Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472464
• Subject: XM_011513115.3
• Aligned Length: 1204
• Identities: 1004
• Gaps: 194

Alignment

Query    1  ATGCAAGTCTCCATAGCCTGCACAGAGCACAATTTGAAGAGTCGGAATGGTGAGGACCGACTTCTGAGCAAGCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAGCTCCACCGCCCCCAATGTGGTAAACGCAGCCCGGGCCAAATTCCGCACGGTCGCTATCATCGCGCGCAGCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGGGACGTTCACGCCTCAGCATCA-CATTTCTCTCAAAGAGTCCACCGCAAAGCAGACTGGCATGAAATATAG  221
                                 ||.| ||||      ||.|           ||||| |.||..|||      ||
Sbjct    1  ---------------------ATGATCATT------AATG-----------AAGCA-AATGTGATG------AG  29

Query  222  GAATCTTGGAAAATCAGGACTCAGAGTTTCTTGCTTGGGTCTTGGAACATGGGTGACATTTGGAGGTCAAATTT  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   30  GAATCTTGGAAAATCAGGACTCAGAGTTTCTTGCTTGGGTCTTGGAACATGGGTGACATTTGGAGGTCAAATTT  103

Query  296  CAGATGAGGTTGCTGAACGGCTGATGACCATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTGATACTGCCGAAGTC  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  104  CAGATGAGGTTGCTGAACGGCTGATGACCATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTGATACTGCCGAAGTC  177

Query  370  TATGCTGCTGGAAAGGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGGAGGTCCAGTCTGGT  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  178  TATGCTGCTGGAAAGGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGGAGGTCCAGTCTGGT  251

Query  444  CATAACAACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGTCAAGAAAGCATATTATTGAAG  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  252  CATAACAACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGTCAAGAAAGCATATTATTGAAG  325

Query  518  GATTGAAGGGCTCCCTCCAGAGGCTGCAGCTCGAGTATGTGGATGTGGTCTTTGCAAATCGACCGGACAGTAAC  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  326  GATTGAAGGGCTCCCTCCAGAGGCTGCAGCTCGAGTATGTGGATGTGGTCTTTGCAAATCGACCGGACAGTAAC  399

Query  592  ACTCCCATGGAAGAAATTGTCCGAGCCATGACACATGTGATAAACCAAGGCATGGCGATGTACTGGGGCACCTC  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  400  ACTCCCATGGAAGAAATTGTCCGAGCCATGACACATGTGATAAACCAAGGCATGGCGATGTACTGGGGCACCTC  473

Query  666  GAGATGGAGTGCTATGGAGATCATGGAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAATATGATCCCACCGGTCTGTG  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  474  GAGATGGAGTGCTATGGAGATCATGGAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAATATGATCCCACCGGTCTGTG  547

Query  740  AACAAGCTGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCTACCACAAAATAGGT  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  548  AACAAGCTGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCTACCACAAAATAGGT  621

Query  814  GTTGGCGCAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGGAAAATACGGAAACGGGGTGCCTGAAAG  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  622  GTTGGCGCAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGGAAAATACGGAAACGGGGTGCCTGAAAG  695

Query  888  TTCCAGGGCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGGGAGAAAACAGCAAA  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  696  TTCCAGGGCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGGGAGAAAACAGCAAA  769

Query  962  ACAAGCTAAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGGATGCACACTACCTCAGCTAGCTGTTGCGTGGTGC  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  770  ACAAGCTAAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGGATGCACACTACCTCAGCTAGCTGTTGCGTGGTGC  843

Query 1036  CTGAGAAACGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTCATTGAAAACCTTGGTGC  1109
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  844  CTGAGAAATGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTCATTGAAAACCTTGGTGC  917

Query 1110  CATTCAGGTTCTCCCAAAGATGACATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCGCAACAAGCCCTACA  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  918  CATTCAGGTTCTCCCAAAGATGACATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCGCAACAAGCCCTACA  991

Query 1184  GCAAGAAGGACTATAGATCA  1203
            ||||||||||||||||||||
Sbjct  992  GCAAGAAGGACTATAGATCA  1011