Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472701
• Subject: XM_005251291.3
• Aligned Length: 1407
• Identities: 1257
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGGCGGAGGATGTTTCCTCAGCGGCCCCGAGCCCGCGGGGCTGTGCGGATGGTAGGGATGCCGACCCTACTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGAGGATGTTTCCTCAGCGGCCCCGAGCCCGCGGGGCTGTGCGGATGGTAGGGATGCCGACCCTACTGA  74

Query   75  GGAGCAGATGGCAGAAACAGAGAGAAACGACGAGGAGCAGTTCGAATGCCAGGAACTGCTCGAGTGCCAGGTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGCAGATGGCAGAAACAGAGAGAAACGACGAGGAGCAGTTCGAATGCCAGGAACTGCTCGAGTGCCAGGTGC  148

Query  149  AGGTGGGGGCCCCCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACGCGGGCCTGGTGGCCGAGGCCGAGGCCGTGGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGTGGGGGCCCCCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACGCGGGCCTGGTGGCCGAGGCCGAGGCCGTGGCT  222

Query  223  GCCGGCTGGATGCTCGATTTCCTCTGCCTCTCTCTTTGCCGAGCTTTCCGCGACGGCCGCTCCGAGGACTTCCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCGGCTGGATGCTCGATTTCCTCTGCCTCTCTCTTTGCCGAGCTTTCCGCGACGGCCGCTCCGAGGACTTCCG  296

Query  297  CAGGACCCGCAACAGCGCAGAGGCTATTATTCATGGACTATCCAGTCTAACAGCTTGCCAGTTGAGAACGATAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGGACCCGCAACAGCGCAGAGGCTATTATTCATGGACTATCCAGTCTAACAGCTTGCCAGTTGAGAACGATAT  370

Query  371  ACATATGTCAGTTTTTGACAAGAATTGCAGCAGGAAAAACCCTTGATGCACAGTTTGAAAATGATGAACGAATT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACATATGTCAGTTTTTGACAAGAATTGCAGCAGGAAAAACCCTTGATGCACAGTTTGAAAATGATGAACGAATT  444

Query  445  ACACCCTTGGAATCAGCCCTGATGATTTGGGGTTCAATTGAAAAGGAACATGACAAACTTCATGAAGAAATACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACACCCTTGGAATCAGCCCTGATGATTTGGGGTTCAATTGAAAAGGAACATGACAAACTTCATGAAGAAATACA  518

Query  519  GAATTTAATTAAAATTCAGGCTATAGCTGTTTGTATGGAAAATGGCAACTTTAAAGAAGCAGAAGAAGTCTTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAATTTAATTAAAATTCAGGCTATAGCTGTTTGTATGGAAAATGGCAACTTTAAAGAAGCAGAAGAAGTCTTTG  592

Query  593  AAAGAATATTTGGTGATCCAAATTCTCATATGCCTTTCAAAAGCAAATTGCTTATGATAATCTCTCAGAAAGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAGAATATTTGGTGATCCAAATTCTCATATGCCTTTCAAAAGCAAATTGCTTATGATAATCTCTCAGAAAGAT  666

Query  667  ACATTTCATTCCTTTTTTCAACACTTCAGCTACAACCACATGATGGAGAAAATTAAGAGTTATGTGAATTATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACATTTCATTCCTTTTTTCAACACTTCAGCTACAACCACATGATGGAGAAAATTAAGAGTTATGTGAATTATGT  740

Query  741  GCTAAGTGAAAAATCATCAACCTTTCTAATGAAGGCAGCGGCAAAAGTAGTAGAAAGCAAAAGGACAAGAACAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTAAGTGAAAAATCATCAACCTTTCTAATGAAGGCAGCGGCAAAAGTAGTAGAAAGCAAAAGGACAAGAACAA  814

Query  815  TAACTTCTCAAGATAAACCTAGTGGTAATGATGTTGAAATGGAAACTGAAGCTAATTTGGATACAAGAAAA---  885
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  815  TAACTTCTCAAGATAAACCTAGTGGTAATGATGTTGAAATGGAAACTGAAGCTAATTTGGATACAAGAAAAAGT  888

Query  886  ---------------------------------------------------------AGGTCTCACAAGAATCT  902
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  889  GTTAGTGACAAACAGTCTGCGGTAACTGAATCCTCAGAGGGTACAGTATCCTTATTGAGGTCTCACAAGAATCT  962

Query  903  TTTCTTATCTAAGTTGCAACATGGAACCCAGCAACAAGACCTTAATAAGAAAGAAAGAAGAGTAGGAACTCCTC  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTTCTTATCTAAGTTGCAACATGGAACCCAGCAACAAGACCTTAATAAGAAAGAAAGAAGAGTAGGAACTCCTC  1036

Query  977  AAA-----------------------------------------------------------------------  979
            |||                                                                       
Sbjct 1037  AAATTACATATATTTGTCTTACCAAACTGACTATGAATAAGAAAGAAGGAGTGAGGAAAGGATTATGCTTCTTA  1110

Query  980  -------------------GTACAAAAAAGAAAAAAGAAAGCAGAAGAGCCACTGAAAGCAGAATACCTGTTTC  1034
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTACTCCTAAAACATTATCGTACAAAAAAGAAAAAAGAAAGCAGAAGAGCCACTGAAAGCAGAATACCTGTTTC  1184

Query 1035  AAAGAGTCAGCCGGTAACTCCTGAAAAACATCGAGCTAGAAAAAGACAGGCATGGCTTTGGGAAGAAGACAAGA  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAAGAGTCAGCCGGTAACTCCTGAAAAACATCGAGCTAGAAAAAGACAGGCATGGCTTTGGGAAGAAGACAAGA  1258

Query 1109  ATTTGAGATCTGGCGTGAGGAAATATGGAGAGGGAAACTGGTCTAAAATACTGTTGCATTATAAATTCAACAAC  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATTTGAGATCTGGCGTGAGGAAATATGGAGAGGGAAACTGGTCTAAAATACTGTTGCATTATAAATTCAACAAC  1332

Query 1183  CGGACAAGTGTCATGTTAAAAGACAGATGGAGGACCATGAAGAAACTAAAACTGATTTCCTCAGACAGCGAAGA  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGGACAAGTGTCATGTTAAAAGACAGATGGAGGACCATGAAGAAACTAAAACTGATTTCCTCAGACAGCGAAGA  1406

Query 1257  C  1257
            |
Sbjct 1407  C  1407