Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472018
• Subject: XM_024453521.1
• Aligned Length: 1021
• Identities: 707
• Gaps: 305

Alignment

Query    1  ATGGTCAGGAGAGTTCAGCCGGATCGGAAACAGTTGCCACTGGTCCTACTGAGATTGCTCTGCCTTCTCAGCAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGGACTGCCTGTTCGCAGCGTGGATTTTAACCGAGGCACGGACAACATCACCGTGAGGCAGGGGGACACAGCCA  148
                                             |.|.||||             |||||               
Sbjct    1  ---------------------------------ATGTACGG-------------GAGGC---------------  13

Query  149  TCCTCAGGTGCGTTGTAGAA---GACAAGAACTCAAAGGTGGCCTGGTTGAACCGTTCTGGCATCATT---TTT  216
                           ||.||   ||||||        ||.||.|       ||||        |||||   .||
Sbjct   14  ---------------TAAAACCTGACAAG--------GGAGGTC-------ACCG--------TCATTCACCTT  49

Query  217  GCTGGACATGACAAGTGGTCTCTGGACCCACGGGTTGAGCTGGAGAAACGCCATTCTCTGGAATACAGCCTCCG  290
            ||||               |||                 ||||      ||              |.||||   
Sbjct   50  GCTG---------------CTC-----------------CTGG------GC--------------CGGCCT---  68

Query  291  AATCCAGAAGGTGGATGTCTATGATGAGGGTTCCTACACTTGCTCAGTTCAGACACAGCATGAGCCCAAGACCT  364
                                 ||||||                    ||||               |||   ||
Sbjct   69  ---------------------TGATGA--------------------TTCA---------------CAA---CT  83

Query  365  CCCAAGTTTA-CTTGATCGTACAAGTCCCACCAAAGATCTCCAATATCTCCTCGGATGTCACTGTGAATGAGGG  437
                  |||| ||     ||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   84  ------TTTAGCT-----GTGCCAGTCCCACCAAAGATCTCCAATATCTCCTCGGATGTCACTGTGAATGAGGG  146

Query  438  CAGCAACGTGACTCTGGTCTGCATGGCCAATGGCCGTCCTGAACCTGTTATCACCTGGAGACACCTTACACCAA  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  CAGCAACGTGACTCTGGTCTGCATGGCCAATGGCCGTCCTGAACCTGTTATCACCTGGAGACACCTTACACCAA  220

Query  512  CTGGAAGGGAATTTGAAGGAGAAGAAGAATATCTGGAGATCCTTGGCATCACCAGGGAGCAGTCAGGCAAATAT  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  CTGGAAGGGAATTTGAAGGAGAAGAAGAATATCTGGAGATCCTTGGCATCACCAGGGAGCAGTCAGGCAAATAT  294

Query  586  GAGTGCAAAGCTGCCAACGAGGTCTCCTCGGCGGATGTCAAACAAGTCAAGGTCACTGTGAACTATCCTCCCAC  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  GAGTGCAAAGCTGCCAACGAGGTCTCCTCGGCGGATGTCAAACAAGTCAAGGTCACTGTGAACTATCCTCCCAC  368

Query  660  TATCACAGAATCCAAGAGCAATGAAGCCACCACAGGACGACAAGCTTCACTCAAATGTGAGGCCTCGGCAGTGC  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  TATCACAGAATCCAAGAGCAATGAAGCCACCACAGGACGACAAGCTTCACTCAAATGTGAGGCCTCGGCAGTGC  442

Query  734  CTGCACCTGACTTTGAGTGGTACCGGGATGACACTAGGATAAATAGTGCCAATGGCCTTGAGATTAAGAGCACG  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  CTGCACCTGACTTTGAGTGGTACCGGGATGACACTAGGATAAATAGTGCCAATGGCCTTGAGATTAAGAGCACG  516

Query  808  GAGGGCCAGTCTTCCCTGACGGTGACCAACGTCACTGAGGAGCACTACGGCAACTACACCTGTGTGGCTGCCAA  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GAGGGCCAGTCTTCCCTGACGGTGACCAACGTCACTGAGGAGCACTACGGCAACTACACCTGTGTGGCTGCCAA  590

Query  882  CAAGCTGGGGGTCACCAATGCCAGCCTAGTCCTTTTCAGACCTGGGTCGGTGAGAGGAATAAATGGATCCATCA  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  CAAGCTGGGGGTCACCAATGCCAGCCTAGTCCTTTTCAGACCTGGGTCGGTGAGAGGAATAAATGGATCCATCA  664

Query  956  GTCTGGCCGTACCACTGTGGCTGCTGGCAGCATCTCTGCTCTGCCTTCTCAGCAAATGT  1014
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  GTCTGGCCGTACCACTGTGGCTGCTGGCAGCATCTCTGCTCTGCCTTCTCAGCAAATGT  723