Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471027
• Subject: XM_006538292.3
• Aligned Length: 1443
• Identities: 1305
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCGACTCTTTGCCCACCGCCATCTCCAGCTGTTGCCAAGACAGAGATTGCTTTAAGTGGCAAATCACCTTT  74
            |||||||||.|.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||
Sbjct    1  ATGTCGACTATCTGCCCCCCACCATCTCCTGCTGTTGCCAAGACAGAGATTGCTTTAAGTGGTGAATCACCCTT  74

Query   75  ATTAGCAGCTACTTTTGCTTACTGGGACAATATTCTTGGTCCTAGAGTAAGGCACATTTGGGCTCCAAAGACAG  148
            .||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTGGCGGCTACCTTTGCTTACTGGGATAATATTCTTGGTCCTAGAGTAAGGCATATTTGGGCTCCAAAGACAG  148

Query  149  AACAGGTACTTCTCAGTGATGGAGAAATAACTTTTCTTGCCAACCACACTCTAAATGGAGAAATCCTTCGAAAT  222
            |.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACCAAGTGCTTCTCAGTGATGGAGAAATAACTTTTCTTGCCAACCACACTCTAAATGGAGAAATTCTTCGAAAT  222

Query  223  GCAGAGAGTGGTGCTATAGATGTAAAGTTTTTTGTCTTGTCTGAAAAGGGAGTGATTATTGTTTCATTAATCTT  296
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAGAGAGTGGGGCTATAGATGTAAAATTTTTTGTCTTATCTGAAAAAGGGGTAATTATTGTTTCATTAATCTT  296

Query  297  TGATGGAAACTGGAATGGGGATCGCAGCACATATGGACTATCAATTATACTTCCACAGACAGAACTTAGTTTCT  370
            .||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||
Sbjct  297  CGACGGAAACTGGAATGGAGATCGGAGCACTTATGGACTATCAATTATACTGCCGCAGACAGAGCTGAGCTTCT  370

Query  371  ACCTCCCACTTCATAGAGTGTGTGTTGATAGATTAACACATATAATCCGGAAAGGAAGAATATGGATGCATAAG  444
            |||||||||||||.||||||||||||||.||..|||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCTCCCACTTCACAGAGTGTGTGTTGACAGGCTAACACACATTATTCGAAAAGGAAGAATATGGATGCATAAG  444

Query  445  GAAAGACAAGAAAATGTCCAGAAGATTATCTTAGAAGGCACAGAGAGAATGGAAGATCAGGGTCAGAGTATTAT  518
            |||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  GAAAGACAAGAAAATGTCCAGAAAATTGTCTTGGAAGGCACAGAGAGGATGGAAGATCAGGGTCAGAGTATCAT  518

Query  519  TCCAATGCTTACTGGAGAAGTGATTCCTGTAATGGAACTGCTTTCATCTATGAAATCACACAGTGTTCCTGAAG  592
            |||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCCATGCTTACTGGGGAAGTCATTCCTGTAATGGAGCTGCTTGCATCTATGAAATCCCACAGTGTTCCTGAAG  592

Query  593  AAATAGATATAGCTGATACAGTACTCAATGATGATGATATTGGTGACAGCTGTCATGAAGGCTTTCTTCTCAAT  666
            |.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACATTGATATAGCTGATACAGTGCTCAATGATGATGACATTGGTGACAGCTGTCACGAAGGCTTTCTTCTCAAT  666

Query  667  GCCATCAGCTCACACTTGCAAACCTGTGGCTGTTCCGTTGTAGTAGGTAGCAGTGCAGAGAAAGTAAATAAGAT  740
            |||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCATCAGCTCACACCTGCAGACCTGTGGCTGTTCCGTTGTAGTTGGCAGCAGTGCAGAGAAAGTAAATAAGAT  740

Query  741  AGTCAGAACATTATGCCTTTTTCTGACTCCAGCAGAGAGAAAATGCTCCAGGTTATGTGAAGCAGAATCATCAT  814
            |||.|||||..|.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.||.|
Sbjct  741  AGTAAGAACGCTGTGCCTTTTTCTGACACCAGCAGAGAGGAAATGCTCCAGGCTGTGTGAAGCAGAATCGTCCT  814

Query  815  TTAAATATGAGTCAGGGCTCTTTGTACAAGGCCTGCTAAAGGATTCAACTGGAAGCTTTGTGCTGCCTTTCCGG  888
            ||||.||.||.||.||.||||||||.||||||.|||||||||||.||||.||.||.|||||.||.||.||||||
Sbjct  815  TTAAGTACGAATCGGGACTCTTTGTGCAAGGCTTGCTAAAGGATGCAACAGGCAGTTTTGTCCTACCCTTCCGG  888

Query  889  CAAGTCATGTATGCTCCATATCCCACCACACACATAGATGTGGATGTCAATACTGTGAAGCAGATGCCACCCTG  962
            |||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  889  CAAGTTATGTATGCCCCGTACCCCACCACGCACATTGATGTGGATGTCAACACTGTCAAGCAGATGCCACCGTG  962

Query  963  TCATGAACATATTTATAATCAGCGTAGATACATGAGATCCGAGCTGACAGCCTTCTGGAGAGCCACTTCAGAAG  1036
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  963  TCATGAACATATTTATAATCAACGCAGATACATGAGGTCAGAGCTGACAGCCTTCTGGAGGGCAACTTCAGAAG  1036

Query 1037  AAGACATGGCTCAGGATACGATCATCTACACTGACGAAAGCTTTACTCCTGATTTGAATATTTTTCAAGATGTC  1110
            |.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  AGGACATGGCGCAGGACACCATCATCTACACAGATGAGAGCTTCACTCCTGATTTGAATATTTTCCAAGATGTC  1110

Query 1111  TTACACAGAGACACTCTAGTGAAAGCCTTCCTGGATCAGGTCTTTCAGCTGAAACCTGGCTTATCTCTCAGAAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||.||||||.|.||||||||.||
Sbjct 1111  TTACACAGAGACACTCTAGTGAAAGCCTTCCTGGATCAGGTCTTCCATTTGAAGCCTGGCCTGTCTCTCAGGAG  1184

Query 1185  TACTTTCCTTGCACAGTTTCTACTTGTCCTTCACAGAAAAGCCTTGACACTAATAAAATATATAGAAGACGATA  1258
            ||||||||||||||||||.||.||..|.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||
Sbjct 1185  TACTTTCCTTGCACAGTTCCTCCTCATTCTTCACAGAAAAGCCTTGACACTAATCAAGTACATCGAGGATGATA  1258

Query 1259  CGCAGAAGGGAAAAAAGCCCTTTAAATCTCTTCGGAACCTGAAGATAGACCTTGATTTAACAGCAGAGGGCGAT  1332
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGCAGAAGGGGAAAAAGCCCTTTAAGTCTCTTCGGAACCTGAAGATAGATCTTGATTTAACAGCAGAGGGCGAT  1332

Query 1333  CTTAACATAATAATGGCTCTGGCTGAGAAAATTAAACCAGGCCTACACTCTTTTATCTTTGGAAGACCTTTCTA  1406
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  CTTAACATAATAATGGCTCTAGCTGAGAAAATTAAGCCAGGCCTACACTCTTTCATCTTTGGGAGACCTTTCTA  1406

Query 1407  CACTAGTGTGCAAGAACGAGATGTTCTAATGACTTTT  1443
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1407  CACTAGTGTACAAGAACGTGATGTTCTAATGACCTTT  1443