Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471271
• Subject: XM_006526117.3
• Aligned Length: 735
• Identities: 634
• Gaps: 57

Alignment

Query   1  ATGGCCGAGGACCTCTCTGCGGCCACGTCCTACACCGAAGATGATTTCTACTGCCCCGTCTGTCAGGAGGTGCT  74
           |||.|||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTCCGAGGAACTTTCGGCGGCCACGTCCTACACGGAAGATGATTTCTACTGCCCTGTCTGTCAGGAGGTGCT  74

Query  75  CAAAACGCCCGTGCGGACCACGGCCTGTCAGCACGTTTTCTGTAGAAAATGTTTCCTGACTGCAATGAGGGAAA  148
           |||.|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  75  CAAGACGCCGGTGCGGACCGCGGCCTGTCAGCACGTTTTCTGTAGAAAATGTTTCCTGACTGCAATGAGAGAAA  148

Query 149  GCGGAGCACATTGTCCCCTATGTCGTGGAAATGTGACTAGAAGAGAGAGAGCATGTCCTGAACGGGCCTTAGAC  222
           |.|||..|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 149  GTGGAATACATTGTCCCCTATGTCGTGGAAGTGTGACTAGAAGAGAAAGAGCATGTCCGGAACGGGCCTTAGAT  222

Query 223  CTTGAAAATATAATGAGGAAGTTTTCTGGTAGCTGCAGATGCTGTGCAAAACAGATTAAATTCTATCGCATGAG  296
           |||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CTTGAAAATATCATGAGGAGGTTTTCTGGTAGCTGCAGATGCTGTTCAAAAAAGATTAAATTCTATCGCATGAG  296

Query 297  ACATCATTACAAATCTTGTAAGAAGTATCAGGATGAATATGGTGTTTCTTCTATCATTCCAAACTTTCAGATCT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||.|
Sbjct 297  ACATCATTACAAATCTTGTAAGAAGTATCAGGATGAATATGGTGTTTCTTCTGTCATTCCAAACTTTAAGATTT  370

Query 371  CTCAAGATTCAGTAGGGAACAGCAATAGGAGTGAAACATCCACATCTGATAACACAGAAACTTACCAAGAGAAT  444
           ||||||||||||||.|||.|                                                      
Sbjct 371  CTCAAGATTCAGTAAGGAGC------------------------------------------------------  390

Query 445  ACAAGTTCTTCTGGTCATCCTACTTTTAAGTGTCCCCTGTGTCAAGAATCAAATTTTACCAGACAGCGTTTACT  518
              |||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||.||||||||.||||||||.||||||.|
Sbjct 391  ---AGTTCTTCTGGGCATCCTACCTTTAAGTGTCCCTTATGTCAAGAGTCAAATTTCACCAGACAACGTTTATT  461

Query 519  GGATCACTGTAACAGTAATCACCTATTTCAGATAGTTCCTGTGACATGTCCTATTTGTGTGTCTCTTCCTTGGG  592
           ||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462  GGATCACTGTAATAGTAACCACCTATTTCAGATAGTTCCTGTGACATGTCCTATTTGTGTGTCTCTTCCTTGGG  535

Query 593  GAGATCCTAGCCAGATTACCAGAAATTTCGTTAGTCATCTAAATCAGAGACATCAATTTGATTATGGAGAATTT  666
           |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 536  GAGATCCTAGCCAGATTACTAGAAATTTCGTTAGTCATCTAAATCAAAGACATCAGTTTGATTATGGAGAATTT  609

Query 667  GTGAATCTTCAGCTAGATGAAGAAACCCAATACCAAACTGCTGTTGAAGAATCTTTTCAAGTAAACATC  735
           ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 610  GTGAATCTTCAGCTAGATGAGGAAACCCAATATCAAACTGCTGTGGAAGAGTCTTTTCAAGTAAACATG  678