Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473166
• Subject: XM_006518664.3
• Aligned Length: 1002
• Identities: 859
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCCCCCCGGC  74
            ||||||||||||||.|||||||||||.||..||.||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGACAGAGAACTCAGACAAAGTTCCTATCACCATGGTAGGGCCTGAGGACGTTGAGTTTTGCAGTCCCCCGGC  74

Query   75  GTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCC---AGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTCATTT  145
            ||||.|.||..|.||.||||||||||||   |||||..|.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GTACACCACCGTCACCGTGAAGCCCTCCGGGAGCCCAACACGGCTGCTCAAGGTAGGAGCTGTGGTCCTCATTT  148

Query  146  CGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACATTTAC  219
            |.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||
Sbjct  149  CTGGCGCGGTACTGCTGCTCTTCGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAATGACAATCACATTTAC  222

Query  220  AATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACAACTT  293
            |||||.|||||||..||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  223  AATGTTCATTACAGTATGAGTATCAATGGGAAACTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGATGCTGTGAACAACTT  296

Query  294  GGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAATGGCATCACAGGAA  367
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||.|||.||.|||||..|.|||||||||||.||.|
Sbjct  297  GGAGACCTTTAAAATGGGAAGCGGAGCGGAAGAAGCAATTGAAGTCAACGATTTTAAAAATGGCATCACTGGGA  370

Query  368  TTCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATTAAAGCGCAAGTGAAGGCTCGTATTCCTGAGGTGGGCGCCGTG  441
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||.|.|||
Sbjct  371  TCCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATCAAAGCACAGGTGAAGGCTCGCATCCCTGAGGTGGGCACAGTG  444

Query  442  ACCAAACAGAGCATCTCCTCCAAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTATCTG  515
            |||||.||||||||   |||..||||||||||||||||||||||||..||.||.|||||.||.||.||.||.||
Sbjct  445  ACCAAGCAGAGCAT---CTCTGAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGCTAACTACGAAGAGAACTCGCTGATTTG  515

Query  516  GGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGACCTTC  589
            ||||||.||.||.||||||||||||||||.||||||||||||.|||||..|..|.||||||||.||.|||||.|
Sbjct  516  GGTGGCCGTGGACCAGCCTGTGAAGGACAGCAGCTTCTTGAGCTCTAAAATCCTTGAACTCTGTGGCGACCTGC  589

Query  590  CTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAAAGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGTGGTAAGAAAAATTGTT  663
            |.||||||||||||||.||.|..||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|.||.|
Sbjct  590  CGATTTTCTGGCTTAAGCCCATGTATCCAAAAGAAATCCAGAGAGAGAGAAGAGAAGTCGTGAGAAACAGTGCT  663

Query  664  CCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGACTGAATAATGAAACCAG  737
            ||..|||||||||.||||||||||||.|.|||.||..|.|||.|||||.||||||||||||.|||.|.||||||
Sbjct  664  CCCTCTACCACAAGAAGACCACACAGCGAACCTCGAGGTAACGCAGGCCCTGGAAGACTGAGTAACGGAACCAG  737

Query  738  ACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTTATCATCAGGAAGGGGAAAGCATGACAT  811
            |||||.||||||.||.|||.||.||.|.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  738  ACCCAATGTTCAGGACGACGCAGAACCTTTCAACCCTGACAATCCTTACCACCAGGAAGGAGAAAGCATGACAT  811

Query  812  TCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTACACCCACTGCCAGAAGATC  885
            |.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  TTGACCCTAGACTGGACCATGAAGGGATCTGCTGTATAGAATGCAGGCGGAGCTACACCCACTGCCAGAAGATC  885

Query  886  TGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTTCGGCCTGCAGAGTCATCAT  959
            ||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||
Sbjct  886  TGTGAACCACTGGGAGGCTACTATCCATGGCCTTACAATTACCAAGGATGCCGCTCGGCCTGCAGAGTCGTCAT  959

Query  960  GCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTAGGCATGGTA  999
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  960  GCCATGCAGCTGGTGGGTGGCCCGCATCTTGGGCATGGTG  999