Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472545
- Subject:
- XM_006507138.1
- Aligned Length:
- 2258
- Identities:
- 1864
- Gaps:
- 34
Alignment
Query 1 ---------------------ATGGAAGAAGAAGGGCTGGAGTGTCCAAACTCTTCCTCTGAAAAACGCTATTT 53
|||||.|||||.|..|||||...|||.|||.|.||..|.||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCTCCCTGCGGGAAGAAATGGATGAAGAGGAACTGGACCATCCGAACGCCTCTCCAGAGAAACGCTATTT 74
Query 54 TCCTGAATCCCTGGATTCCAGCGATGGGGATGAGGAAGAGGTTTTGGCCTGTGAGGATTTGGAACTTAACCCCT 127
.||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||.|||..|||||||.||||||.||||.||.|||||||
Sbjct 75 CCCCGAGTCCCTAGATTCCAGTGACGGGGACGAGGAAGGGGTCCTGGCCTGCGAGGATCTGGAGCTGAACCCCT 148
Query 128 TTGATGGATTGCCATATTCATCACGTTATTATAAACTTCTGAAAGAAAGAGAAGATCTTCCTATATGGAAAGAA 201
||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 149 TTGACGGCTTACCGTATTCATCGCGATATTACAAACTTTTGAAAGAGAGAGAAGAGCTTCCGATATGGAAAGAA 222
Query 202 AAATACTCCTTTATGGAGAACCTGCTTCAAAATCAAATCGTGATTGTTTCAGGAGATGCTAAATGTGGTAAGAG 275
||.||||||||.|||||||..|||||.|||||.||..|.|||.|.||.|||||.||..|.||.|||||.|||||
Sbjct 223 AAGTACTCCTTCATGGAGAGTCTGCTGCAAAACCAGGTTGTGGTGGTGTCAGGGGACTCCAAGTGTGGCAAGAG 296
Query 276 CGCTCAGGTTCCTCAGTGGTGTGCTGAATATTGTCTTTCCATCCACTACCAGCACGGGGGCGTGATATGCACAC 349
|.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 CTCTCAGGTTCCTCAGTGGTGTGCTGAATATTGCCTTTCCATCCATTACCAGCACGGGGGCGTGATATGCACCC 370
Query 350 AGGTCCACAAGCAGACTGTGGTCCAGCTCGCCCTGCGGGTGGCGGATGAAATGGATGTTAACATTGGTCATGAG 423
|||.||||||.|||||.|..||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.||.
Sbjct 371 AGGCCCACAAACAGACGGCAGTCCAGCTGGCCCTGCGGGTGGCCGACGAGATGGATGTGAATATCGGGCACGAA 444
Query 424 GTTGGCTACGTGATCCCTTTCGAGAACTGCTGTACCAACGAAACAATCCTGAGGTATTGTACTGATGATATGCT 497
||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 445 GTCGGCTATGTGATTCCTTTTGAGAACTGCTGCACCACTGAAACAATCCTGAGGTACTGTACTGATGACATGCT 518
Query 498 GCAAAGAGAAATGATGTCCAATCCTTTTTTGGGTAGCTATGGGGTCATCATCTTAGATGATATTCATGAAAGAA 571
|||.|||||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||.||.|||.|.||.||.||||
Sbjct 519 GCAGAGAGAGATGATGTCCAACCCTTTCCTGGGTAGCTATGGCGTCATCATCTTGGACGATGTCCACGAGAGAA 592
Query 572 GCATTGCAACTGATGTGTTACTTGGACTTCTTAAAGATGTTTTACTAGCAAGACCAGAACTGAAGCTCATAATT 645
||.|.||.|||||.|||.|.||.|||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 593 GCCTGGCGACTGACGTGCTGCTCGGACTCCTTAAAGATGTGCTGCTGGCAAGACCAGAGCTGAAGCTCATAGTT 666
Query 646 AACTCCTCACCTCACCTGATCAGCAAACTCAATTCTTATTATGGAAACGTGCCTGTCATAGAAGTGAAAAATAA 719
||||.|||.||||.|||.|.|||.|||||||.|||.||.||||||.|||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 667 AACTGCTCGCCTCTCCTCACCAGTAAACTCAGTTCCTACTATGGAGACGTGCCTGTCATAGAAGTGAGAAATAA 740
Query 720 ACACCCTGTGGAGGTTGTGTACCTTAGTGAGGCTCAAAAGGATTCTTTTGAGTCTATTTTACGCCTTATCTTTG 793
.|||||.||||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||.||.||||||.|..|||||||||||||||
Sbjct 741 GCACCCGGTGGAGGTGGTGTACCTTAGTGGGGCTCAGAAGGATTCCTTCGAGTCTGTCATACGCCTTATCTTTG 814
Query 794 AAATTCACCACTCGGGTGAGAAAGGTGACATTGTAGTCTTTCTGGCCTGTGAACAAGATATTGAGAAAGTCTGT 867
||||.||||.||||||||||||.||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||..||.|
Sbjct 815 AAATCCACCGCTCGGGTGAGAAGGGTGACGTTGTGGTCTTCCTGGCCTGTGAACAAGATATTGAAAAAACCTAT 888
Query 868 GAAACTGTCTATC---AAGGATCTAACCTAAACCCAGATCTTGGAGAACTGGTGGTTGTTCCTTTGTATCCAAA 938
|||..|||.|.|| |||||||.|||.|||||||||||.|.||.||.||||||||..|.|||||||||||.||
Sbjct 889 GAACTTGTGTGTCAGGAAGGATCCAACTTAAACCCAGATGTGGGCGACCTGGTGGTCATCCCTTTGTATCCCAA 962
Query 939 AGAGAAATGTTCA--TTGTTCAAGCCACTCGATGAAACAGAAAAAAGATGCCAAGTTTATCAAAGAAGAGTGGT 1010
|||||| ||.|| .||||||.||||.|.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||
Sbjct 963 AGAGAA--GTGCAGCCTGTTCAGGCCAGTGGACGAAACCGAGAAAAGATGCCAAGTGTATCAGAGACGGGTGGT 1034
Query 1011 GTTAACTACTAGCTCTGGAGAGTTTTTGATCTGGAGCAACTCAGTCAGATTTGTTATCGATGTGGGTGTGGAAA 1084
|.|.||.||.||||..||.||||.|.|||||||||||.||.|.||||.||||||.||.|||||.|||.||||||
Sbjct 1035 GCTGACCACCAGCTGCGGGGAGTCTCTGATCTGGAGCCACACGGTCAAATTTGTCATTGATGTTGGTCTGGAAA 1108
Query 1085 GAAGAAAGGTGTACAACCCGAGAATAAGAGCAAACTCGCTCGTCATGCAGCCCATCAGCCAGAGCCAGGCAGAG 1158
|||||.||||.||.|||||..|.||.|||||.|||||.||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1109 GAAGACAGGTATATAACCCCCGGATCAGAGCCAACTCCCTCGTCCTGCAGCCCATCAGCCAAAGCCAAGCAGAG 1182
Query 1159 ATACGCAAGCAGATTCTTGGCTCATCTTCTTCAGGAAAATTTTTCTGCCTGTACACTGAAGAATTTGCCTCCAA 1232
||.||.||||||.|.||.||.||.|||.|.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 ATCCGGAAGCAGCTCCTCGGGTCTTCTCCCTCAGGAAAACTTTTCTGTCTGTACACTGAAGAATTTGCCTCCAA 1256
Query 1233 AGACATGACGCCACTGAAGCCAGCAGAAATGCAGGAAGCCAACCTAACAAGCATGGTGCTTTTTATGAAGAGGA 1306
||||||||.|||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||.
Sbjct 1257 AGACATGAGGCCCCTTAAGCCAGCGGAAATGCAGGAAGCCAACCTGACTAGCATGGTGCTCTTCATGAAGAGGG 1330
Query 1307 TAGACATTGCGGGCCTAGGCCACTGTGACTTCATGAACAGACCAGCACCAGAAAGTTTGATGCAGGCATTGGAA 1380
|.||||||||.|||||.||||.|||.||||||||||||||.|||||.||||||||..|||||||||||.|||||
Sbjct 1331 TGGACATTGCAGGCCTGGGCCGCTGCGACTTCATGAACAGGCCAGCTCCAGAAAGCCTGATGCAGGCACTGGAA 1404
Query 1381 GACTTAGATTATCTGGCAGCACTGGATAATGATGGAAATCTTTCTGAATTTGGAATCATCATGTCAGAGTTTCC 1454
||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1405 GATTTAGATTACCTGGCAGCCCTGGACAACGATGGGAATCTCTCTGAGTTTGGAATCATCATGTCTGAGTTTCC 1478
Query 1455 TCTTGATCCACAACTCTCGAAGTCTATCTTAGCGTCCTGTGAATTTGACTGTGTAGATGAAGTGCTAACAATCG 1528
|||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||
Sbjct 1479 TCTGGATCCACAGCTCTCAAAGTCTATCTTAGCATCCTGTGAATTTGACTGTGTAGACGAAATGCTAACCATCG 1552
Query 1529 CGGCCATGGTAACAGCTCCAAATTGCTTTTCACATGTGCCACATGGAGCTGAAGAGGCTGCCTTGACTTGTTGG 1602
|.|||||||||||||||||.|.||||||||..||.|||||.|||||.|||||.||||||||..|||||||.|||
Sbjct 1553 CTGCCATGGTAACAGCTCCCAGTTGCTTTTTGCACGTGCCTCATGGTGCTGAGGAGGCTGCAGTGACTTGCTGG 1626
Query 1603 AAGACATTTTTACATCCCGAAGGAGATCACTTTACCCTCATCAGCATTTACAAGGCTTACCAAGACACAACTCT 1676
||.||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||...|.|||||.||.||||||||.|||..|||
Sbjct 1627 AAAACGTTCTTGCACCCTGAAGGTGATCACTTTACGCTCATCAATGTCTACAATGCCTACCAAGATACAGTTCT 1700
Query 1677 GAATTCTAGCAGTGAGTACTGTGTGGAAAAGTGGTGTCGTGATTACTTCCTCAACTGTTCAGCACTCAGAATGG 1750
|||.|||..||.|||..||||||||||.|.||||||||..||||.||||||||.|||.||.||.|||||.||||
Sbjct 1701 GAACTCTGCCAATGAACACTGTGTGGAGATGTGGTGTCACGATTGCTTCCTCAGCTGCTCTGCTCTCAGGATGG 1774
Query 1751 CAGATGTTATTCGAGCTGAACTCTTAGAAATTATCAAGCGAATCGAGCTTCCCTATGCAGAACCTGCTTTTGGC 1824
||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1775 CAGACGTTATCCGAGCAGAACTCTTAGAGATCATCAAGCGGATCGAGCTTCCCTATGCAGAGCCTGCCTTTGGC 1848
Query 1825 TCCAAGGAAAACACTCTAAACATAAAGAAAGCTCTTCTGTCCGGTTACTTTATGCAGATTGCTCGGGATGTTGA 1898
||||||||||||....|.|||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1849 TCCAAGGAAAACGGGTTGAACATCAAGAAAGCGCTGCTCTCTGGGTACTTCATGCAGATTGCTCGGGATGTTGA 1922
Query 1899 TGGATCAGGTAACTACTTAATGCTGACACATAAGCAGGTTGCTCAGCTGCATCCCCTGTCTGGTTACTCAATCA 1972
.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||..|.||.||.||||
Sbjct 1923 CGGGTCAGGTAACTACTTGATGCTTACACATAAGCAGGTTGCTCAGCTGCATCCCTTATCAAGCTATTCCATCA 1996
Query 1973 CCAAGAAGATGCCAGAGTGGGTCCTCTTCCATAAATTCAGCATTTCTGAGAACAACTACATCAGGATTACCTCA 2046
|||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||.|||||||||||||||||||||.|..||||.
Sbjct 1997 CCAAGAAGATGCCCGAGTGGGTCCTCTTCCACCAGTTCAGCATATCTGAGAACAACTACATCAGGGTCGCCTCC 2070
Query 2047 GAAATCTCTCCTGAACTATTTATGCAGCTGGTACCACAATACTATTTCAGTAATCTGCCTCCTAGTGAAAGTAA 2120
|.|.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2071 GCAGTCTCCCCTGAGCTATTTATGCAGCTGGTACCACAGTACTATTTCAGTAACCTGCCTCCTAGTGAAAGCAA 2144
Query 2121 GGACATTCTACAGCAAGTAGTGGATCACCTATCCCCTGTGTCAACAATGAATAAGGAACAGCAAATGTGTGAGA 2194
||||||.||||||||||..|..|..||||||.||.|.| .|||..||||.|||||.|||.|..|||||||.|
Sbjct 2145 GGACATCCTACAGCAAGCTGCAGGCCACCTACCCACAG---AAACTGTGAACAAGGACCAGGATGTGTGTGACA 2215
Query 2195 CGTGCCC---TGAAACTGAACAGAGATGCACTCTCCAG 2229
.|||||| ||..|||||.|||||||||||..|||||
Sbjct 2216 AGTGCCCAGATGCTACTGAGCAGAGATGCACAATCCAG 2253