Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473292
• Subject: XR_936147.2
• Aligned Length: 1394
• Identities: 1131
• Gaps: 235

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ACCCAGCTTCCTGTTTGTCTTCCTGAGAGACAGTAGATTTAGAAAGTGAGGATCAGAGGGTGGAAAATAAAAGC  74

Query    1  --------------------------------------------ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAG  30
                                                        |||||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct   75  TGTGGTCCCCAGGAGTCCTGAACATCTGGGGACAGCGGGAAAACATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAG  148

Query   31  CAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGG----AACAGCTGAGAGGCCTTGGA----TTCCGACAGAC-------TCGAG-  88
            |||||||||||||||||.||.|    ||||.| .||.|||.|..||    ||||.|.||||       ||.|| 
Sbjct  149  CAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAAC-CAGTGGCATCAGACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGC  221

Query   89  -GAT--------ACAAGAGCT-TAGCAGGGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCAC  152
             |||        ||||||||| || |||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  222  AGATACATGGCCACAAGAGCTCTA-CAGGGTGTCTTGGCCATGGCGCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCAT  294

Query  153  GCTCTTGGCTGGG------------CTCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAAT  214
            |||||||||||||            .||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  295  GCTCTTGGCTGGGGTCCTGGTGGCCATCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAAT  368

Query  215  CCAGGCAAGACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAG  288
            ||..|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  CCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAG  442

Query  289  CTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCA  362
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||
Sbjct  443  CTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCA  516

Query  363  GGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGA  436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  517  GGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGA  590

Query  437  TCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTAC  510
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  TCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTAC  664

Query  511  CAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGA  584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  CAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGA  738

Query  585  GCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGA  658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  GCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGA  812

Query  659  CCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGAT  732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  CCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGAT  886

Query  733  TTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTT  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  TTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTT  960

Query  807  CATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAA  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  CATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAA  1034

Query  881  TCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTT  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  TCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTT  1108

Query  955  TCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTG  1028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  TCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTG  1182

Query 1029  GAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATC  1102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  GAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATC  1256

Query 1103  GATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTGCTTCAGAGACGAA---------------  1161
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct 1257  GATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTGCTTCAGAGACGAATAGTTGTTTCCCTGC  1330

Query 1162  --------------------------------------------------------------  1161
                                                                          
Sbjct 1331  TAGCCTCAGCCTCCATTGTGGTATAGCAGAACTTCACCCACTTGCTGGAGTGCAATGGCACG  1392