Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473453
- Subject:
- XM_006510903.4
- Aligned Length:
- 1851
- Identities:
- 1585
- Gaps:
- 87
Alignment
Query 1 ATGTCGGGACGAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTTACAGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC 74
||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGGGCCAAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTGACTGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC 74
Query 75 GGTCTGCAAAGCCACTACTCATGAAGTAATGGGCCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA 148
.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTCTGCAAAGCCACCACTCATGAGGTGATGGGCCCCAAGAAGAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA 148
Query 149 ACGAGACCAATGTTAATATTCCTCAGATGGCCGACACTCTCTTTGAGCGGGCAACAAACAGTAGCTGGGTGGTT 222
|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 149 ATGAGACCAATGTCAATATCCCTCAGATGGCCGACACCCTCTTTGAGCGGGCGACAAACAGTAGCTGGGTGGTG 222
Query 223 GTGTTTAAGGCTTTAGTGACAACACATCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAATATTTGGCTTC 296
||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 223 GTATTTAAAGCTTTAGTGACCACACACCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAGTATTTGGCCTC 296
Query 297 TAGAAATACACTATTCAATCTCAGCAATTTTTTGGACAAAAGTGGATCCCATGGTTATGATATGTCTACCTTCA 370
|||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 TAGGAATACGCTATTCAATCTCAGCAACTTTCTAGATAAAAGTGGATCCCACGGTTATGATATGTCTACGTTCA 370
Query 371 TAAGGCGCTATAGTAGATATTTGAATGAAAAGGCTTTTTCTTACAGACAGATGGCCTTTGATTTTGCCAGGGTG 444
||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 371 TACGGCGTTACAGTAGATACTTGAATGAAAAGGCTTTCTCCTACAGACAGATGGCATTTGACTTTGCCAGAGTG 444
Query 445 AAGAAAGGGGCCGATGGTGTAATGAGGACAATGGCTCCCGAAAAGCTGCTAAAGAGTATGCCAATACTACAGGG 518
|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||.|||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 445 AAGAAAGGGGCTGACGGTGTCATGAGGACGATGGTTCCTGAAAAGCTCCTGAAGAGTATGCCAATCCTGCAGGG 518
Query 519 ACAAATTGATGCACTGCTTGAATTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACAAATGGTGTCATAAATGCAGCATTTA 592
.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 GCAGATCGATGCACTGCTGGAGTTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACCAATGGTGTCATAAATGCTGCATTTA 592
Query 593 TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTTTTTGCTTGCTACAATGATGGTGTTATTAACTTACTCGAAAAGTTT 666
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 593 TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTGTTTGCTTGCTACAATGACGGCGTCATTAACTTACTTGAAAAATTT 666
Query 667 TTTGAAATGAAGAAAGGACAATGTAAAGATGCTCTAGAAATTTACAAACGATTTCTAACTAGAATGACACGAGT 740
||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||
Sbjct 667 TTCGAGATGAAGAAAGGTCAATGCAAAGACGCGCTAGAAATTTACAAGCGATTTCTAACTAGAATGACGAGGGT 740
Query 741 GTCTGAATTTCTCAAGGTTG------------------------------------------CAGAGGCTCCCA 772
|||||||||.||||||||.| ||.|||||||||
Sbjct 741 GTCTGAATTCCTCAAGGTCGCCGAGCAAGTTGGTATTGATAAAGGTGACATTCCCGACCTCACACAGGCTCCCA 814
Query 773 GCAGTCTTATGGAGACGCTTGAACAGCATCTAAATACATTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAA------ATCT 840
||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 815 GCAGTCTTATGGAGACCCTTGAACAACATCTAAATACCCTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAATGAAGGATCT 888
Query 841 GGTGCTCCCTCTCCATTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACGTCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAAC 914
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGTGCTCCCTCTCCACTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACATCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAAC 962
Query 915 TATTGACACATCCCCACCGGTTGATTTATTTGCAACTGCATCTGCGGCTGTCCCAGTCAGCACTTCTAAACCAT 988
|||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||.||.||||.||||
Sbjct 963 TATCGACACATCCCCGCCAGTTGACATATTTGCAACAGCATCCGCGGCTGCCCCAGTCAGCTCTGCTAAGCCAT 1036
Query 989 CTAGTGATCTCCTGGACCTCCAGCCAGACTTTTCCTCTGGAGGGGCAGCAGCAGCCGCAGCACCAGCACC---A 1059
|.||.||||||||.||.||.|||||.||||| |||||| ||||||.||.|..|||.||||||| |
Sbjct 1037 CAAGCGATCTCCTTGATCTTCAGCCCGACTT---CTCTGG------AGCAGCTGCGGGGGCAGCAGCACCTGTA 1101
Query 1060 CCACCACCTGCTGGAGGAGCCACTGCATGGGGAGGATTTGGGGGTTCTTTCATGGCGCCTTCCCCATCTCCAGT 1133
...||.|||.||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||.|.|||||
Sbjct 1102 GTGCCTCCTTCTGGGGGTGCGACCGCCTGGGGAGGATTTGGGGGTTCTTTCATGGCCCCTTCTACAACGCCAGT 1175
Query 1134 GACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTACAGCCCAATTTTGAGGCAGCTTTTGGGACAACGCCTTCAACTTCCAGCA 1207
||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1176 GACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTGCAACCCAGTTTCGAGGCAGCTTTTGGAACGACGCCTTCGACTTCAAGCA 1249
Query 1208 GCAGCTCCTTTGATCCATCAGTGTTTGATGGTCTAGGTGATCTTTTGATGCCAACCATGGCACCAGCTGGGCAG 1281
|||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct 1250 GCAGCTCTTTTGACCCATCAGTGTTTGATGGTTTAGGCGATCTTCTGATGCCAACCATGGCACCATCCGGGCAG 1323
Query 1282 CCTGCACCTGTCTCAATGGTACCACCCAGTCCTGCAATGGCAGCCAGCAAAGCCCTTGGAAGTGATCTTGATTC 1355
|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1324 CCTGCCCCTGTCTCAATGGTCCCACCCAGTCCTGCAATGGCAGCCAGCAAAGGCCTCGGAAGTGACCTTGACTC 1397
Query 1356 ATCTCTTGCCAGCTTAGTAGGCAATCTTGGAATTTCTGGTACCACAACAAAAAAGGGAGATCTTCAGTGGAATG 1429
.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1398 GTCTCTGGCCAGTTTAGTAGGCAATCTTGGGATTTCTGGTACCACATCAAAAAAGGGAGATCTCCAGTGGAATG 1471
Query 1430 CTGGAGAGAAAAAGTTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAGCCTAAAGTAGCTCCAGCAACCTGGTCAGCAGGCGTT 1503
||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||..|||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 1472 CTGGGGAGAAAAAGCTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAACCGAAAGTCACTCCAGCCACATGGTCAGCGGGTGTT 1545
Query 1504 CCACCAAGTGCACCTTTGCAAGGAGCTGTACCTCCAACCAGTTCAGTTCCTCCTGTTGCCGGGGCCCCATCGGT 1577
||.|| ||||||..||||.||.||||||||.|||||.|||||.|.||||||||||||.||.||
Sbjct 1546 CCCCC------------GCAAGGCACTGTTCCACCAACCAGCTCAGTCCCTCCGGGTGCCGGGGCCCCGTCCGT 1607
Query 1578 TGGACAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTGCTGGGACAGGCATGCCCATGATGCCTCAGCAGCCGGTCA 1651
|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||.||||||||||.||||
Sbjct 1608 TGGGCAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTTCAGGGACAGGCATGACCATGATGTCTCAGCAGCCAGTCA 1681
Query 1652 TGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCCCCCTTTGGAGCTGCCGCTGTACCTGGCACGCAGCTTTCTCCAAGCCCT 1725
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1682 TGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCACCCTTTGGAGCTGCAGCTGTGCCCGGCACACAGCTTTCTCCAAGCCCT 1755
Query 1726 ACACCTGCCAGTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCAAAGGACCCATTAGCGGATCTTAAC-------------- 1785
||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1756 ACACCTGCCACTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCCAAGGACCCGTTAGCGGATCTTAACATCAAGGATTTCTT 1829
Query 1786 - 1785
Sbjct 1830 G 1830