Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473331
- Subject:
- NM_053281.3
- Aligned Length:
- 1812
- Identities:
- 1358
- Gaps:
- 432
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTGTCTCCGCATCTCCAGTGATCTCTGCAACTTCCAGCGGCGCCGGCGTCCCGGGGGGCTTATTCCGGGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGAACCCCTGTACTCGACTCCCAGAGAGCCCCCTCGTCTTACTCCTAATATGATCAATAGTTTCGTGGTTAATA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ACCACAGCAACAGTGCCGGAGGCGGCGGCAGGGGCAACACCAACACCAACGAGTGCCGCATGGTCGACATGCAC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GGGATGAAGGTGGCTTCGTTCCTGATGGACGGCCAGGAACTGATCTGCCTGCCGCAAGTCTTTGATCTTTTTCT 296
Query 1 ----------ATGCCAGAGTTTCGCTCTGT-TGC-CCAGGCTGCAGTG--------------CAGTGGTGT--- 45
.||..||..||.|.|.|||| |.| |||.||||.||.| |.|||||||
Sbjct 297 CAAGCACCTGGTGGGAGGCTTGCACACTGTGTACACCAAGCTGAAGAGACTGGATATATCCCCCGTGGTGTGTA 370
Query 46 ----------------GATCTT-----GGCT-------------------------CGCTGC-AACTTCCGCCT 72
||||.| |||| |||||| |||| |.|
Sbjct 371 CTGTTGAGCAGGTCCGGATCCTCCGCGGGCTGGGGGCCATCCAGCCCGGGGTAAACCGCTGCAAACT----CAT 440
Query 73 C-CCAGGTTCAAGGGATTC------TTGTGCCTCAGCCTCCCGAGT-----------AGCTGGAA--------- 119
| ||||| ||.|..||| |||| ||| ||||.| ||..||||
Sbjct 441 CACCAGG---AAAGACTTCGAAACTTTGT---TCA-----CCGATTGCACCAATGCCAGAAGGAAGAGGCAAAT 503
Query 120 ------------------TTACAGTTCAAGACCCGGCAGGCCCCCTAAGCGTTCTTTGGGAGTGTTGCAGGAAA 175
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 504 GACAAGAAAACAAGCTGTTAACAGTTCAAGACCCGGCAGGCCCCCTAAGCGTTCTTTGGGAGTGTTGCAGGAAA 577
Query 176 ATGCCCGCCTTCTGACCCATGCAGTCCCAGGCCTCTTATCGCCAGGACTTATCACTCCGACAGGTATAACAGCT 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 578 ATGCCCGCCTTCTGACCCATGCAGTCCCAGGCCTCTTATCGCCAGGACTTATCACTCCGACAGGTATAACAGCT 651
Query 250 GCAGCGATGGCTGAGGCGATGAAACTTCAGAAGATGAAGCTTATGGCTATGAACACTCTTCAGGGAAATGGAAG 323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 652 GCAGCGATGGCTGAGGCGATGAAACTTCAGAAGATGAAGCTTATGGCTATGAACACTCTTCAGGGAAATGGAAG 725
Query 324 CCAAAATGGGACCGAATCAGAGCCTGATGATCTTAATTCTAACACAGGTGGAAGTGAATCCTCCTGGGATAAAG 397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 726 CCAAAATGGGACCGAATCAGAGCCTGATGATCTTAATTCTAACACAGGTGGAAGTGAATCCTCCTGGGATAAAG 799
Query 398 ATAAGATGCAGTCTCCATTTGCTGCACCTGGACCCCAACATGGAATTGCTCATGCAGCCCTAGCTGGCCAGCCA 471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 800 ATAAGATGCAGTCTCCATTTGCTGCACCTGGACCCCAACATGGAATTGCTCATGCAGCCCTAGCTGGCCAGCCA 873
Query 472 GGCATTGGGGGTGCTCCAACCCTCAATCCACTGCAGCAGAACCACCTGCTAACCAATAGACTGGATCTGCCATT 545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 874 GGCATTGGGGGTGCTCCAACCCTCAATCCACTGCAGCAGAACCACCTGCTAACCAATAGACTGGATCTGCCATT 947
Query 546 TATGATGATGCCTCATCCCCTACTTCCAGTCAGCTTACCTCCTGCATCAGTTGCCATGGCAATGAATCAGATGA 619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 948 TATGATGATGCCTCATCCCCTACTTCCAGTCAGCTTACCTCCTGCATCAGTTGCCATGGCAATGAATCAGATGA 1021
Query 620 ACCATCTCAATACTATTGCCAACATGGCTGCTGCAGCACAGATTCACAGTCCACTCTCCAGAGCTGGTACCTCT 693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 ACCATCTCAATACTATTGCCAACATGGCTGCTGCAGCACAGATTCACAGTCCACTCTCCAGAGCTGGTACCTCT 1095
Query 694 GTTATAAAGGAGCGGATCCCAGAGAGTCCTTCTCCTGCTCCTTCTCTAGAAGAGAATCATCGTCCTGGGAGCCA 767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096 GTTATAAAGGAGCGGATCCCAGAGAGTCCTTCTCCTGCTCCTTCTCTAGAAGAGAATCATCGTCCTGGGAGCCA 1169
Query 768 GACCTCTTCCCACACCAGCAGCAGTGTGTCCAGCTCTCCCTCTCAGATGGATCATCATTTGGAAAGAATGGAAG 841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170 GACCTCTTCCCACACCAGCAGCAGTGTGTCCAGCTCTCCCTCTCAGATGGATCATCATTTGGAAAGAATGGAAG 1243
Query 842 AGGTACCAGTTCAAATTCCAATAATGAAGTCACCCTTGGACAAGATACAGCTGACTCCTGGGCAGGCATTGCCC 915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1244 AGGTACCAGTTCAAATTCCAATAATGAAGTCACCCTTGGACAAGATACAGCTGACTCCTGGGCAGGCATTGCCC 1317
Query 916 GCTGGATTCCCTGGACCATTCATTTTTGCTGATAGTCTGTCCTCCGTGGAGACTCTGTTGACCAACATTCAGGG 989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 GCTGGATTCCCTGGACCATTCATTTTTGCTGATAGTCTGTCCTCCGTGGAGACTCTGTTGACCAACATTCAGGG 1391
Query 990 TCTGCTGAAAGTTGCTTTGGATAATGCTCGCATCCAGGAGAAGCAGATTCAACAAGAAAAGAAGGAGCTGCGAC 1063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1392 TCTGCTGAAAGTTGCTTTGGATAATGCTCGCATCCAGGAGAAGCAGATTCAACAAGAAAAGAAGGAGCTGCGAC 1465
Query 1064 TGGAGCTCTATAGAGAGAGAGAAATTAGAGAAAACCTTGAAAGACAACTTGCAGTTGAGCTTCAAAGCAGAACT 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466 TGGAGCTCTATAGAGAGAGAGAAATTAGAGAAAACCTTGAAAGACAACTTGCAGTTGAGCTTCAAAGCAGAACT 1539
Query 1138 ACTATGCAAAAGCGCCTGAAGAAGGAGAAAAAAACCAAGAGAAAATTGCAGGAAGCCTTGGAATTTGAATCAAA 1211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1540 ACTATGCAAAAGCGCCTGAAGAAGGAGAAAAAAACCAAGAGAAAATTGCAGGAAGCCTTGGAATTTGAATCAAA 1613
Query 1212 GCGCCGGGAGCAAGTGGAGCAGGCACTTAAGCAAGCCACCACTAGTGACAGTGGCCTGAGGATGTTAAAAGATA 1285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 GCGCCGGGAGCAAGTGGAGCAGGCACTTAAGCAAGCCACCACTAGTGACAGTGGCCTGAGGATGTTAAAAGATA 1687
Query 1286 CTGGAATTCCAGATATTGAAATAGAAAACAATGGGACTCCTCATGATAGTGCTGCTATGCAAGGAGGTAACTAT 1359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688 CTGGAATTCCAGATATTGAAATAGAAAACAATGGGACTCCTCATGATAGTGCTGCTATGCAAGGAGGTAACTAT 1761
Query 1360 TACTGTTTAGAAATGGCACAACAGTTGTATTCAGCC 1395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1762 TACTGTTTAGAAATGGCACAACAGTTGTATTCAGCC 1797
