Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471139
• Subject: XM_017001211.2
• Aligned Length: 2190
• Identities: 1929
• Gaps: 258

Alignment

Query    1  ATGGCTGTGTACTGCTATGCGCTCAATAGCCTGGTGATCATGAATAGCGCCAACGAGATGAAGAGCGGCGGCGG  74
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Sbjct    1  ATGGCTGTGTACTGCTATGCGCTCAATAGCCTGGTGATCATGAATAGCGCCAACGAGATGAAGAGCGGCGGCGG  74

Query   75  CCCGGGGCCCAGTGGCAGCGAGACGCCCCCGCCCCCGAGGAGGGCAGTGCTGAGCCCCGGCAGCGTTTTCAGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCGGGGCCCAGTGGCAGCGAGACGCCCCCGCCCCCGAGGAGGGCAGTGCTGAGCCCCGGCAGCGTTTTCAGCC  148

Query  149  CCGGGAGAGGCGCCTCTTTCCTCTTCCCCCCAGCCGAGTCGCTGTCCCCCGAGGAGCCCCGGAGCCCCGGGGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGGGAGAGGCGCCTCTTTCCTCTTCCCCCCAGCCGAGTCGCTGTCCCCCGAGGAGCCCCGGAGCCCCGGGGGC  222

Query  223  TGGCGGAGCGGCCGGCGCAGGCTGAATAGTAGCAGCGGCAGTGGCAGCGGCAGCAGCGGCAGTAGCGTGAGCAG  296
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Sbjct  223  TGGCGGAGCGGCCGGCGCAGGCTGAATAGTAGCAGCGGCAGTGGCAGCGGCAGCAGCGGCAGTAGCGTGAGCAG  296

Query  297  CCCAAGTTGGGCTGGTCGCCTGCGAGGGGACCGGCAGCAGGTGGTGGCAGCCGGTACCCTCTCCCCGCCAGGGC  370
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Sbjct  297  CCCAAGTTGGGCTGGTCGCCTGCGAGGGGACCGGCAGCAGGTGGTGGCAGCCGGTACCCTCTCCCCGCCAGGGC  370

Query  371  CGGAGGAGGCCAAGAGGAAGCTGCGGATCTTGCAGCGCGAGTTGCAGAACGTGCAGGTGAACCAGAAAGTGGGC  444
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Sbjct  371  CGGAGGAGGCCAAGAGGAAGCTGCGGATCTTGCAGCGCGAGTTGCAGAACGTGCAGGTGAACCAGAAAGTGGGC  444

Query  445  ATGTTTGAGGCGCACATCCAGGCACAGAGCTCCGCCATTCAAGCGCCCCGCAGCCCGCGTTTGGGCAGGGCTCA  518
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Sbjct  445  ATGTTTGAGGCGCACATCCAGGCACAGAGCTCCGCCATTCAAGCGCCCCGCAGCCCGCGTTTGGGCAGGGCTCG  518

Query  519  CTCGCCCTCCCCGTGCCCCTTCCGCAGCAGCAGTCAGCCCCCTGGAAGGGTCCTGGTTCAGGGCGCCCGGAGCG  592
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Sbjct  519  CTCGCCCTCCCCGTGCCCCTTCCGCAGCAGCAGTCAGCCCCCTGGAAGGGTCCTGGTTCAGGGCGCCCGGAGCG  592

Query  593  AGGAACGGAGGACAAAGTCCTGGGGGGAGCAATGTCCAGAGACTTCAGGAACCGACTCCGGGAGGAAAGGAGGG  666
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Sbjct  593  AGGAACGGAGGACAAAGTCCTGGGGGGAGCAATGTCCAGAGACTTCAGGAACCGACTCCGGGAGGAAAGGAGGG  666

Query  667  CCCAGCCTATGCTCCTCGCAGGTGAAGAAAGGAATGCCACCTCTTCCCGGCCGGGCTGCCCCTACAGGATCAGA  740
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Sbjct  667  CCCAGCCTATGCTCCTCGCAGGTGAAGAAAGGAATGCCACCTCTTCCCGGCCGGGCTGCCCCTACAGGATCAGA  740

Query  741  GGCTCAGGGTCCATCCGCTTTTGTAAGGATGGAGAAGGGTATCCCTGCCAGTCCCCGCTGTGGCTCACCCACAG  814
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Sbjct  741  GGCTCAGGGTCCATCCGCTTTTGTAAGGATGGAGAAGGGTATCCCTGCCAGTCCCCGCTGTGGCTCACCCACAG  814

Query  815  CTATGGAAATTGACAAAAGGGGCTCTCCTACCCCGGGAACTCGGAGCTGCCTAGCTCCCTCATTGGGGCTGTTC  888
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Sbjct  815  CTATGGAAATTGACAAAAGGGGCTCTCCTACCCCGGGAACTCGGAGCTGCCTAGCTCCCTCATTGGGGCTGTTC  888

Query  889  GGAGCTAGCTTAACGATGGCCACGGAAGTGGCAGCGAGAGTTACATCCACTGGGCCACACCGTCCACAGGATCT  962
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Sbjct  889  GGAGCTAGCTTAACGATGGCCACGGAAGTGGCAGCGAGAGTTACATCCACTGGGCCACACCGTCCACAGGATCT  962

Query  963  TGCCCTCACTGAGCCGTCTGGGAGAGCCCGTGAGCTTGAGGACCTGCAGCCCCCAGAGGCCCTGGTGGAGAGGC  1036
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Sbjct  963  TGCCCTCACTGAGCCGTCTGGGAGAGCCCGTGAGCTTGAGGACCTGCAGCCCCCAGAGGCCCTGGTGGAGAGGC  1036

Query 1037  AGGGGCAGTTTCTGGGCAGTGAGACAAGCCCAGCCCCAGAAAGGGGCGGGCCCCGCGATGGAGAACCCCCTGGG  1110
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Sbjct 1037  AGGGGCAGTTTCTGGGCAGTGAGACAAGCCCAGCCCCAGAAAGGGGCGGGCCCCGCGATGGAGAACCCCCTGGG  1110

Query 1111  AAGATGGGGAAAGGATATCTGCCCTGTGGCATGCCGGGCTCTGGGGAGCCTGAAGTGGGCAAAAGGCCAGAGGA  1184
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Sbjct 1111  AAGATGGGGAAAGGATATCTGCCCTGTGGCATGCCGGGCTCTGGGGAGCCTGAAGTGGGCAAAAGGCCAGAGGA  1184

Query 1185  GACGACTGTGAGCGTGCAAAGCGCAGAGTCCTCTGATGCCCTGAGCTGGTCCAGGCTGCCCAGGGCCCTGGCCT  1258
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Sbjct 1185  GACGACTGTGAGCGTGCAAAGCGCAGAGTCCTCTGATTCCCTGAGCTGGTCCAGGCTGCCCAGGGCCCTGGCCT  1258

Query 1259  CCGTAGGCCCTGAGGAGGCCCGAAGTGGGGCCCCCGTGGGCGGGGGGCGTTGGCAGCTCTCCGACAGAGTGGAG  1332
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Sbjct 1259  CCGTAGGCCCTGAGGAGGCCCGAAGTGGGGCCCCCGTGGGCGGGGGGCGTTGGCAGCTCTCCGACAGAGTGGAG  1332

Query 1333  GGAGGGTCCCCAACGCTGGGCTTGCTTGGGGGCAGCCCCTCAGCACAGCCGGGGACCGGGAATGTGGAGGCGGG  1406
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Sbjct 1333  GGAGGGTCCCCAACGCTGGGCTTGCTTGGGGGCAGCCCCTCAGCACAGCCGGGGACCGGGAATGTGGAGGCGGG  1406

Query 1407  AATTCCTTCTGGCAGAATGCTGGAGCCTTTGCCCTGTTGGGACGCTGCGAAAGATCTGAAAGAACCTCAGTGCC  1480
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Sbjct 1407  AATTCCTTCTGGCAGAATGCTGGAGCCTTTGCCCTGTTGGGACGCTGCGAAAGATCTGAAAGAACCTCAGTGCC  1480

Query 1481  CTCCTGGGGACAGGGTGGGTGTGCAGCCTGGGAACTCCAGGGTTTGGCAGGGCACCATGGAGAAAGCCGGTTTG  1554
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Sbjct 1481  CTCCTGGGGACAGGGTGGGTGTGCAGCCTGGGAACTCCAGGGTTTGGCAGGGCACCATGGAGAAAGCCGGTTTG  1554

Query 1555  GCTTGGACGCGTGGCACAGGGGTGCAATCAGAGGGGACTTGGGAAAGCCAGCGGCAGGACAGTGATGCCCTCCC  1628
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Sbjct 1555  GCTTGGACGCGTGGCACAGGGGTGCAATCAGAGGGGACTTGGGAAAGCCAGCGGCAGGACAGTGATGCCCTCCC  1628

Query 1629  AAGTCCGGAGCTGCTACCCCAAGATCAGGACAAGCCTTTCCTGAGGAAGGCCTGCAGCCCCAGCAACATACCTG  1702
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Sbjct 1629  AAGTCCGGAGCTGCTACCCCAAGATCCGGACAAGCCTTTCCTGAGGAAGGCCTGCAGCCCCAGCAACATACCTG  1702

Query 1703  CTGTCATCATTACAGACATGGGCACCCAGGAGGATGGGGCCTTGGAGGAGACGCAGGGAAGCCCTCGGGGCAAC  1776
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Sbjct 1703  CTGTCATCATTACAGACATGGGCACCCAGGAGGATGGGGCCTTGGAGGAGACGCAGGGAAGCCCTCGGGGCAAC  1776

Query 1777  CTGCCCCTGAGGAAACTGTCCTCTTCCTCGGCCTCCTCCACGGGCTTCTCCTCATCCTACGAAGACTCAGAGGA  1850
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Sbjct 1777  CTGCCCCTGAGGAAACTGTCCTCTTCCTCGGCCTCCTCCACGGGCTTCTCCTCATCCTACGAAGACTCAGAGGA  1850

Query 1851  GGACATCTCCAGTGACCCTGAGCGCACCCTGGACCCCAACTCAGCCTTCCTGCATACCCTGGACCAGCAGAAAC  1924
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Sbjct 1851  GGACATCTCCAGTGACCCTGAGCGCACCCTGGACCCCAACTCAGCCTTCCTGCATACCCTGGACCAGCAGAAAC  1924

Query 1925  CTAGAGTG------------------------------------------------------------------  1932
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Sbjct 1925  CTAGAGTGGTGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATATCGGCTCACTGCAACCTCTG  1998

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 1999  CCTCCCGGATTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCCTTCCGAATAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCATGCCC  2072

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2073  GGATAATTTTTGTATTTTTAGTAGAAATGGGTTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCTATCTCTTGATCTTG  2146

Query 1933  --------------------------------------------  1932
                                                        
Sbjct 2147  TGATACTCCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCG  2190