Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471465
• Subject: NM_001284403.2
• Aligned Length: 843
• Identities: 683
• Gaps: 141

Alignment

Query   1  ATG---AAAGAC----------CAGCATTT-----------ACGAGGTTTCTTCT----------CAGA-----  35
           |||   ..||||          |.||||||           .||||  ||||.||          ||||     
Sbjct   1  ATGGTCCGAGACAGTATGGCTGCTGCATTTCGGCCCTCGAATCGAG--TTCTCCTGCAGGCGCTGCAGATTTTG  72

Query  36  --------------------CTCCACATCATTCA----------------------------------------  49
                               ||||...||..|||                                        
Sbjct  73  GTGTATCCTGGGGTGGGAGGCTCCGGCTCTGTCAGCTGCCGCTGCCCTCTCGGAGCTAAAAGATACCTACTTAC  146

Query  50  --ATATTTTGATGGATATGTTA-------TTTATCAAAGGCAAA--------------TA-------------T  87
             |||.|.||.||   |..|||       ||.|.||||.| |||              ||             |
Sbjct 147  AGATAATGTGGTG---AAATTAAAAGAATTTCAACAAAAG-AAAGTGGCTGTTGCATGTAATCTTTCTGGCACT  216

Query  88  AAAAGTGCTTTGCAAGTATTGATAGAGATGAAAAACCAAGATGTGAAGTTCACCAAAGATACCTATGTTCTTGC  161
           |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217  AAAGGTGCTTTGCAAGTATTGATAGAGATGAAAAACCAAGATGTGAAGTTCACCAAAGATACCTATGTTCTTGC  290

Query 162  TTTTGCAATTTGCTACAAACTGAATAGCCCTGAGTCTTTCAAAATCTGTACTACATTAAGAGAAGAAGCTCTAC  235
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291  TTTTGCAATTTGCTACAAACTGAATAGCCCTGAGTCTTTCAAAATCTGTACTACATTAAGAGAAGAAGCTCTAC  364

Query 236  TCAAAGGAGAAATTCTCTCCAGGAGAGCATCCTGTTTCGCTGTGGCATTAGCTCTGAATCAGAATGAGATGGCA  309
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365  TCAAAGGAGAAATTCTCTCCAGGAGAGCATCCTGTTTCGCTGTGGCATTAGCTCTGAATCAGAATGAGATGGCA  438

Query 310  AAAGCTGTGTCCATTTTTTCTCAAATCATGAATCCAGAAAGCATAGCCTGCATTAATTTAAATATTATAATCCA  383
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439  AAAGCTGTGTCCATTTTTTCTCAAATCATGAATCCAGAAAGCATAGCCTGCATTAATTTAAATATTATAATCCA  512

Query 384  TATCCAGTCAAATATGTTGGAAAACCTGATAAAGACTCTAAAAAATGCTGCAGAAGGAAATTTATCAAAATTTG  457
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513  TATCCAGTCAAATATGTTGGAAAACCTGATAAAGACTCTAAAAAATGCTGCAGAAGGAAATTTATCAAAATTTG  586

Query 458  TGAAAAGACATGTGTTCTCGGAGGAAGTGCTGGCCAAAGTGAGGGAAAAAGTGAAGGATGTGCCTGCCCTTGTG  531
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 587  TGAAAAGACATGTGTTCTCGGAGGAAGTGCTGGCCAAAGTGAGGGAAAAAGTGAAGGATGTGCCTGCCCTTGTG  660

Query 532  GCCAAATTTGATGAGATCTATGGGACACTGCACATCACTGGCCAGGTCACCACTGATTCTTTGGATGCTGTGCT  605
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661  GCCAAATTTGATGAGATCTATGGGACACTGCACATCACTGGCCAGGTCACCACTGATTCTTTGGATGCTGTGCT  734

Query 606  CTGCCACACCCCCAGGGACAGGAAATCTCACACGTTGCTATTAAACAAGAGGATGGTCAGCCGTCGCACCTTCC  679
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735  CTGCCACACCCCCAGGGACAGGAAATCTCACACGTTGCTATTAAACAAGAGGATGGTCAGCCGTCGCACCTTCC  808

Query 680  AGCCACTCAGCCAGTCCCTGTTGGCTGAG  708
           |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809  AGCCACTCAGCCAGTCCCTGTTGGCTGAG  837