Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472482
- Subject:
- NM_001135726.3
- Aligned Length:
- 1274
- Identities:
- 897
- Gaps:
- 361
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTTAGTTCCTTTCCAGTGGTTTTGCTGGAAACCATGTCTCATTATACAGATGAACCCAGATTTACCATAGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCAGATAGATCTGCTTCAGCGACTTCGGCGTACTGGAATGACTAAACATGAAATTCTCCATGCCTTGGAAACTT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGGACCGTCTTGATCAAGAGCATAGTGACAAGTTTGGAAGAAGGTCCAGCTATGGAGGAAGTTCATATGGGAAT 222
Query 1 ------------------------------------------------------------------ATGTCCCC 8
||||||||
Sbjct 223 AGTACTAACAATGTCCCAGCATCTTCCTCTACAGCTACAGCTTCCACACAGACGCAGCATTCGGGAATGTCCCC 296
Query 9 GTCACCTAGCAACAGTTATGATACTTCCCCACAGCCTTGCACTACCAATCAAAATGGGAGGGAGAATAATGAGC 82
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTCACCTAGCAACAGTTATGATACTTCCCCACAGCCTTGCACTACCAATCAAAATGGGAGGGAGAATAATGAGC 370
Query 83 GATTATCTACATCCAATGGAAAGATGTCACCAACTCGCTACCATGCAAACAGCATGGGTCAGAGGTCATACAGT 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GATTATCTACATCCAATGGAAAGATGTCACCAACTCGCTACCATGCAAACAGCATGGGTCAGAGGTCATACAGT 444
Query 157 TTTGAAGCCTCAGAAGAGGACCTAGATGTAGATGATAAAGTGGAAGAATTAATGAGGAGGGACAGCAGTGTGAT 230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGAAGCCTCAGAAGAGGACCTAGATGTAGATGATAAAGTGGAAGAATTAATGAGGAGGGACAGCAGTGTGAT 518
Query 231 AAAAGAGGAAATCAAAGCCTTTCTTGCCAATCGGAGGATTTCCCAAGCAGTTGTTGCACAGGTAACAGGTATCA 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAAAGAGGAAATCAAAGCCTTTCTTGCCAATCGGAGGATTTCCCAAGCAGTTGTTGCACAGGTAACAGGTATCA 592
Query 305 GTCAGAGCCGGATCTCTCATTGGCTGTTGCAGCAGGGATCAGACCTGAGTGAACAGAAGAAAAGAGCATTTTAC 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTCAGAGCCGGATCTCTCATTGGCTGTTGCAGCAGGGATCAGACCTGAGTGAACAGAAGAAAAGAGCATTTTAC 666
Query 379 CGATGGTATCAACTTGAGAAGACAAACCCTGGCGCTACACTAAGTATGAGACCAGCCCCCATTCCAATAGAGGA 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGATGGTATCAACTTGAGAAGACAAACCCTGGCGCTACACTAAGTATGAGACCAGCCCCCATTCCAATAGAGGA 740
Query 453 CCCTGAATGGAGACAAACGCCTCCCCCAGTCTCTGCCACATCTGGTACTTTCCGACTGCGACGAGGGAGTCGAT 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCCTGAATGGAGACAAACGCCTCCCCCAGTCTCTGCCACATCTGGTACTTTCCGACTGCGACGAGGGAGTCGAT 814
Query 527 TTACCTGGAGAAAGGAGTGCCTGGCTGTTATGGAAAGTTACTTCAATGAGAATCAATACCCAGATGAAGCAAAG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTACCTGGAGAAAGGAGTGCCTGGCTGTTATGGAAAGTTACTTCAATGAGAATCAATACCCAGATGAAGCAAAG 888
Query 601 AGGGAAGAAATTGCAAACGCTTGCAATGCAGTTATACAGAAGCCAGGCAAAAAGCTGTCAGATCTGGAAAGAGT 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGGGAAGAAATTGCAAACGCTTGCAATGCAGTTATACAGAAGCCAGGCAAAAAGCTGTCAGATCTGGAAAGAGT 962
Query 675 TACCTCCCTGAAAGTATATAATTGGTTTGCTAACAGAAGGAAGGAGATCAAGAGGAGAGCCAATATT---GCAG 745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 963 TACCTCCCTGAAAGTATATAATTGGTTTGCTAACAGAAGGAAGGAGATCAAGAGGAGAGCCAATATTGAAGCAG 1036
Query 746 CAATCCTGGAGAGTCATGGGATAGATGTGCAGAGTCCAGGAGGCCACTCAAACAGTGATGATGTCGACGGGAAT 819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAATCCTGGAGAGTCATGGGATAGATGTGCAGAGTCCAGGAGGCCACTCAAACAGTGATGATGTCGACGGGAAT 1110
Query 820 GACTACTCTGAGCAGGAT-ACTTGGCAAGTAC--GCAATGGGGAGGAGGAGGAGGGAAGA----AGTTCA---- 882
|||||||||||||||||| || ||||| ||.||.|.||..| ..|||| |..|||
Sbjct 1111 GACTACTCTGAGCAGGATGAC------AGTACGAGCCATAGTGACCA-------CCAAGACCCCATCTCATTAG 1171
Query 883 --GAGGGA--GGCAG-AG--AAGCA--------------------GAGAAGGTAG-----------AAGA-AGA 917
|.||.| ||||| || ||.|| ||.|||| || |||| |||
Sbjct 1172 CTGTGGAAATGGCAGCAGTCAACCACACTATCTTGGCATTGGCCCGACAAGG-AGCCAACGAAATCAAGACAGA 1244
Query 918 G----CGGAGGATC-- 927
| .|||.|||.
Sbjct 1245 GGCCCTGGATGATGAC 1260