Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471672
- Subject:
- XM_017005786.1
- Aligned Length:
- 3075
- Identities:
- 2087
- Gaps:
- 984
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGGTTGCCATGGGAACTGCTGGTACTGCAATCATTCATTTTGTGCCTTGCAGATGATTCCACACTGCATGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCCGATTTTTATTCAAGAACCAAGTCCTGTAATGTTCCCTTTGGATTCTGAGGAGAAAAAAGTGAAGCTCAATT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GTGAAGTTAAAGGAAATCCAAAACCTCATATCAGGTGGAAGTTAAATGGAACAGATGTTGACACTGGTATGGAT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TTCCGCTACAGTGTTGTTGAAGGGAGCTTGTTGATCAATAACCCCAATAAAACCCAAGATGCTGGAACGTACCA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GTGCACAGCGACAAACTCGTTTGGAACAATTGTTAGCAGAGAAGCAAAGCTTCAGTTTGCTTATCTTGACAACT 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 TTAAAACAAGAACAAGAAGCACTGTGTCTGTCCGTCGAGGTCAAGGAATGGTGCTACTGTGTGGCCCGCCACCC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CATTCTGGAGAGCTGAGTTATGCCTGGATCTTCAATGAATACCCTTCCTATCAGGATAATCGCCGCTTTGTTTC 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 TCAAGAGACTGGGAATCTGTATATTGCCAAAGTAGAAAAATCAGATGTTGGGAATTATACCTGTGTGGTTACCA 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 ATACCGTGACAAACCACAAGGTCCTGGGGCCACCTACACCACTAATATTGAGAAATGATGGAGTGATGGGTGAA 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 TATGAGCCCAAAATAGAAGTGCAGTTCCCAGAAACAGTTCCGACTGCAAAAGGAGCAACGGTGAAGCTGGAATG 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 CTTTGCTTTAGGAAATCCAGTACCAACTATTATCTGGCGAAGAGCTGATGGAAAGCCAATAGCAAGGAAAGCCA 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 GAAGACACAAGTCAAATGGAATTCTTGAGATCCCTAATTTTCAGCAGGAGGATGCTGGTTTATATGAATGTGTA 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 GCTGAAAATTCCAGAGGGAAAAATGTAGCAAGGGGACAGCTAACTTTCTATGCTCAACCTAATTGGATTCAAAA 962
Query 1 ----------------------ATGGAAGAAAATGTCTTTTGGGAATGTAAAGCAAATGGAAGGCCTAAGCCTA 52
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AATAAATGATATTCACGTGGCCATGGAAGAAAATGTCTTTTGGGAATGTAAAGCAAATGGAAGGCCTAAGCCTA 1036
Query 53 CATACAAGTGGCTAAAAAATGGCGAACCTCTGCTAACTCGGGATAGAATTCAAATTGAGCAAGGAACACTCAAC 126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CATACAAGTGGCTAAAAAATGGCGAACCTCTGCTAACTCGGGATAGAATTCAAATTGAGCAAGGAACACTCAAC 1110
Query 127 ATAACAATAGTGAACCTCTCAGATGCTGGCATGTATCAGTGTTTGGCAGAGAATAAACATGGAGTTATCTTTTC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATAACAATAGTGAACCTCTCAGATGCTGGCATGTATCAGTGTTTGGCAGAGAATAAACATGGAGTTATCTTTTC 1184
Query 201 CAACGCAGAGCTTAGTGTTATAGCTGTAGGTCCAGATTTTTCAAGAACACTCTTGAAAAGAGTAACTCTTGTCA 274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAACGCAGAGCTTAGTGTTATAGCTGTAGGTCCAGATTTTTCAAGAACACTCTTGAAAAGAGTAACTCTTGTCA 1258
Query 275 AAGTGGGAGGTGAAGTTGTCATTGAGTGTAAGCCAAAAGCGTCTCCAAAACCTGTTTACACCTGGAAGAAAGGA 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAGTGGGAGGTGAAGTTGTCATTGAGTGTAAGCCAAAAGCGTCTCCAAAACCTGTTTACACCTGGAAGAAAGGA 1332
Query 349 AGGGATATATTAAAAGAAAATGAAAGAATTACCATTTCTGAAGATGGAAACCTCAGAATCATCAACGTTACTAA 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGGGATATATTAAAAGAAAATGAAAGAATTACCATTTCTGAAGATGGAAACCTCAGAATCATCAACGTTACTAA 1406
Query 423 ATCAGACGCTGGGAGTTATACCTGTATAGCCACTAACCATTTTGGAACTGCTAGCAGTACTGGAAACTTGGTAG 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ATCAGACGCTGGGAGTTATACCTGTATAGCCACTAACCATTTTGGAACTGCTAGCAGTACTGGAAACTTGGTAG 1480
Query 497 TGAAAGATCCAACAAGGGTAATGGTACCCCCTTCCAGTATGGATGTCACTGTTGGAGAGAGTATTGTTTTACCG 570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGAAAGATCCAACAAGGGTAATGGTACCCCCTTCCAGTATGGATGTCACTGTTGGAGAGAGTATTGTTTTACCG 1554
Query 571 TGCCAGGTAACGCATGATCACTCGCTAGACATCGTGTTTACTTGGTCATTTAATGGACACCTGATAGACTTTGA 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGCCAGGTAACGCATGATCACTCGCTAGACATCGTGTTTACTTGGTCATTTAATGGACACCTGATAGACTTTGA 1628
Query 645 CAGAGATGGGGACCACTTTGAAAGAGTTGGAGGGGATTCAGCTGGTGATTTGATGATCCGAAACATCCAACTGA 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAGAGATGGGGACCACTTTGAAAGAGTTGGAGGGGATTCAGCTGGTGATTTGATGATCCGAAACATCCAACTGA 1702
Query 719 AGCATGCTGGGAAATATGTCTGCATGGTCCAAACAAGTGTGGACAGGCTATCTGCTGCTGCAGACCTGATTGTA 792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGCATGCTGGGAAATATGTCTGCATGGTCCAAACAAGTGTGGACAGGCTATCTGCTGCTGCAGACCTGATTGTA 1776
Query 793 AGAGGTCCTCCAGGTCCCCCAGAGGCTGTGACAATAGACGAAATCACAGATACCACTGCTCAGCTCTCCTGGAG 866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGAGGTCCTCCAGGTCCCCCAGAGGCTGTGACAATAGACGAAATCACAGATACCACTGCTCAGCTCTCCTGGAG 1850
Query 867 ACCCGGGCCTGACAATCACAGCCCCATCACCATGTATGTCATTCAAGCCAGGACTCCGTTCTCCGTGGGCTGGC 940
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACCCGGGCCTGACAACCACAGCCCCATCACCATGTATGTCATTCAAGCCAGGACTCCATTCTCCGTGGGCTGGC 1924
Query 941 AAGCAGTCAGTACAGTCCCAGAACTCATTGATGGGAAGACATTCACAGCGACCGTGGTGGGTTTGAACCCTTGG 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AAGCAGTCAGTACAGTCCCAGAACTCATTGATGGGAAGACATTCACAGCGACCGTGGTGGGTTTGAACCCTTGG 1998
Query 1015 GTTGAATATGAATTCCGCACAGTTGCAGCCAACGTGATTGGGATTGGGGAGCCCAGCCGCCCCTCAGAGAAACG 1088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GTTGAATATGAATTCCGCACAGTTGCAGCCAACGTGATTGGGATTGGGGAGCCCAGCCGCCCCTCAGAGAAACG 2072
Query 1089 GAGAACAGAAGAAGCTCTCCCCGAAGTCACACCAGCGAATGTCAGTGGTGGCGGAGGCAGCAAATCTGAACTGG 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GAGAACAGAAGAAGCTCTCCCCGAAGTCACACCAGCGAATGTCAGTGGTGGCGGAGGCAGCAAATCTGAACTGG 2146
Query 1163 TTATAACCTGGGAGACGGTCCCTGAGGAATTACAGAATGGTCGTGGCTTTGGTTATGTGGTGGCCTTCCGGCCC 1236
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TTATAACCTGGGAGACGGTCCCTGAGGAATTACAGAATGGTCGAGGCTTTGGTTATGTGGTGGCCTTCCGGCCC 2220
Query 1237 TACGGTAAAATGATCTGGATGCTGACAGTGCTGGCCTCAGCTGACGCCTCTAGATACGTGTTCAGGAATGAGAG 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TACGGTAAAATGATCTGGATGCTGACAGTGCTGGCCTCAGCTGATGCCTCTAGATACGTGTTCAGGAATGAGAG 2294
Query 1311 CGTGCACCCCTTCTCTCCCTTTGAGGTTAAAGTAGGTGTCTTCAACAACAAAGGAGAAGGCCCTTTCAGTCCCA 1384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CGTGCACCCCTTCTCTCCCTTTGAGGTTAAAGTAGGTGTCTTCAACAACAAAGGAGAAGGCCCTTTCAGTCCCA 2368
Query 1385 CCACGGTGGTGTATTCTGCAGAAGAAGAACCCACCAAACCACCAGCCAGTATCTTTGCCAGAAGTCTTTCTGCC 1458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCACGGTGGTGTATTCTGCAGAAGAAGAACCCACCAAACCACCAGCCAGTATCTTTGCCAGAAGTCTTTCTGCC 2442
Query 1459 ACAGATATTGAAGTTTTCTGGGCCTCCCCACTGGAGAAGAATAGAGGACGAATACAAGGTTATGAGGTTAAATA 1532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ACAGATATTGAAGTTTTCTGGGCCTCCCCACTGGAGAAGAATAGAGGACGAATACAAGGTTATGAGGTTAAATA 2516
Query 1533 TTGGAGACATGAAGACAAAGAAGAAAATGCTAGAAAAATACGAACAGTTGGAAATCAGACATCAACAAAAATCA 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TTGGAGACATGAAGACAAAGAAGAAAATGCTAGAAAAATACGAACAGTTGGAAATCAGACATCAACAAAAATCA 2590
Query 1607 CGAACTTAAAAGGCAGTGTGCTGTATCACTTAGCTGTCAAGGCATATAATTCTGCTGGGACAGGCCCCTCTAGT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CGAACTTAAAAGGCAGTGTGCTGTATCACTTAGCTGTCAAGGCATATAATTCTGCTGGGACAGGCCCCTCTAGT 2664
Query 1681 GCAACAGTCAATGTGACAACCCGAAAGCCACCACCAAGTCAACCCCCCGGAAACATCATATGGAATTCATCAGA 1754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GCAACAGTCAATGTGACAACCCGAAAGCCACCACCAAGTCAACCCCCCGGAAACATCATATGGAATTCATCAGA 2738
Query 1755 CTCCAAAATTATCCTGAATTGGGATCAAGTGAAGGCCCTGGATAATGAGTCGGAAGTAAAAGGATACAAAGTCT 1828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CTCCAAAATTATCCTGAATTGGGATCAAGTGAAGGCCCTGGATAATGAGTCGGAAGTAAAAGGATACAAAGTCT 2812
Query 1829 TGTACAGATGGAACAGACAAAGCAGCACATCTGTCATTGAAACAAATAAAACATCGGTGGAGCTTTCTTTGCCT 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TGTACAGATGGAACAGACAAAGCAGCACATCTGTCATTGAAACAAATAAAACATCGGTGGAGCTTTCTTTGCCT 2886
Query 1903 TTCGATGAAGATTATATAATAGAAATTAAGCCATTCAGCGACGGAGGAGATGGCAGCAGCAGTGAACAAATTCG 1976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TTCGATGAAGATTATATAATAGAAATTAAGCCATTCAGCGACGGAGGAGATGGCAGCAGCAGTGAACAAATTCG 2960
Query 1977 AATTCCAAAGATATCAAATGCCTACGCGAGAGGATCTGGGGCTTCCACTTCGAATGCATGTACGCTGTCAGCCA 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 AATTCCAAAGATATCAAATGCCTACGCGAGAGGATCTGGGGCTTCCACTTCGAATGCATGTACGCTGTCAGCCA 3034
Query 2051 TCAGTACAATAATGATTTCCCTCACAGCTAGGTCCAGTTTA 2091
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TCAGTACAATAATGATTTCCCTCACAGCTAGGTCCAGTTTA 3075
