Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471007
• Subject: XM_011238567.1
• Aligned Length: 1467
• Identities: 1279
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGCTGAACTCAATACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGATCTATGCAGTTAGATCAGTTGTTCCCAACAAAAG  74
            ||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGAACTCAACACTCATGTGAACATCAAAGAGAAGATCTACGCAGTTAGATCAGTTGTTCCGAACAAAAG  74

Query   75  CAATAATGAAATAGTCCTGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTGCAAGCCTTTGTGGATG  148
            ||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  CAATAATGAAATCGTGCTGGTACTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTACAGGCCTTTGTGGATG  148

Query  149  GCAGTGCAATTCAAGTTCTAAAAGAATGGAATATGACAGGA---AAGAAGAACAATAAAAGAAAAAGAAGCAAG  219
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||   ||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct  149  GCAGTGCTATTCAAGTTCTTAAAGAATGGAACATGACGGGAAAGAAGAAGAATAATAAAAGGAAGAGAAGCAAA  222

Query  220  TCCAAGCAGCATCAAGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCTGAGGCAGGGCCCCTGCAGCCGCA  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||..||||||||||||||.||
Sbjct  223  TCCAAGCAGCATCAAGGCAACAAAGATGCTAAGGACAAGGTGGAGAGGCCAGAGGTGGGGCCCCTGCAGCCCCA  296

Query  294  GCCACCACAGATTCAAAACGGCCCCATGAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACAGATTCTGCTAACGAAA  367
            |.||||||.|.|.|||||.||.|.|||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||.|.|..||||
Sbjct  297  GGCACCACTGGTACAAAATGGTCACATGAATGGCTGCGAAAAGGACAGCTCATCCCCTGACTCTACCAGAGAAA  370

Query  368  AACCAGCCCTTATCCCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCAAAGGCACTTCGTGGGGTCACA  441
            |||..|||||.|..||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||.|||.|..||||||||||||
Sbjct  371  AACTGGCCCTCACACCACGTGAGAAAAAGATCTCGATACTGGAGGAACCTCCAAGGGCTCAGCGTGGGGTCACA  444

Query  442  GGCCCAAATATTGAGAAATCAGTGAAGGATTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTAGATATCGCGTCATGAT  515
            ||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct  445  GGCCCAAATATTGAGAAATCGGTGAAGGATCTGCAGCGCTGCACTGTTTCTCTGACGAGATACCGCGTCATGAT  518

Query  516  TAAGGAAGAAGTGGATAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCTGCCTTTGCTGAATTACACAACTGCATCATTGACA  589
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGGAAGAAGTGGACAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCAGCATTTGCTGAGCTACACAACTGCATCATTGACA  592

Query  590  AAGAAGTTTCATTAATGGCAGAAATGGATAAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGAAATCCTGACTGCTCGTCAGAAG  663
            |||||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  AAGAAGTTTCACTGATGGCAGAAATGGACAAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGACATCCTGACTGCCCGTCAGAAG  666

Query  664  AAAGCAGAAGAACTAAAGAGACTCACTGACCTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGGGC  737
            ||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  AAAGCAGAGGAGCTGAAGAGACTGACTGACCTAGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGAGC  740

Query  738  AGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAGCGTAAATATGACGAGGAGCTCGGGAAAGCTGCCCGGTTTTCCTGTGACA  811
            .|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct  741  TGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAACGCAAGTATGACGAGGAGCTGGGGAAGGCTGCCCGCTTCTCCTGTGACA  814

Query  812  TCGAACAGCTGAAGGCCCAAATCATGCTCTGCGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAACTATTCCTCAAGAACT  885
            |.|||||.|||||.|||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||
Sbjct  815  TTGAACAACTGAAAGCCCAAATCCTGATCTGTGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAGCTACTCCTCAAGAACT  888

Query  886  CCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAATGCGCACGCAGCAACCTCTGGGAAACAGAGTAACTTTTCCCGAAA  959
            |||||||||||||||||||||||||||||..|.||.||.|.|.|.||.|||||||||.|.||.|||.||||.||
Sbjct  889  CCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAACACTCATGCGGTAGCTTCCGGGAAACAGGGGAATTTTGCCCGGAA  962

Query  960  ATCATCCACTCACAATAAGCCCTCTGAAGGCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGCAGTCTCCCCAGCACCG  1033
            .||||||..||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|.||..|||.|||.|
Sbjct  963  GTCATCCGGTCACAACAAGCCCTCTGAGGGGAAAGCAGCAAACCCCAAAATGGTGAGCGGACTTGCCAACACTG  1036

Query 1034  CCGACCCCTCTCACCAGACCATGCCGGCCAACAAGCAGAATGGATCTTCTAACCAAAGACGGAGATTTAATCCA  1107
            ||||..|.|.|||||||||||||||..|.|||||||||||||||.||||.|.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  CCGATGCGTGTCACCAGACCATGCCCACTAACAAGCAGAATGGACCTTCCAGCCAAAGACGAAGATTTAATCCA  1110

Query 1108  CAGTATCATAACAACAGGCTAAATGGGCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAGCCGAGCCACTGGGAAA  1181
            |||||||   ||||||||||||||||.||.||||||||.|||||..||||.||||||||.||.||..|||..||
Sbjct 1111  CAGTATC---ACAACAGGCTAAATGGTCCAGCCAAGTCACAGGGTGGTGGTAATGAAGCGGATCCCATGGCGAA  1181

Query 1182  GGGCAACAGCCGCCACGAACACAGAAGACAGCCGCACAACGGCTTCCGGCCCAAAAACAAAGGCGGTGCCAAAA  1255
            |.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1182  GAGCAACAGCCGCCATGAACACAGAAGACAGCCACATAATGGTTTCCGTCCCAAAAACAAAGGTGGTGCCAAAA  1255

Query 1256  ATCAAGAGGCTTCCTTGGGGATGAAGACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCCCCGGCGAAGGCAGCAC  1329
            |.||||||||..|||||||||..|||.||||.||||||||..|.||||||||||||.||||.|||||||||||.
Sbjct 1256  ACCAAGAGGCCCCCTTGGGGACAAAGGCCCCAGAGGCCCCCCCACATTCTGAAAAGGCCCGTCGAAGGCAGCAT  1329

Query 1330  GCTGCAGACACCTCGGAGGCCAGGCCCTTCCGGGGTAGTGTCGGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTCTGCCCCAC  1403
            ||||||||||.||..|||||||||||.||||||||||.|||..||||||||||||||||||||||.||.|||.|
Sbjct 1330  GCTGCAGACAACTTAGAGGCCAGGCCTTTCCGGGGTAATGTTAGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTTTGTCCCTC  1403

Query 1404  GAGAATAGAAGTTTCCACAGATGCAGCAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTGGCC  1464
            .|||||||||||||||||.||.||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1404  TAGAATAGAAGTTTCCACGGAGGCCACGGTCCTCTCAGTCCCCGCTGTGACGTTGGTGGCC  1464