Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472583
- Subject:
- NM_177722.3
- Aligned Length:
- 2058
- Identities:
- 1539
- Gaps:
- 318
Alignment
Query 1 ---------------ATGAAAGAGGCGGCCCTCATCTATCTTGACAGAAGTGGAGGCCTCCAAAAGTTTATAGA 59
|||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGACTCTTCAGATGAAAGAGGCAGCCCTTGTCTATCTTGACAGAAGTGGAGGCCTCCAAAAGTTTATAGA 74
Query 60 TGATTGCAAGTACTACAATGATTCAAAACAAAGCTATGCTGTCTATCGATTCAAAATTTTAATAAATCCCTCTG 133
.||.|||||||.|||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||..|||.|||||.|.||||.||
Sbjct 75 CGACTGCAAGTCCTACAATGATTCAAAGCAGAGTTATGCTGTCTATCGGTTCAGTATTCTAATAGACCCCTGTG 148
Query 134 ATGTTGTTGAATTAGATGCTGAGCTTGGAAATCACATTTTACACCAACCTTTAAAAGCTGCTGAAGTCTTTCAA 207
|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||..|||.||||||
Sbjct 149 ACGTTGTTGAATTAGATGCTGACCTTGGAAATCACATTTTACACCATCCCTTAAAAGCTGCTCGAGTTTTTCAA 222
Query 208 TCAGTCTGTTTTATTGCTGTTAAGACTCTCTCATTAATTGGACAATTGCAGACTGAAACGCAAATTAATATAGT 281
||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 223 TCAGTCTGCTTTGTTGCTGTTAAGACTCTCTCATTAATTGGACAGTTACAGACTGAAACTCAAATCAATATTGT 296
Query 282 GCTGAAATTAACACATTTACCTCCCCTGCCAAGTTATGGTCTTGATCTTTGTGAGTTTCCACTTGATTATACAT 355
||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||..|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 297 GCTGAAGTTAACACATTTACCAGCCCTGCCAAGCTATACTCTTGATCTTTGTGAGTTTCCACTTAATTATGCAT 370
Query 356 CTCAGAGATTTTATATGATGCAAGGAATTGTGATTGCAATGACAACTATAACCAAGTATACACAAGGGGCAAGA 429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 371 CTCAGAGATTTTATATGATGCAAGGAATTGTGATTGCAATGACAACTATAACCAAGTACACTCAAGGTGCAAG- 443
Query 430 TTTCTT-TGTTCAGATGAAGCATGCCCTCTTTCAAAAGGATTTCAGTATATAAGAGTGCATGTGCCTGGTGCTA 502
.||||| ||||||||||.||..||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 444 GTTCTTGTGTTCAGATGGAGTGTGTCCTCTTTCAAAAGGATTTCAGTATGTGAGAGTCCATGTGCCTGGAGCTA 517
Query 503 CAGAATCTGCAACGATAAGAAATGACTTTTTGTGTAATCTATGTGCATCTTCACTTCAAGAAGACAGAAAATTT 576
|||||||||||||..||||||||||||||||.||.|.|||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 CAGAATCTGCAACAGTAAGAAATGACTTTTTATGCAGTCTCTGTTCATCTTCACTTCAAGAAGACAGAAAATTT 591
Query 577 AGAGTACTTGGTGATAAACAAATAGTTGAAATAATTGCCACAAAGGCACTTCGTGCTTTTCAAGGATATTCTAA 650
||||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||.....|||.|||||||||||||.|.|||||
Sbjct 592 AGAGTACTTGGTGATAAACAGATAGTTGAAATAATCACCACAAAAATGTTTCATGCTTTTCAAGGAGACTCTAA 665
Query 651 CAACCAGCCATTTAGGTTTCAATCACTTACAATTTTCCTAAGAGATGAATCAGTGAATAAAATGAATATAGGAA 724
.|||||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||..|||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 666 AAACCAGCCATTTAGGTTTCAATCACTTGGTATTTTCCTAAGAGATGAACTAGTGAATAAGATGAAAATAGGAA 739
Query 725 ATGAATATAAAATTATTGGAATTCCAACCTGTGTAAAAACCTCACAAACTGCTGTCTGTATAGAAGCAAATAGC 798
||||||||||||||||||||||||||..||||||.|||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||..
Sbjct 740 ATGAATATAAAATTATTGGAATTCCAGTCTGTGTCAAAACTTCACAAACTGCTCTCTGTGTAGAAGCAAATAAT 813
Query 799 ATAACTTTTTGTAATT----------CAAAAGTTCCTTCAGGAATTAGTGACAACTTCAGGTGTCTCCTCTCCT 862
||.|| | ||||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||||||||||||
Sbjct 814 ATCAC----------TCCCCACACAGCAAAAGTTCCTTTAGGAATTAGTGACAACTTTAGGCGTCTCCTCTCCT 877
Query 863 TAACTTCCAGCTCATGCTGGAAGTTTACAGCAATACTTGCCAATATCTTTGCATCACAAATTACCCCTCCTGGG 936
|.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||.|||||||||||||.|||....||||||||
Sbjct 878 TGACTTCGAGCTCGTGCTGGAAATTCACAGCAATGCTGGCCAATGTCTTTGCATCACAGATTGTTGCTCCTGGG 951
Query 937 ACTTACAATTTGCTCAAGCTCTGTTTGTTGATGAGTCTAGTACAGACAACTGACCGTAACAAGGAACTGGAAGA 1010
|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..|||.|.||||.|||||..|||||
Sbjct 952 ACTTACAATTTGCTCAAACTTTGTTTGTTGATGAGTCTAGTACAGACAAGAGACTGCAACAGGGAACGAGAAGA 1025
Query 1011 TTGCCTGGATATTTTAATTATAACAAGTGATACTCTACTCATAGACAGGCTTCTGAATTTTAGCATAAACCTTG 1084
.|||.|||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||..|||||||.|||.|||||||||||||.||.||||
Sbjct 1026 CTGCTTGGATATTTTAGTTATAACCAGTGACACTCTGCTTGTAGACAGACTTTTGAATTTTAGCATGAATCTTG 1099
Query 1085 TCCCCCGTGGTATACGTCATCTAGTCTCTACTGAAATTTTTCCCACTCTATCCAGGAATAAGTATGGAACTGGA 1158
||.||||||||||||||||||..||||.|||.|||.|||||||.||..|.|||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1100 TCTCCCGTGGTATACGTCATCCTGTCTGTACAGAAGTTTTTCCTACAGTGTCCAGAAATAAATATGGAACAGGA 1173
Query 1159 GCAGTTAGCATTCAGGCTGGCAGTGCTTTGCTAGCTAAAGGTGGTATCTGCTTTATAGGAGACTTGGCTTCACA 1232
|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||.|.||.||
Sbjct 1174 GCAGTGAGCATTCAGGCCGGCAGTGCTTTGCTTGCTAAGGGTGGTATCTGCTTTATAGGAGACCTGACATCCCA 1247
Query 1233 CAAAAAAGATAAACTTGAACAGCTTCAAACAGTTCTGGAGAGCAGAAGCATCACAGTGTACATCCCAGGAAAGA 1306
.|||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|.|||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1248 TAAAAAAGATAAACTTGAACAGCTTCAATCAGCTTTGGAGAGCAGAAGCGTTACAGTATTCATCCCAGGAAAGA 1321
Query 1307 AGTTTGGGGAGGATATTGATCAACAGATGACTTTTCCAGTTCAGTGCAGTTTTTGGTCTTTTGTTGATGTGGAT 1380
||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1322 AGTTTGGGGATGATTTCGATCAGCAAATGACTTTTCCCATTCAGTGCAGTTTTTGGTCTTTTGTTGATATGGAT 1395
Query 1381 TCATCTTCAAGGAGAAATGCACAGAAAATCAACACTCTAATTGGTCAGATGGATTGCAGTTTGATTCCAGCTAA 1454
|||||||||||||||||||..|||||||.||..|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1396 TCATCTTCAAGGAGAAATGTGCAGAAAACCAGTACTCTGATTGGTCAGATGGATTGCAGTTTGATTCCAGCCAA 1469
Query 1455 CCTTGTGGAGGCATTTGGTTTATTGATTAACTGCAACGAGTCATCTCCCTGCCACCCATTTCTTCCTACTGTGC 1528
|||||..|||||||||||.|||.||||||||||||..|||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1470 CCTTGCAGAGGCATTTGGATTACTGATTAACTGCAGTGAGGCATCTCCTTGCCACCCACTTCTTCCTACTGTGC 1543
Query 1529 AACACACTTTGAACAAAGCCATTAATCCTGAAGGGCTGTT----TTATGCGGCTTCTAGACAGTTCACAACTGA 1598
|.||||||||.||.|||||..|..|.|||||.||||||.| ||| ||.||||..||||||||||||||
Sbjct 1544 AGCACACTTTAAAGAAAGCAGTGGAGCCTGAGGGGCTGCTGTACTTA----GCGTCTAAGCAGTTCACAACTGA 1613
Query 1599 AGATTTTGAAAAGCTATTGGCTTTTGCAAAGAATTTGAATGTAGAATTCAGCTTGGAAGCAGAAAGAATGACCC 1672
|||.||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 1614 AGACTTTGAAAAGCTACTGGCTTTTGCAAAGAGTTTGAATATGGAATTCAGCTTGGAAGCAGAAAGAATGATTC 1687
Query 1673 ATGGCTATTATCTAGCAAGTCGCAGAATCAGAACAGGCTCTGTATGTGGATCAAAGCTGTCAGCATCTGCATTA 1746
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||.||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688 ATGGCTATTATCTAGCAAGTCGCAGAATAAGAACAGATTCTATACATGGATCAAAGCTGTCAGCATCTGCATTA 1761
Query 1747 AAA-------------TATCTG---------------------------------------------------- 1755
||| ||||||
Sbjct 1762 AAATATTTAGTGTCTTTATCTGAAGCCCACGCCCGGCTGAGCCTAAGGACCACAGTGCTCAGAGAAGACGCACT 1835
Query 1756 -------------------------------------------------------------------------- 1755
Sbjct 1836 CATCGCAGCCTTGTTGTTGGAAATCTCTCTCACACTGAGATACGGGGCCACTCCATTTTGTGTTGCTCCCAATG 1909
Query 1756 -------------------------------------------------------------------------- 1755
Sbjct 1910 CATTATTTCCATTTGAGCTGTATAATGAAGAATATTTAGAGCAAAGAGATCTCTACCTGACTCAGTGCCAACAG 1983
Query 1756 ------------------------------------------------------------ 1755
Sbjct 1984 CAGCTCCAACAGTTTATTGCCACATGTGGACCTGGGACAACTGTCTTTTCTAGTGATGAA 2043