Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473219
• Subject: NM_017632.4
• Aligned Length: 1740
• Identities: 1737
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCGCAGGAGGTGTCGGAGTACCTGAGCCAGAACCCGCGGGTGGCAGCCTGGGTGGAGGCGCTGCGCTGCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCAGGAGGTGTCGGAGTACCTGAGCCAGAACCCGCGGGTGGCAGCCTGGGTGGAGGCGCTGCGCTGCGA  74

Query   75  CGGCGAGACTGACAAACACTGGCGCCACCGCCGGGATTTTTTGCTTCGCAACGCCGGGGACCTGGCCCCCGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGCGAGACTGACAAACACTGGCGCCACCGCCGGGATTTTTTGCTTCGCAACGCCGGGGACCTGGCCCCCGCTG  148

Query  149  GCGGCGCTGCCTCCGCTAGCACGGATGAAGCTGCCGACGCCGAGAGCGGGACCCGAAACCGGCAGCTGCAGCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGGCGCTGCCTCCGCTAGCACGGATGAAGCTGCCGACGCCGAGAGCGGGACCCGAAACCGGCAGCTGCAGCAG  222

Query  223  CTCATCTCCTTTTCCATGGCCTGGGCGAACCACGTCTTCCTCGGGTGCCGATACCCTCAAAAAGTTATGGATAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCATCTCCTTTTCCATGGCCTGGGCGAACCACGTCTTCCTCGGGTGCCGATACCCTCAAAAAGTTATGGATAA  296

Query  297  AATACTTAGTATGGCTGAAGGCATCAAAGTGACAGATGCTCCAACCTATACAACAAGAGATGAACTGGTTGCCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATACTTAGTATGGCTGAAGGCATCAAAGTGACAGATGCTCCAACCTATACAACAAGAGATGAACTGGTTGCCA  370

Query  371  AGGTGAAGAAAAGAGGGATATCGAGTAGCAATGAAGGGGTAGAAGAGCCATCCAAAAAACGAGTTATAGAAGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGTGAAGAAAAGAGGGATATCGAGTAGCAATGAAGGGGTAGAAGAGCCATCCAAAAAACGAGTTATAGAAGGA  444

Query  445  AAAAACAGTTCTGCAGTTGAGCAAGATCACGCAAAAACCTCTGCCAAGACAGAACGTGCATCAGCTCAGCAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAAACAGTTCTGCAGTTGAGCAAGATCACGCAAAAACCTCTGCCAAGACAGAACGTGCATCAGCTCAGCAGGA  518

Query  519  AAACAGTTCAACGTGTATAGGGTCGGCCATCAAATCAGAGAGTGGGAACTCAGCTCGGAGCTCTGGCATCTCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAACAGTTCAACGTGTATAGGGTCGGCCATCAAATCAGAGAGTGGGAACTCAGCTCGGAGCTCTGGCATCTCCA  592

Query  593  GTCAGAATAGCTCTACAAGTGATGGAGATCGATCTGTTTCCAGCCAAAGCAGCAGCAGCGTTTCCTCTCAGGTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCAGAATAGCTCTACAAGTGATGGAGATCGATCTGTTTCCAGCCAAAGCAGCAGCAGCGTTTCCTCTCAGGTA  666

Query  667  ACAACGGCAGGATCTGGGAAAGCTTCTGAAGCAGAAGCTCCAGATAAACACGGTT---CATCATTTGTTTCCTT  737
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
Sbjct  667  ACAACGGCAGGATCTGGGAAAGCTTCTGAAGCAGAAGCTCCAGATAAACACGGTTCTGCATCATTTGTTTCCTT  740

Query  738  GCTGAAATCCAGTGTGAATAGTCACATGACCCAATCCACTGATTCTAGACAACAAAGTGGATCACCTAAAAAGA  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTGAAATCCAGTGTGAATAGTCACATGACCCAATCCACTGATTCTAGACAACAAAGTGGATCACCTAAAAAGA  814

Query  812  GTGCTTTGGAAGGCTCTTCAGCCTCAGCTTCTCAAAGCAGCTCAGAGATCGAGGTGCCCTTGTTGGGCTCCTCA  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGCTTTGGAAGGCTCTTCAGCCTCAGCTTCTCAAAGCAGCTCAGAGATCGAGGTGCCCTTGTTGGGCTCCTCA  888

Query  886  GGAAGCTCAGAGGTAGAATTGCCACTATTGTCTTCCAAACCTAGTTCAGAGACAGCTTCAAGTGGGTTAACTTC  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAAGCTCAGAGGTAGAATTGCCACTATTGTCTTCCAAACCTAGTTCAGAGACAGCTTCAAGTGGGTTAACTTC  962

Query  960  CAAAACTAGTTCAGAGGCAAGTGTTTCATCATCAGTTGCTAAAAACAGTTCCTCATCAGGCACATCCTTACTGA  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAAACTAGTTCAGAGGCAAGTGTTTCATCATCAGTTGCTAAAAACAGTTCCTCATCAGGCACATCCTTACTGA  1036

Query 1034  CTCCCAAGAGCAGCTCTTCAACAAATACATCGCTGCTAACTTCCAAGAGCACTTCCCAGGTAGCTGCATCACTA  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCCCAAGAGCAGCTCTTCAACAAATACATCGCTGCTAACTTCCAAGAGCACTTCCCAGGTAGCTGCATCACTA  1110

Query 1108  CTAGCTTCCAAGAGCAGCTCCCAGACCAGTGGATCTCTGGTTTCCAAAAGCACTTCCTTAGCAAGTGTGTCCCA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTAGCTTCCAAGAGCAGCTCCCAGACCAGTGGATCTCTGGTTTCCAAAAGCACTTCCTTAGCAAGTGTGTCCCA  1184

Query 1182  GTTGGCTTCTAAGAGTAGTTCTCAGACTAGCACCTCACAGTTGCCTTCTAAAAGTACTTCACAGTCAAGTGAGA  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTTGGCTTCTAAGAGTAGTTCTCAGACTAGCACCTCACAGTTGCCTTCTAAAAGTACTTCACAGTCAAGTGAGA  1258

Query 1256  GTTCTGTCAAATTCTCTTGCAAGTTAACCAATGAAGATGTGAAACAGAAGCAACCTTTTTTCAATAGACTATAT  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTTCTGTCAAATTCTCTTGCAAGTTAACCAATGAAGATGTGAAACAGAAGCAACCTTTTTTCAATAGACTATAT  1332

Query 1330  AAAACGGTGGCATGGAAGTTGGTAGCTGTTGGTGGCTTTAGTCCCAATGTGAATCATGGAGAGCTCCTAAATGC  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAACGGTGGCATGGAAGTTGGTAGCTGTTGGTGGCTTTAGTCCCAATGTGAATCATGGAGAGCTCCTAAATGC  1406

Query 1404  AGCTATTGAGGCTCTGAAAGCAACACTGGATGTATTTTTTGTCCCACTAAAAGAATTGGCAGATCTGCCTCAAA  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCTATTGAGGCTCTGAAAGCAACACTGGATGTATTTTTTGTCCCACTAAAAGAATTGGCAGATCTGCCTCAAA  1480

Query 1478  ATAAGAGCTCTCAAGAAAGTATTGTTTGTGAATTGAGGTGCAAGTCTGTGTATTTGGGCACTGGCTGTGGAAAA  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATAAGAGCTCTCAAGAAAGTATTGTTTGTGAATTGAGGTGCAAGTCTGTGTATTTGGGCACTGGCTGTGGAAAA  1554

Query 1552  AGCAAAGAAAATGCAAAAGCAGTTGCATCAAGAGAAGCATTGAAGTTATTTCTCAAGAAAAAGGTGGTGGTAAA  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCAAAGAAAATGCAAAAGCAGTTGCATCAAGAGAAGCATTGAAGTTATTTCTCAAGAAAAAGGTGGTGGTAAA  1628

Query 1626  AATATGTAAAAGGAAATACAGAGGCAGTGAAATAGAAGATCTAGTACTCCTTGATGAAGAATCGAGGCCTGTAA  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AATATGTAAAAGGAAATACAGAGGCAGTGAAATAGAAGATCTAGTACTCCTTGATGAAGAATCGAGGCCTGTAA  1702

Query 1700  ACTTACCTCCAGCACTAAAACATCCTCAAGAATTACTA  1737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACTTACCTCCAGCACTAAAACATCCTCAAGAATTACTA  1740