Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473723
- Subject:
- XM_011542644.1
- Aligned Length:
- 1449
- Identities:
- 1320
- Gaps:
- 129
Alignment
Query 1 ATGAGCACGGCCAGAACAGAGAACCCTGTTATAATGGGTCTGTCCAGTCAAAATGGTCAGCTGAGAGGCCCTGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCACGGCCAGAACAGAGAACCCTGTTATAATGGGTCTGTCCAGTCAAAATGGTCAGCTGAGAGGCCCTGT 74
Query 75 GAAACCCACTGGTGGCCCTGGAGGAGGGGGCACACAGACACAGCAACAGATGAACCAGCTGAAAAACACCAACA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAACCCACTGGTGGCCCTGGAGGAGGGGGCACACAGACACAGCAACAGATGAACCAGCTGAAAAACACCAACA 148
Query 149 CAATCAATAATGGCACTCAGCAGCAAGCACAGAGTATGACCACCACTATTAAACCTGGTGATGACTGGAAAAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAATCAATAATGGCACTCAGCAGCAAGCACAGAGTATGACCACCACTATTAAACCTGGTGATGACTGGAAAAAG 222
Query 223 ACTTTAAAACTCCCTCCAAAGGATCTAAGAATCAAAACTTCGGATGTGACCTCCACAAAAGGAAATGAGTTTGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACTTTAAAACTCCCTCCAAAGGATCTAAGAATCAAAACTTCGGATGTGACCTCCACAAAAGGAAATGAGTTTGA 296
Query 297 AGATTACTGTTTGAAACGGGAGTTACTGATGGGAATTTTTGAAATGGGCTGGGAAAAGCCATCTCCTATTCAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGATTACTGTTTGAAACGGGAGTTACTGATGGGAATTTTTGAAATGGGCTGGGAAAAGCCATCTCCTATTCAGG 370
Query 371 AGGAGAGCATTCCCATTGCTTTATCTGGTAGGGATATCTTAGCTAGAGCAAAAAATGGAACAGGCAAGAGCGGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGAGAGCATTCCCATTGCTTTATCTGGTAGGGATATCTTAGCTAGAGCAAAAAATGGAACAGGCAAGAGCGGT 444
Query 445 GCCTACCTCATTCCCTTACTTGAACGGCTAGACCTGAAGAAGGACAATATACAAGCAATGGTGATTGTTCCCAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCCTACCTCATTCCCTTACTTGAACGGCTAGACCTGAAGAAGGACAATATACAAGCAATGGTGATTGTTCCCAC 518
Query 519 TAGAGAACTTGCTCTACAGGTCAGTCAAATTTGCATCCAGGTCAGCAAACACATGGGAGGGGCCAAAGTGATGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TAGAGAACTTGCTCTACAGGTCAGTCAAATTTGCATCCAGGTCAGCAAACACATGGGAGGGGCCAAAGTGATGG 592
Query 593 CAACCACAGGAGGAACCAATTTACGAGATGACATAATGAGGCTTGATGATACAGTGCACGTGGTGATTGCTACC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAACCACAGGAGGAACCAATTTACGAGATGACATAATGAGGCTTGATGATACAGTGCACGTGGTGATTGCTACC 666
Query 667 CCTGGGAGAATCCTGGATCTTATTAAGAAAGGAGTAGCAAAGGTTGATCATGTCCAGATGATAGTATTGGATGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCTGGGAGAATCCTGGATCTTATTAAGAAAGGAGTAGCAAAGGTTGATCATGTCCAGATGATAGTATTGGATGA 740
Query 741 GGCAGATAAGTTGCTGTCACAGGATTTTGTGCAGATAATGGAGGATATTATTCTCACGCTACCTAAAAACAGGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCAGATAAGTTGCTGTCACAGGATTTTGTGCAGATAATGGAGGATATTATTCTCACGCTACCTAAAAACAGGC 814
Query 815 AGATTTTACTATATTCCGCTACTTTCCCTCTTAGTGTACAGAAGTTCATGAATTCCCATTTGCAGAAACCCTAT 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGATTTTACTATATTCCGCTACTTTCCCTCTTAGTGTACAGAAGTTCAT------------------------- 863
Query 889 GAGATTAACCTGATGGAGGAACTAACTCTGAAGGGAGTAACCCAGTACTACGCATATGTAACTGAGCGCCAAAA 962
Sbjct 864 -------------------------------------------------------------------------- 863
Query 963 AGTACACTGCCTCAACACACTTTTCTCCAGGCTTCAGATAAACCAGTCGATCATTTTCTGTAACTCCTCTCAGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 864 ------------------------------GCTTCAGATAAACCAGTCGATCATTTTCTGTAACTCCTCTCAGC 907
Query 1037 GAGTTGAATTGCTAGCCAAGAAGATTTCTCAACTGGGTTATTCTTGCTTCTATATTCATGCTAAAATGAGGCAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 908 GAGTTGAATTGCTAGCCAAGAAGATTTCTCAACTGGGTTATTCTTGCTTCTATATTCATGCTAAAATGAGGCAG 981
Query 1111 GAACATCGAAATCGTGTATTTCATGATTTCCGAAATGGCTTATGCCGCAATCTTGTTTGCACTGATCTGTTTAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 982 GAACATCGAAATCGTGTATTTCATGATTTCCGAAATGGCTTATGCCGCAATCTTGTTTGCACTGATCTGTTTAC 1055
Query 1185 CCGAGGTATTGATATACAAGCTGTGAATGTGGTAATAAACTTTGATTTCCCAAAGCTGGCAGAGACCTATCTCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056 CCGAGGTATTGATATACAAGCTGTGAATGTGGTAATAAACTTTGATTTCCCAAAGCTGGCAGAGACCTATCTCC 1129
Query 1259 ATCGTATTGGAAGATCAGGTCGCTTTGGTCATCTTGGCTTAGCCATCAACTTGATCACATATGATGATCGCTTC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130 ATCGTATTGGAAGATCAGGTCGCTTTGGTCATCTTGGCTTAGCCATCAACTTGATCACATATGATGATCGCTTC 1203
Query 1333 AACCTGAAAAGTATTGAGGAGCAGCTGGGAACAGAAATTAAACCTATTCCGAGCAACATTGATAAGAGCCTGTA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204 AACCTGAAAAGTATTGAGGAGCAGCTGGGAACAGAAATTAAACCTATTCCGAGCAACATTGATAAGAGCCTGTA 1277
Query 1407 TGTGGCAGAATACCACAGCGAGCCTGTAGAAGATGAGAAACCT 1449
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278 TGTGGCAGAATACCACAGCGAGCCTGTAGAAGATGAGAAACCT 1320