGAAAGTGGCGGTTCGCTCAAGA  1197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TAGATGAAGGGCAAGATGGAGTGGAAGAGGAGGTCTTTGAACAAGAAGCTAAGAAAGTGGCGGTTCGCTCAAGA  1332

Query 1198  TCAAGAACACATTCACGATCTCGTTCAAGATCACCAAGAAAACGAAGGTCTAGGTCACGGTCTGGCTCTAGAAA  1271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCAAGAACACATTCACGATCTCGTTCAAGATCACCAAGAAAACGAAGGTCTAGGTCACGGTCTGGCTCTAGAAA  1406

Query 1272  GCGTAAACACAGAAAGCGATCACGCTCCCGCTCAAGAGAAAGAAAGAGGAAATCATCACGGTCGTATTCAAGTG  1345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCGTAAACACAGAAAGCGATCACGCTCCCGCTCAAGAGAAAGAAAGAGGAAATCATCACGGTCGTATTCAAGTG  1480

Query 1346  AAAGGAGAGCCAGAGAAAGGGAGAAAGAACGACAGAAAAAGGGATTACCTCCAATTAGATCTAAAACACTAAGT  1419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAAGGAGAGCCAGAGAAAGGGAGAAAGAACGACAGAAAAAGGGATTACCTCCAATTAGATCTAAAACACTAAGT  1554

Query 1420  GTATGTAGTACTACTCTCTGGGTTGGGCAAGTGGACAAGAAGGCAACACAGCAAGACTTAACCAACCTGTTTGA  1493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTATGTAGTACTACTCTCTGGGTTGGGCAAGTGGACAAGAAGGCAACACAGCAAGACTTAACCAACCTGTTTGA  1628

Query 1494  AGAGTTTGGACAGATTGAATCCATTAATATGATTCCTCCCCGGGGCTGTGCTTATGTCTGCATGGTTCATCGAC  1567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGAGTTTGGACAGATTGAATCCATTAATATGATTCCTCCCCGGGGCTGTGCTTATGTCTGCATGGTTCATCGAC  1702

Query 1568  AAGATGCATTTCGAGCTCTTCAGAAACTCAGTTCTGGATCATATAAAATTGGGTCCAAGGTCATTAAGATCGCT  1641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAGATGCATTTCGAGCTCTTCAGAAACTCAGTTCTGGATCATATAAAATTGGGTCCAAGGTCATTAAGATCGCT  1776

Query 1642  TGGGCTTTAAACAAAGGTGTAAAAACAGAATACAAACAATTCTGGGATGTGGATCTTGGAGTTACATATATACC  1715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGGGCTTTAAACAAAGGTGTAAAAACAGAATACAAACAATTCTGGGATGTGGATCTTGGAGTTACATATATACC  1850

Query 1716  ATGGGAAAAAGTTAAAGTGGATGACTTGGAAGGTTTTGCAGAAGGAGGCATGATTGATCAGGAGACTGTAAATA  1789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATGGGAAAAAGTTAAAGTGGATGACTTGGAAGGTTTTGCAGAAGGAGGCATGATTGATCAGGAGACTGTAAATA  1924

Query 1790  CTGAGTGGGAAACTGTGAAAAGCTCAGAACCTGTTAAAGAGACGGTCCAGACAACTCAGAGCCCAACTCCAGTT  1863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTGAGTGGGAAACTGTGAAAAGCTCAGAACCTGTTAAAGAGACGGTCCAGACAACTCAGAGCCCAACTCCAGTT  1998

Query 1864  GAAAAGGAGACAGTGGTCACAACCCAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTGTTGCTATGTTGCAGATTCCAGTGGC  1937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAAAAGGAGACAGTGGTCACAACCCAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTGTTGCTATGTTGCAGATTCCAGTGGC  2072

Query 1938  GCCAGCCGTGCCTACAGTTAGTTTAGTCCCACCAGCATTTCCTGTGTCGATGCCGGTTCCTCCTCCTGGATTCA  2011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCCAGCCGTGCCTACAGTTAGTTTAGTCCCACCAGCATTTCCTGTGTCGATGCCGGTTCCTCCTCCTGGATTCA  2146

Query 2012  GTCCAATCCCTCCACCTCCTTTTTTAAGAGCAAGTTTTAACCCTTCACAACCACCACCTGGTTTCATGCCGCCT  2085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GTCCAATCCCTCCACCTCCTTTTTTAAGAGCAAGTTTTAACCCTTCACAACCACCACCTGGTTTCATGCCGCCT  2220

Query 2086  CCAGTTCCCCCACCTGTTGTGCCACCCCCTACGATTCCACCAGTAGTACCAACATCTTTAGTGCAGCCGTCATT  2159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCAGTTCCCCCACCTGTTGTGCCACCCCCTACGATTCCACCAGTAGTACCAACATCTTTAGTGCAGCCGTCATT  2294

Query 2160  ATCCATGACACCGGAAACTGTGAAAGATGTTGGATTTGGTAGCCTTGTTATACCAGGCGGTTCTGTTGCCAGCA  2233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  ATCCATGACACCGGAAACTGTGAAAGATGTTGGATTTGGTAGCCTTGTTATACCAGGCGGTTCTGTTGCCAGCA  2368

Query 2234  ATCTTGCTACTTCCGCTCTGCCAGCTGGAAATGTTTTTAATGCTCCAACTAAACAGGCAGAGCCTGAAGAAAAA  2307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ATCTTGCTACTTCCGCTCTGCCAGCTGGAAATGTTTTTAATGCTCCAACTAAACAGGCAGAGCCTGAAGAAAAA  2442

Query 2308  GTACCTCATCTTATAGACCACCAGATTTCTTCTGGTGAAAACACCAGATCAGTGATTCCAAATGATATTTCAAG  2381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GTACCTCATCTTATAGACCACCAGATTTCTTCTGGTGAAAACACCAGATCAGTGATTCCAAATGATATTTCAAG  2516

Query 2382  TAATGCTGCAATTTTAGGAGGACAGCCGCCAAATGTGACAAGCAATTCTGGAATTCTGGGAGTCCAAAGACCAA  2455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TAATGCTGCAATTTTAGGAGGACAGCCGCCAAATGTGACAAGCAATTCTGGAATTCTGGGAGTCCAAAGACCAA  2590

Query 2456  ATGTATCAAGTAATTCTGAAATTCTTGGGGTCCGGCCATCTAATGTTTCCAGTAGTTCTGGGATTATTGCAGCC  2529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ATGTATCAAGTAATTCTGAAATTCTTGGGGTCCGGCCATCTAATGTTTCCAGTAGTTCTGGGATTATTGCAGCC  2664

Query 2530  CAACCACCAAATATTCTAAATAACTCTGGAATATTGGGAATACAGCCACCCAGTGTGTCAAATAGTTCTGGACT  2603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CAACCACCAAATATTCTAAATAACTCTGGAATATTGGGAATACAGCCACCCAGTGTGTCAAATAGTTCTGGACT  2738

Query 2604  TTTGGGAGTGCTACCCCCAAATATACCTAACAATTCTGGACTTGTAGGAGTACAGCCACCAAATGTTCCAAATA  2677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TTTGGGAGTGCTACCCCCAAATATACCTAACAATTCTGGACTTGTAGGAGTACAGCCACCAAATGTTCCAAATA  2812

Query 2678  CTCCTGGACTTCTGGGAACACAGCCACCAGCTGGACCTCAAAACTTACCCCCTTTAAGTATCCCTAATCAAAGG  2751
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CTCCTGGACTTCTGGGAACACAGCCACCAGCTGGACCTCAAAACTTACCCCCTTTAAGTATCCCTAATCAAAGG  2886

Query 2752  ATGCCCACAATGCCAATGTTAGACATTCGTCCGGGACTAATACCACAGGCACCTGGGCCAAGATTCCCTTTAAT  2825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  ATGCCCACAATGCCAATGTTAGACATTCGTCCGGGACTAATACCACAGGCACCTGGGCCAAGATTCCCTTTAAT  2960

Query 2826  ACAGCCTGGAATTCCACCCCAACGGGGAATCCCACCCCCATCGGTACTTGATTCAGCTCTTCATCCACCACCCC  2899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  ACAGCCTGGAATTCCACCCCAACGGGGAATCCCACCCCCATCGGTACTTGATTCAGCTCTTCATCCACCACCCC  3034

Query 2900  GTGGACCTTTTCCTCCAGGAGATATTTTTAGTCAACCAGAAAGACCTTTTTTAGCTCCTGGAAGACAAAGCGTA  2973
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  GTGGACCTTTTCCTCCAGGAGATATTTTTAGTCAACCAGAAAGACCTTTTTTAGCTCCTGGAAGACAAAGCGTA  3108

Query 2974  GACAATGTTACTAACCCAGAAAAAAGGATACCACTTGGGAATGATAACATTCAACAGGAAGGAGATAGAGATTA  3047
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GACAATGTTACTAACCCAGAAAAAAGGATACCACTTGGGAATGATAACATTCAACAGGAAGGAGATAGAGATTA  3182

Query 3048  TCGGTTTCCTCCTATAGAAACCAGGGAAAGCATTAGTAGACCTCCCCCTGTGGATGTTAGAGATGTGGTTGGGC  3121
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  CCGGTTTCCTCCTATAGAAACCAGGGAAAGCATTAGTAGACCTCCCCCTGTGGATGTTAGAGATGTGGTTGGGC  3256

Query 3122  GGCCTATAGATCCAAGAGAAGGTCCTGGACGGCCTCCACTAGATGGTAGGGATCATTTTGGAAGACCTCCTGTA  3195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  GGCCTATAGATCCAAGAGAAGGTCCTGGACGGCCTCCACTAGATGGTAGGGATCATTTTGGAAGACCTCCTGTA  3330

Query 3196  GATATAAGAGAGAATCTTGTGAGGCCAGGTATAGATCATCTTGGTCGAAGAGACCACTTTGGCTTTAATCCAGA  3269
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  GATATAAGAGAGAATCTTGTGAGGCCAGGTATAGATCATCTTGGTCGAAGAGACCACTTTGGCTTTAATCCAGA  3404

Query 3270  GAAGCCCTGGGGGCATAGAGGAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGGGTTCTACCGGTCTATGGTGGTCCAAAAG  3343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  GAAGCCCTGGGGGCATAGAGGAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGGGTTCTACCGGTCTATGGTGGTCCAAAAG  3478

Query 3344  GCTTACATGAAGAAAGAGGTAGATTTCGGTCTGGAAACTATCGATTTGATCCTAGAAGTGGTCCTTGGAACCGA  3417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  GCTTACATGAAGAAAGAGGTAGATTTCGGTCTGGAAACTATCGATTTGATCCTAGAAGTGGTCCTTGGAACCGA  3552

Query 3418  GGATTTGGACAAGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCTGGGAGAGGCAAAGGGATAGGGATGA  3491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  GGATTTGGACAAGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCTGGGAGAGGCAAAGGGATAGGGATGA  3626

Query 3492  CAGAGATTTTGATTTCTGCAGAGAAATGAATGGAAATCGTCTTGGACGAGACAGAATTCAAAACACTTGGGTTC  3565
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627  CAGAGATTTTGATTTCTGCAGAGAAATGAATGGAAATCGTCTTGGACGAGACAGAATTCAAAACACTTGGGTTC  3700

Query 3566  CCCCTCCTCATGCTCGGGTTTTTGATTATTTTGAAGGGGCCACTTCTCAACGAAAAGGTGATAATGTGCCTCAG  3639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701  CCCCTCCTCATGCTCGGGTTTTTGATTATTTTGAAGGGGCCACTTCTCAACGAAAAGGTGATAATGTGCCTCAG  3774

Query 3640  GTTAATGGTGAAAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCACCTATACCAGTACAGAATGATCCTGAACTTTATGA  3713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775  GTTAATGGTGAAAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCACCTATACCAGTACAGAATGATCCTGAACTTTATGA  3848

Query 3714  AAAACTGACATCTTCAAATGAAATAAACAAGGAGAAGAGTGACACAGTTGCTGATATAGAAAGTGAACCAGTGG  3787
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849  AAAACTGACATCTTCAAATGAAATAAACAAGGAGAAGAGTGACACAGTTGCTGATATAGAAAGTGAACCAGTGG  3922

Query 3788  TAGAAAGCACAGAAACTGAGGGGACA  3813
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923  TAGAAAGCACAGAAACTGAGGGGACA  3948