Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471005
• Subject: NM_001012753.2
• Aligned Length: 1376
• Identities: 1035
• Gaps: 216

Alignment

Query    1  ---AT------GGACCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGA  65
               ||      ||||||.|||||.|.|.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGTTTCAGGACCCTGTGGCCTGTGAGGATGTTGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGA  74

Query   66  TATTTCCCAGAGGAAACTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTTTAGGAAAAAGGT  139
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||.||
Sbjct   75  TATTTCGCAGAGGAAACTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTATAGGGAAAAAGT  148

Query  140  GGAAAGACCAGAACATTGAATATGAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGAAAAAGTC  213
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.|||
Sbjct  149  GGAAAGACCAGAACATTGAATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGGGAATGTC  222

Query  214  AATGAAATTAAAGATGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGACTGAACTTCCAGGA  287
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  AATGAAATTAAAGAAGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCAGGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGGA  296

Query  288  GAAGAAAGCTTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGAAAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTT  361
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGAAAGCTTCTCCTGAAGCAAAATCATGTGATAACTTTGTATGTGGAGAAGTTGGCATAGGTAACTCATCTT  370

Query  362  TTAATATGAACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGTAAG  435
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||.|||||||||||.||||
Sbjct  371  TTAATATGAACATCAGAGGTGACATTGGGCACAAGGCATACGAGTATCAGGACTATGCACCAAAGCCATATAAG  444

Query  436  TGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAA  509
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||
Sbjct  445  TGTCAACAACCTAAGAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGAATCACACCGGAGAGAA  518

Query  510  ACCCAATGCTTGTAAAGTATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCACA  583
            ||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||.||||||||||||||
Sbjct  519  ACCCTATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAGGCATTCGAAGACGCATGGTAATGCACA  592

Query  584  GTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAA  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCTGTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAA  666

Query  658  AGAATTCACACTGGAGAGAAACCATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCG  731
            ||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAACAATGTGTTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCG  740

Query  732  AATACATAAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCA  805
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct  741  AATACATGAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGCAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTTCCA  814

Query  806  GATCCTATCGTAG-ACATGAAAGGATTCACA-TGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCAT  877
            |.||.|.|| .|| ||||.||||.|..|||| |||| |.||||.|.|||.|||||||..|||||||.|||.|.|
Sbjct  815  GTTCTTTTC-AAGCACATAAAAGAACCCACACTGGG-GGAAAGCCATATGAATGTAAACAATGTGGCAAATCCT  886

Query  878  TCA---CGTGTCCCCGTTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTATGAATGTAAGC-A  947
            |||   .||||   |.||...|||..|||||||||||.||.|||.||.||.|.||.|.||.||||||| ||| |
Sbjct  887  TCAGTTGGTGT---CATTCCTTTCAAATACATGAAAGAACTCACACTGGGGAGAAGCCCTGTGAATGT-AGCAA  956

Query  948  GTGTGGGAAAGCATTATCC-TCTCTTACAAGTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTAT  1020
            .|||...|||||||  ||| |        ||||                              |.|||.|.|||
Sbjct  957  ATGTAATAAAGCAT--TCCGT--------AGTT------------------------------ACAGATCCTAT  990

Query 1021  GAATGTAAGATATGTGGAAAAGACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATTCACAGTGGAGA  1094
                                   |||                      ||||||.|||..|.|||||..|||||
Sbjct  991  -----------------------CTT----------------------AGACATAAAAGGAGTCACACGGGAGA  1019

Query 1095  GAAACCCTATAAATGTAAGCAGTGTGGTAAAGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATA-TCATGAAAGGACT  1167
            |||.||.|||.||||||||.|.|||.|.|||||.|||.|..||.||||||||||||| || .|||||||||||.
Sbjct 1020  GAAGCCTTATCAATGTAAGGAATGTAGAAAAGCATTCACGTATCCCAGTTCCCTTCG-TAGACATGAAAGGACC  1092

Query 1168  CACACTG-GAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCT-------------CA  1227
            |||.||| || |.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||   ||||   |             ||
Sbjct 1093  CACTCTGCGA-AAAAACCTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATT---ATCT---TATAAGTTTTCAAACA  1159

Query 1228  CACCTTCGAGTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAG  1301
            |||||..||.||            |.|.|||||||.|.|||.||                              
Sbjct 1160  CACCTAAGAATG------------CGCTCTGGAGAAAGACCTTA------------------------------  1191

Query 1302  ATATGTGAATAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACAAACACACA  1345
                                                        
Sbjct 1192  --------------------------------------------  1191