Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473292
• Subject: NM_001144894.2
• Aligned Length: 1212
• Identities: 952
• Gaps: 183

Alignment

Query    1  ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCTTGGATT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct    1  ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTG-----------------------------  45

Query   75  CCGACAGACTCGAGGATACAAGAGCTTAGCAGGGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCT  148
                                                                                      
Sbjct   46  --------------------------------------------------------------------------  45

Query  149  TCACGCTCTTGGCTGGGCTCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAA  222
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   46  -----------------------------GTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAA  90

Query  223  GACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   91  GACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGA  164

Query  297  GATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  165  GATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCT  238

Query  371  ACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  239  ACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAG  312

Query  445  GAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  313  GAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGATGCAGGAGATCTACCAGGAGCT  386

Query  519  GACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGG  592
            |||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  387  GACTCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCC  460

Query  593  AGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTG  666
            .||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  461  GGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTG  534

Query  667  AAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGAC  740
            ||||||||||||||||||.|.|||||..|.||.|||||||||.|.|||||.||.||.||||||.|..|||||.|
Sbjct  535  AAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGC  608

Query  741  TGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTA  814
            ||||.|.|||||||||||||.||.|||||||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  609  TGCAGTGGAACGCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTA  682

Query  815  ACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACT  888
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  683  ACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGT  756

Query  889  GCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct  757  GCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTTCAGATCT  830

Query  963  AAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|||.||||||||.|
Sbjct  831  AAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTTGCCCAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAG  904

Query 1037  GAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGAC  1110
            ||||.||||||||....|||.|.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.|...||||.|.
Sbjct  905  GAGAGCCCAACAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAATGGCTGGAACGACGACAAATGTAAT  978

Query 1111  GTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAG---CCTGCTTCAGAGACGAA--------------------  1161
            .|||.|||.|.||||||||||||||||.||||||   ||||||.|||.||.|||                    
Sbjct  979  CTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCCTCCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGC  1052

Query 1162  ----------------------------  1161
                                        
Sbjct 1053  CCCTGCCACCCCAAACCCCCCTCCTGCG  1080