Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472324
• Subject: NM_001311144.1
• Aligned Length: 1054
• Identities: 811
• Gaps: 119

Alignment

Query    1  ATGCTGAGTCCGGAGCGCCTAGCCCTACCGGACTACGAGTATCTGGCTCAGCGACATGTCCTCACCTACATGGA  74
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCTGAGTCCCGAGCGCCTAGCTCTACCGGACTACGAGTATCTGGCTCAGAGACATGTCCTCACGTACATGGA  74

Query   75  GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTAGAAAACAGGGAAGATATTAGCCAATATGGAATTGCCAGGTTCTTCACTGAAT  148
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.|
Sbjct   75  GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTGGAGAACAGGGAGGATATTAGCCAGTATGGCATTGCCCGGTTCTTCACTGACT  148

Query  149  ATTTTAACAGTGTATGCCAGGGAACACACATTCTCTTTCGAGAATTCAGCTTCGTCCAAGCCACCCCCCACAAT  222
            ||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||.||.||.|||
Sbjct  149  ATTTTAACAGCGTATGCCAAGGAACTCACATTCTCTTCCGGGAATTCAGCTTTATACAAGCCACACCTCATAAT  222

Query  223  AGGGTATCATTTTTACGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTGGGCAAAAATGGCGATTTGCTGACCATGAA  296
            ||.|.||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||..||||||||||||.
Sbjct  223  AGAGCATCATTCCTTCGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTAGGGAAAAATGGTGACCTGCTGACCATGAG  296

Query  297  AGAATATCACTGTTTGCTGCAATTACTGTGTCCTGATTTCCCGCTGGAGCTCACTCAGAAAGCAGCCAGGATTG  370
            .||.||.||||||.|||||||.|||.||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  GGAGTACCACTGTCTGCTGCAGTTATTGTGCCCAGACTTCCCGCTGGAGCTTACTCAGAAAGCCGCCAGGATTG  370

Query  371  TGCTCATGGACGATGCCATGGACTGCTTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTCTTTGCCTTCCAGATCCAGTTTTAC  444
            ||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  TGCTCATGGATGATGCCATGGACTGCCTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTTTTCGCCTTCCAGATCCAGTTTTAT  444

Query  445  TACTCAGAATTCCTGGACAGTGTGGCTGCCATCTATGAGGACCTGCTGTCAGGCAAGAACCCCAACACAGTGAT  518
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.||||.||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  445  TACTCAGAATTCCTGGAGAGTGTGGCTGCCATCTATCAGGACTTGCTATCTGGGAAAAACCCCAATACAGTGAT  518

Query  519  TGTGCCGACGTCGTCCAGTGGGCAGCACCGCCAACGACCTGCCTTGGGCGGGGCCGGCACGCTGGAGGGCGTGG  592
            |||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|..|||||.|.||||||.||.||||
Sbjct  519  TGTCCCAACATCATCCAGTGGGCAACACCGCCAACGACCTGCCTTGGGTGATGCCGGTATGCTGGATGGAGTGG  592

Query  593  AGGCGTCGCTGTTCTACCAGTGTCTGGAAAACCTGTGTGATCGGCACAAGTACAGCTGCCCACCCCCAGCACTT  666
            |.||.||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct  593  AAGCATCACTGTTCTATCAGCGCCTGGAAAACCTGTGTGACCGGCACAAGTACAGCTGTCCACCACCAGCGCTT  666

Query  667  GTCAAAGAGGCCCTCAGCAATGTTCAGAGACTGACCTTCTATGGATTCCTCATGGCTCTCTCAAAGCACCGTGG  740
            |||||||||..|||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..||||.|||||||||||.|.|||
Sbjct  667  GTCAAAGAGATCCTGAGCAATGTCCAGAGGCTGACTTTCTATGGATTCCTTGTGGCCCTCTCAAAGCATCATGG  740

Query  741  AATCAACCAAGCCCTCGGAGCTTTGCCTGACAAGGGGGATCTGATGCACGACCCAGCAATGGATGAAGAGCTGG  814
            .||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  GATCAACCAAGCCCTGGGAGCTTTGCCAGACAAAGGAGACCTGATGCACGACCCAGCCATGGATGAAGAGCTGG  814

Query  815  AACGGCTGCT-------TCTTCCCTTCTTCAGGCTGGCCCAGGTCCCAGGCCTGGTCAACTCGGTCA-CAGCCA  880
            ||||||||.|       ||          .||||||..|| ||.|||.|                || ||||.|
Sbjct  815  AACGGCTGGTGGTGAGGTC----------GAGGCTGTACC-GGACCCCG----------------CAGCAGCAA  861

Query  881  ---GTCCAGAGGCCAGTTGCCTGCCTTCCCGGACCCCTCCCCGGGTTGGCTCTCCCTGGAGACCTCTCCATCAT  951
               |.|.||..|||||..||||                       ||||||.|....|.|||            
Sbjct  862  AGGGGCAAGGAGCCAGGGGCCT-----------------------TTGGCTTTGAAGGAAGA------------  900

Query  952  TCCCGAAAAG-TGGA-----TGGAGAGAGTG---------ATGGCTCCA---CTGAA-------------GAG-  993
                ||.||| ||||     .|||||.||||         .||||.|||   |..||             ||| 
Sbjct  901  ----GACAAGCTGGAGGCCCCGGAGACAGTGCCCTCAGCTTTGGCACCAACGCCCAACCCATATCGGTGGGAGC  970

Query  994  ACAGACGAGTCGGAGACT  1011
            .|||| |||         
Sbjct  971  CCAGA-GAG---------  978