Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471554
- Subject:
- NM_001243163.1
- Aligned Length:
- 2149
- Identities:
- 1617
- Gaps:
- 335
Alignment
Query 1 ---------------------------------------ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTTACTGACCCTGATTTACCTCAGGAGTTTGAAAGGATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 74
Query 36 AGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCT 109
..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||
Sbjct 75 GACAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAGGAGGAGAGTGAGAGGCTCCCAGCCT 148
Query 110 TTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACG 183
|||||||||||||.|||
Sbjct 149 TTCACCTTCCCTTACAT--------------------------------------------------------- 165
Query 184 CAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCACAATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTC 257
|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 166 ------------------------------------------------GAAGTCGATGGCAATAAAGTTATGTC 191
Query 258 TTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCT 331
||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 192 TTCATTAGCTCCATACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCGGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCG 265
Query 332 TGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAG 405
||||.||..||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||.||||||||
Sbjct 266 TGTCGAGCGCAGCCCTGGGGACTCCCGAGCGGCGCAAGGGCAGCTTAGCGGATGTGGTGGACACCCTGAAGCAG 339
Query 406 AGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTG 479
|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 340 AGGAAGATGGAAGAGCTGATCAAGAATGAGCCAGAAGACACTCCCAGTATTGAAAAGCTACTCTCCAAGGACTG 413
Query 480 GAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGGCGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGA 553
||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct 414 GAAAGACAAGCTCCTGGCAATGGGATCAGGGAACTTTGGAGAAATAAAAGGGACTCCTGAGAGCCTCGCTGAGA 487
Query 554 AAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAG 627
|.||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||..|||||||||||||||||
Sbjct 488 AGGAGCGGCAGCTCATGGGTATGATCAATCAGCTGACCAGTCTACGGGAGCAACTCCTGGCTGCCCACGATGAG 561
Query 628 CAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGTCAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACA 701
||||||||..|.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 562 CAGAAGAAGTTGGCTGCATCTCAGATAGAGAAACAGCGTCAGCAGATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAGGAGCA 635
Query 702 AATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATCCAGGTTC 775
.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 636 GATCGCGAGGCAACAGCAGCAGCTTCTGCAGCAACAACACAAAATCAACTTGCTTCAGCAACAGATCCAGGTTC 709
Query 776 AAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAGCAA 849
|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 710 AAGGTCAGCTGCCGCCATTGATGATTCCCGTGTTCCCTCCTGACCAGCGGACCCTCGCAGCAGCTGCCCAGCAA 783
Query 850 GGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAAC 923
|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 GGATTCCTCCTTCCTCCTGGTTTCAGCTACAAGGCTGGGTGCAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAAC 857
Query 924 TACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCCAGC 997
.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.| |.|..|| |||||||
Sbjct 858 CACTATGGCAGCTGCTGCTGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAGCTGCAGGA-TGAAGTG--GCCCAGC 928
Query 998 TAGCTG---CAATGCAGGTATCTCCAGGA--------GGGAA-------GC--------------------TGC 1033
.| ||| |.|| |||.||...|||.|| ||.|| || |||
Sbjct 929 CA-CTGAACCTAT-CAGCTAAGCCCAAGACCTCTGATGGCAAATCACCTGCATCACCCACCTCTCCTCACATGC 1000
Query 1034 CAG------GCATA-----------------CCCCAA------------GGCAACCT----TGGTGCTGCTG-- 1066
||| |.||| ||.||| ||||.|.| |.||.||.|||
Sbjct 1001 CAGCTCTGAGAATAAACAGTGGGGCTGGCCCCCTCAAAGCCTCTGTCCCGGCAGCATTAGCTAGTCCTTCTGCA 1074
Query 1067 ------------------TAT----------------CTCCTACCA--GCATTC-------------------- 1084
||| ||...|||| |||.||
Sbjct 1075 AGAGTTAGCACAATAGGCTATTTAAATGACCACGATGCTGTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGCCAGATGAA 1148
Query 1085 ------ACACAGACAAGAGCA-CA----------------------------AACAG-------CCCACCACC- 1115
||.|||.|.|||||| || ||||| |.||.||.|
Sbjct 1149 AGAGCAACTCAGGCGAGAGCAGCAAGCGTTGGACGGGAAGGTGGCCGTGGTGAACAGCATAGGTCTCAGCAACT 1222
Query 1116 ------CAAAAGCAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCTGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAG 1183
||.|| |||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223 GCCGGACAGAA--AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGCCTGACTCAGCAGTTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAG 1294
Query 1184 GAAAATTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCA 1257
|.|||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1295 GGAAATTTAGCCATGGAATGATGGATTTCAATATGAGTGGAGATTCTGACGGAAGCGCTGGAGTCTCAGAGTCA 1368
Query 1258 AGAATTTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGT 1331
||||||||.|||||||||.|.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 AGAATTTACAGGGAATCCAGGGGACGTGGTAGCAACGAGCCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGT 1442
Query 1332 GTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGATAT 1405
||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.
Sbjct 1443 GTGGGCGAAAGATGAACGGAGGAAAATCCTTCAGGCCTTTCCCGACATGCACAATTCCAACATCAGCAAGATAC 1516
Query 1406 TGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCAAG 1479
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1517 TGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACCAACCTAGAGAAACAGCCATACTATGAGGAGCAGGCCCGCCTCAGCAAA 1590
Query 1480 CAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAA 1553
||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1591 CAGCACCTGGAGAAGTACCCGGACTACAAGTACAAGCCTAGGCCAAAGCGCACCTGTCTGGTGGACGGCAAGAA 1664
Query 1554 GCTGCGCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGGGC 1627
.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1665 ACTGCGTATCGGGGAGTACAAGGCCATCATGCGGAACCGGAGGCAGGAAATGCGACAGTACTTCAACGTTGGGC 1738
Query 1628 AACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGTACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCC 1701
|||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||..|.||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1739 AACAAGCACAGATCCCCATCGCGACGGCCGGAGTTGTATACCCCAGCGCCATCGCCATGGCAGGAATGCCGTCC 1812
Query 1702 CCTCACCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACTTA 1775
||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1813 CCTCACCTGCCCTCCGAGCACTCGAGCGTGTCCAGCAGCCCGGAGCCCGGGATGCCCGTGATCCAGAGCACTTA 1886
Query 1776 CGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGATACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGATG 1849
|||.|..||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 1887 CGGCGCCAAGGGAGAGGAGCCCCACATCAAGGAAGAGATCCAGGCTGAGGACATCAACGGAGAGATTTACGAGG 1960
Query 1850 AGTACGACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAAGCC 1923
|||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1961 AGTACGATGAGGAGGAGGAGGACCCGGATGTGGATTATGGGAGTGACAGCGAAAACCACATTGCGGGACAAGCC 2034
Query 1924 AAC 1926
|||
Sbjct 2035 AAC 2037