Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472148
- Subject:
- XM_011530108.2
- Aligned Length:
- 1269
- Identities:
- 1155
- Gaps:
- 114
Alignment
Query 1 ATGGCAGGGAAAGTAAAATGGGTCACTGATATCGAGAAGTCAGTGCTGATCAATAACTTTGAAAAGAGAGGATG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGTCCAAGTGACAGAAAACGAGGACTGGAATTTTTACTGGATGAGTGTGCAAACCATCCGAAATGTGTTCAGCG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------ATGAGTGTGCAAACCATCCGAAATGTGTTCAGCG 34
Query 149 TTGAAGCTGGATATCGGCTCTCAGATGACCAAATAGTCAACCATTTTCCAAACCACTATGAACTGACCCGGAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 35 TTGAAGCTGGATATCGGCTCTCAGATGACCAAATAGTCAACCATTTTCCAAACCACTATGAACTGACCCGGAAG 108
Query 223 GACCTGATGGTGAAGAACATCAAAAGATACAGGAAGGAGCTGGAGAAAGAAGGGAGTCCTCTGGCAGAAAAAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 GACCTGATGGTGAAGAACATCAAAAGATACAGGAAGGAGCTGGAGAAAGAAGGGAGTCCTCTGGCAGAAAAAGA 182
Query 297 TGAAAATGGAAAATACCTCTATCTGGACTTTGTTCCAGTCACCTATATGCTGCCCGCTGACTACAACCTGTTTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 TGAAAATGGAAAATACCTCTATCTGGACTTTGTTCCAGTCACCTATATGCTGCCCGCTGACTACAACCTGTTTG 256
Query 371 TAGAGGAGTTCCGGAAGAGCCCGTCCAGCACCTGGATCATGAAGCCTTGTGGCAAGGCCCAGGGAAAGGGCATC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 TAGAGGAGTTCCGGAAGAGCCCGTCCAGCACCTGGATCATGAAGCCTTGTGGCAAGGCCCAGGGAAAGGGCATC 330
Query 445 TTCCTTATCAACAAGCTCTCACAGATCAAAAAGTGGTCCCGGGACAGCAAGACATCTTCGTTTGTGTCTCAATC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331 TTCCTTATCAACAAGCTCTCACAGATCAAAAAGTGGTCCCGGGACAGCAAGACATCTTCGTTTGTGTCTCAATC 404
Query 519 TAATAAGGAAGCCTACGTGATCTCTCTCTATATTAACAACCCGTTACTAATTGGCGGGAGGAAGTTCGACCTGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405 TAATAAGGAAGCCTACGTGATCTCTCTCTATATTAACAACCCGTTACTAATTGGCGGGAGGAAGTTCGACCTGC 478
Query 593 GCTTGTACGTTCTGGTGTCCACGTACCGTCCACTGCGCTGTTACATGTACAAGCTTGGGTTTTGCCGGTTCTGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 GCTTGTACGTTCTGGTGTCCACGTACCGTCCACTGCGCTGTTACATGTACAAGCTTGGGTTTTGCCGGTTCTGC 552
Query 667 ACAGTGAAATACACCCCGAGTACCAGTGAGCTGGACAACATGTTCGTTCATCTCACCAACGTCGCCATCCAGAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 ACAGTGAAATACACCCCGAGTACCAGTGAGCTGGACAACATGTTCGTTCATCTCACCAACGTCGCCATCCAGAA 626
Query 741 ACACGGGGAGGACTACAACCACATCCATGGGGGCAAGTGGACAGTGAGTAACCTGCGGCTCTACCTGGAGAGCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 627 ACACGGGGAGGACTACAACCACATCCATGGGGGCAAGTGGACAGTGAGTAACCTGCGGCTCTACCTGGAGAGCA 700
Query 815 CCCGCGGCAAGGAGGTGACCAGCAAGCTGTTCGACGAGATCCACTGGATCATCGTGCAGTCCCTGAAGGCTGTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 CCCGCGGCAAGGAGGTGACCAGCAAGCTGTTCGACGAGATCCACTGGATCATCGTGCAGTCCCTGAAGGCTGTG 774
Query 889 GCGCCGGTGATGAACAATGACAAGCACTGCTTTGAATGCTATGGCTACGACATCATCATCGACGACAAGCTGAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 GCGCCGGTGATGAACAATGACAAGCACTGCTTTGAATGCTATGGCTACGACATCATCATCGACGACAAGCTGAA 848
Query 963 GCCCTGGCTGATCGAGGTGAATGCGTCCCCGTCTCTCACGTCCAGCACTGCCAATGACCGAATCCTCAAGTACA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 GCCCTGGCTGATCGAGGTGAATGCGTCCCCGTCTCTCACGTCCAGCACTGCCAATGACCGAATCCTCAAGTACA 922
Query 1037 ACCTGATTAATGACACCCTCAACATCGCCGTCCCGAATGGTGAAATCCCAGACTGCAAATGGAACAAGTCGCCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 923 ACCTGATTAATGACACCCTCAACATCGCCGTCCCGAATGGTGAAATCCCAGACTGCAAATGGAACAAGTCGCCA 996
Query 1111 CCTAAGGAAGTCCTCGGCAATTACGAGATTCTGTATGATGAAGAATTGGCCCAGGGTGACGGGGCTGACCGGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 CCTAAGGAAGTCCTCGGCAATTACGAGATTCTGTATGATGAAGAATTGGCCCAGGGTGACGGGGCTGACCGGGA 1070
Query 1185 GCTGAGAAGCCGTCAGGGTCAGTCTCTGGGGCCCAGAGCAGGCCGATCGAGAGACTCGGGGAGAGCGGTCCTCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 GCTGAGAAGCCGTCAGGGTCAGTCTCTGGGGCCCAGAGCAGGCCGATCGAGAGACTCGGGGAGAGCGGTCCTCA 1144
Query 1259 CCACCTGGAAG 1269
|||||||||||
Sbjct 1145 CCACCTGGAAG 1155