Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472100
• Subject: XM_017027233.1
• Aligned Length: 1807
• Identities: 1293
• Gaps: 323

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148
                                              |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||
Sbjct    1  ----------------------------------ATGCTAGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTAGGGAATC  40

Query  149  AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAA-GAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAG  221
            ||||.||||||||||||||||.|||||| ||.|||||| |||||||||||||.||||..||||.|||.||||||
Sbjct   41  AACCATTCCACCAAGATACTTTCCACTT-CTTAGGGAAGGAAAAGTTTTGGAAGATGAAGACAACAAGCCAAAG  113

Query  222  AGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGT  295
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  114  AGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAATTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGAGTGGT  187

Query  296  CCTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAG  369
            ||||.||||||||.||||||||||||||||..|||.|||||||||||||..||||.||.|..||.|.|||||||
Sbjct  188  CCTGTCAGCAAATATGGGAACAAATTGCAAGTGACCTAACCAGGTCTCAAAACTCCATAAGGAACAGCTCTCAG  261

Query  370  TTCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCA--TACAGGACAGAAACCT  441
            |||||..||.|.|||||||||||||.||||.||||.|||.|||||.|.|.||.|||  |.||  ||||||||||
Sbjct  262  TTCTTCAAAGAAGGTGATGTCCCCTGCCAGATTGAGGCAAGACTATCTATAAGTCACGTGCA--ACAGAAACCT  333

Query  442  TCCCAGGGTGG----GAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACT  511
            |.||   ||.|    ||| ||||||||||||||||||||||||.|..||||||||||||.|||.||.|.|.|||
Sbjct  334  TACC---GTTGTAATGAA-TGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTTCTGTCTTTGATCTTCATCAACAATCACACT  403

Query  512  CAGAAGAGAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAG  585
            |||.||||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|.||||.||||||.||||||||
Sbjct  404  CAGGAGAGAAATCTCATACATGTGGTGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACAGCCCAGCCCTTCATATTCATCAG  477

Query  586  AGAGTCCACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCA  659
            ||||||||..|||||||.|||..||.||.|||||||||||||||.||||||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct  478  AGAGTCCATATGGGAGAAAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAATCAGAGCTCACATCTGCA  551

Query  660  AACTCATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGAT  733
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||..|.||||||
Sbjct  552  AACTCATCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGGGCAATGTGGGAAAGGCTTCCATAGTAGAT  625

Query  734  CAGCACTTAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTC  807
            |||||||||||||||||...|||||.||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct  626  CAGCACTTAATGTTCATTGCAAATTGCACACAGGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGGAATGTGGGAAAGCCTTC  699

Query  808  ATTCATGATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGG  881
            |||||||||||.||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  700  ATTCATGATTCACAGCTTCAAGAACATCAGAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTGG  773

Query  882  TAAGACCTTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTG  955
            |||||.||||..|.||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  774  TAAGAGCTTCCGTGTTAGATCAAGACTTAATAGGCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTCAGATGTG  847

Query  956  ATACATGTGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCG  1029
            |||||||||..||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||.||||||.||.
Sbjct  848  ATACATGTGGCAAGAACTTTCGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATTCCATGGTCCACATAGAAGAGAAGCCA  921

Query 1030  TACAGATGTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGG  1103
            ||||.|||||||||.||||||||||||||.|||.||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  922  TACAAATGTGAGCAATGTGGAAAAGGCTTCATTTGTAGGCGAGATTTTTGTAAGCATCAGATGGTCCACACAGG  995

Query 1104  AGAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAG  1177
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||
Sbjct  996  AGAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGACCTTCAGATGGTCCTCATGTCTTTTGAACCATCAGCAAG  1069

Query 1178  TCCACAGTGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCC  1251
            |||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||
Sbjct 1070  TCCACAGTGGACAAAAATCCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACGACGATCTTCC  1143

Query 1252  CATCAGAGATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAA  1325
            ||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||.||||...|..|.|||..|
Sbjct 1144  CATCAGAGATCCCACAATGGAGAAAAGCCATATAACTGTGAGGAGTGTGGTAAGGACTATAAAAGGAGGTTGGA  1217

Query 1326  TCTTGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCC  1399
            ||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||.||.
Sbjct 1218  TCTTGAGTTTCACCAGAGGGTCCACACGGGTGAGAGACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGCAAGAGCTTTGGCT  1291

Query 1400  GGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAG  1473
            |||||||..||.|||||||.|||.|||||||||||.|...|.|||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1292  GGGCCTCCTGTCTTTTGAAACATCAGAGACTCCACAGTGGGGAAAAACCTTTCAAATGTGAAGAGTGTGGAAAG  1365

Query 1474  AGGCTT-------GTACACAGGA---CATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCA  1537
            ||..||       ||.||||  |   |||.|        |||.|.||.|..|.|||.|||.|||||.|.||.||
Sbjct 1366  AGATTTACTCAGAGTTCACA--ACTTCATTC--------CCATCAGACATGCCATACTGGAGAAAAGCTATACA  1429

Query 1538  AATGTGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGA----------------------------  1583
            ||||||||.|.||||.||...|.|||||.||....||.|||||.||                            
Sbjct 1430  AATGTGAGCAGTGTGAGAAGGGGTACAACAGTAAATTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACGGGGGAGAG  1503

Query 1584  ------TATACTTTTA-----------------------------TCAT-TATTTCTAAATGACACA-------  1614
                  ||||.||.||                             |||| |.|||     |||.|||       
Sbjct 1504  CGACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGAAAGAGCTTTGGCTGGGCTTCATGTCTTT-----TGAAACATCAGAGA  1572

Query 1615  --------------------------------------------------------------------------  1614
                                                                                      
Sbjct 1573  CTCCACAGTGGAGAAAAGCCATTGAAATCTGGAGTGTGGGAAGAGATCTACTCAGAATTCACAGCTTCATTTAC  1646

Query 1615  -------------------------------  1614
                                           
Sbjct 1647  ATCAGTAAGTCTATGTGGGAGAAAAGCCATA  1677