Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000471857
Subject:
NM_001271168.2
Aligned Length:
1209
Identities:
935
Gaps:
273

Alignment

Query    1  ATGGTCTTCTGTCTGTCGAGCGAGGAGCCGCGCCGCCCGCTGCGAAGCGACATGGTCCACTTCCAGGCCTCGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCTTCTGTCTGTCGAGCGAGGAGCCGCGCCGCCCGCTGCGAAGCGACATGGTCCACTTCCAGGCCTCGGA  74

Query   75  AGTCCAGCAGCTGCTACACAACAAGTTCGTGGTCATCTTGGGGGACTCCATTCAGAGGGCTGTGTACAAGGACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTCCAGCAGCTGCTACACAACAAGTTCGTGGTCATCTTGGGGGACTCCATTCAGAGGGCTGTGTACAAGGACC  148

Query  149  TGGTGCTCTTGCTCCAGAAAGACTCACTGCTCACAGCTGCCCAGCTGAAAGCCAAGTACCTTGAGGATGTTCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGTGCTCTTGCTCCAGAAAGACTCACTGCTCACAGCTGCCCAGCTGAAAGCCAAGTACCTTGAGGATGTTCTG  222

Query  223  GAAGAGCTGACATATGGACCTGCCCCGGACCTGGTGATCATCAACTCCTGCCTCTGGGATCTCTCCAGATATGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGAGCTGACATATGGACCTGCCCCGGACCTGGTGATCATCAACTCCTGCCTCTGGGATCTCTCCAGATATGG  296

Query  297  TCGCTGCTCAATGGAGAGCTACCGGGAGAACCTGGAGCGGGTGTTTGTGCGCATGGACCAAGTATTGCCAGACT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGCTGCTCAATGGAGAGCTACCGGGAGAACCTGGAGCGGGTGTTTGTGCGCATGGACCAAGTATTGCCAGACT  370

Query  371  CCTGCCTGCTGGTGTGGAACATGGCGATGCCCCTCGGGGAACGTATCACTGGGGGTTTCCTCCTGCCAGAGCTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTGCCTGCTGGTGTGGAACATGGCGATGCCCCTCGGGGAACGTATCACTGGGGGTTTCCTCCTGCCAGAGCTC  444

Query  445  CAGCCCCTGGCAGGCTCCCTGCGGCGGGATGTGGTTGAAGGGAACTTCTACAGTGCTACGCTGGCCGGGGACCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCCCCTGGCAGGCTCCCTGCGGCGGGATGTGGTTGAAGGGAACTTCTACAGTGCTACGCTGGCCGGGGACCA  518

Query  519  CTGCTTTGATGTCCTAGACCTCCACTTTCACTTCCGGCATGCAGTACAGCACCGTCATCGGGATGGTGTCCACT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGCTTTGATGTCCTAGACCTCCACTTTCACTTCCGGCATGCAGTACAGCACCGTCATCGGGATGGTGTCCACT  592

Query  593  GGGACCAGCATGTACACCGCCACCTCTCACACCTGCTTCTGA--------------------------------  634
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||                                
Sbjct  593  GGGACCAGCATGCACACCGCCACCTCTCACACCTGCTTCTGACCCATGTGGCTGACGCCTGGGGCGTGGAGCTG  666

Query  635  --------------------------------------------------------------------------  634
                                                                                      
Sbjct  667  CCCAAGCGTGGCTATCCCCCTGACCCGTGGATTGAGGACTGGGCAGAGATGAATCATCCATTCCAGGGAAGCCA  740

Query  635  --------------------------------------------------------------------------  634
                                                                                      
Sbjct  741  TAGGCAGACCCCAGACTTCGGGGAGCACCTGGCCTTGCTCCCACCCCCACCTTCTTCTTTGCCTCCTCCCATGC  814

Query  635  --------------------------------------------------------------------------  634
                                                                                      
Sbjct  815  CTTTTCCCTACCCGCTTCCTCAGCCCTCGCCACCTCCCCTCTTCCCACCCCTGCCCCAGGATACCCCTTTTTTC  888

Query  635  -------------------CCCATGAATTCTTCAACTATAATCCAGTGGAGGACTTCTCGATGCCACCCCACTT  689
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCAGGCCAGCCCTTCCCACCCCATGAATTCTTCAACTATAATCCAGTGGAGGACTTCTCGATGCCACCCCACTT  962

Query  690  AGGATGTGGCCCTGGAGTGAACTTTGTGCCTGGCCCTCTGCCACCTCCAATCCCTGGCCCTAATCCCCATGGTC  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGATGTGGCCCTGGAGTGAACTTTGTGCCTGGCCCTCTGCCACCTCCAATCCCTGGCCCTAATCCCCATGGTC  1036

Query  764  AGCACTGGGGCCCAGTGGTCCACCGGGGGATGCCACGCTATGTTCCTAACAGCCCCTACCATGTGCGGAGAATG  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCACTGGGGCCCAGTGGTCCACCGGGGGATGCCACGCTATGTTCCTAACAGCCCCTACCATGTGCGGAGAATG  1110

Query  838  GGGGGGCCCTGCAGGCAGCGGCTCAGACACTCAGAGAGACTGATCCACACATACAAACTGGACAGACGGCCTCC  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGGGGCCCTGCAGGCAGCGGCTCAGACACTCAGAGAGACTGATCCACACATACAAACTGGACAGACGGCCTCC  1184

Query  912  TGCCCATTCGGGGACATGGCCTGGG  936
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCCATTCGGGGACATGGCCTGGG  1209