Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473792
• Subject: XM_011245520.1
• Aligned Length: 993
• Identities: 791
• Gaps: 96

Alignment

Query   1  ATGGAGACGGTCATTTCTTCAGATAGCTCCCCAGCTGTGGAAAATGAGCATCCTCAAGAGACCCCAGAATCCAA  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  CAATAGCGTGTATACTTCCTTCATGAAGTCTCATCGCTGCTATGACCTGATTCCCACAAGCTCCAAATTGGTTG  148
                                 ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct   1  ----------------------ATGAAGTCTCATCGCTGCTATGACCTAATTCCCACAAGTTCCAAGTTGGTGG  52

Query 149  TATTTGATACGTCCCTGCAGGTGAAGAAAGCTTTTTTTGCTTTGGTGACTAACGGTGTACGAGCTGCCCCTTTA  222
           |||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||..|||||||.||.|||||.||.||.||||||||.
Sbjct  53  TATTTGACACTTCGCTACAGGTAAAGAAAGCCTTTTTTGCCCTGGTGACCAATGGTGTTCGTGCCGCCCCTTTG  126

Query 223  TGGGATAGTAAGAAGCAAAGTTTTGTGGGCATGCTGACCATCACTGATTTCATCAATATCCTGCACCGCTACTA  296
           |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||..|||||||.|||||
Sbjct 127  TGGGACAGTAAGAAGCAGAGTTTTGTGGGCATGCTGACCATCACCGACTTCATCAACATTTTGCACCGATACTA  200

Query 297  TAAATCAGCCTTGGTACAGATCTATGAGCTAGAAGAACACAAGATAGAAACTTGGAGAGAGGTGTATCTCCAGG  370
           |||.||||||.||||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 201  TAAGTCAGCCCTGGTGCAGATCTACGAACTGGAGGAGCACAAGATAGAGACGTGGAGAGAGGTGTACCTGCAGG  274

Query 371  ACTCCTTTAAACCGCTTGTCTGCATTTCTCCTAATGCCAGCTTGTTTGATGCTGTCTCTTCATTAATTCGGAAC  444
           ||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 275  ACTCCTTTAAGCCACTTGTCTGCATCTCTCCAAATGCCAGCTTGTTTGATGCTGTCTCTTCATTAATTCGAAAT  348

Query 445  AAGATCCACAGGCTGCCAGTTATTGACCCAGAATCAGGCAATACTTTGTACATCCTCACCCACAAGCGCATTCT  518
           ||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 349  AAGATCCACAGGCTCCCAGTTATCGACCCAGAGTCAGGCAACACCTTGTACATCCTTACTCACAAGCGGATCCT  422

Query 519  GAAGTTCCTCAAATTGTTTATCACTGAGTTCCCCAAGCCAGAGTTCATGTCCAAGTCTCTGGAAGAGCTACAGA  592
           .|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||..|||||||.||||
Sbjct 423  CAAGTTCCTCAAGTTGTTTATCACCGAGTTCCCCAAGCCGGAATTCATGTCTAAGTCTCTCCAAGAGCTGCAGA  496

Query 593  TTGGCACCTATGCCAATATTGCTATGGTTCGCACTACCACCCCCGTCTATGTGGCTCTGGGGATTTTTGTACAG  666
           ||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 497  TTGGCACCTATGCCAATATTGCCATGGTCCGTACTACCACGCCTGTCTACGTGGCTCTGGGCATCTTTGTACAG  570

Query 667  CATCGAGTCTCAGCCCTGCCAGTGGTGGATGAGAAGGGGCGTGTGGTGGACATCTACTCCAAGTTTGATGTTAT  740
           ||.||||||||.|||.|.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 571  CACCGAGTCTCCGCCTTACCTGTAGTGGATGAGAAAGGGCGTGTGGTGGACATCTACTCCAAGTTTGATGTGAT  644

Query 741  CAATCTGGCAGCAGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTATCTGTGACTAAAGCCTTGCAACATCGATCACATT  814
           ||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||.|||||.||.||.|
Sbjct 645  CAATTTGGCAGCCGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTGTCTGTGACAAAAGCCCTGCAGCATCGGTCCCACT  718

Query 815  ACTTTGAGGGTGTTCTCAAGTGCTACCTGCATGAGACTCTGGAGACCATCATCAACAGGCTAGTGGAAGCAGAG  888
           |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 719  ACTTTGAGGGTGTTCTCAAATGCTACCTGCATGAGACTCTGGAAACCATCATCAATAGGCTGGTGGAGGCAGAG  792

Query 889  GTTCACCGACTTGTAGTGGTGGATGAAAATGATGTGGTCAAGGGAATTGTATCACTGTCTGACATCCTGCAGGC  962
           ||||||||.||.||.||||||||||||.|.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||.|.|||||
Sbjct 793  GTTCACCGTCTGGTGGTGGTGGATGAACACGACGTGGTCAAGGGCATCGTTTCGCTGTCTGACATCTTACAGGC  866

Query 963  CCTGGTGCTCACAGGTGGAGAGAAGAAGCCC  993
           .|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 867  TCTGGTGCTCACGGGTGGAGAGAAGAAGCCC  897