Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473948
• Subject: XM_006715349.4
• Aligned Length: 1890
• Identities: 1549
• Gaps: 315

Alignment

Query    1  ATGGTACCTGTTGAAAACACCGAGGGCCCCAGTCTGCTGAACCAGAAGGGGACAGCCGTGGAGACGGAGGGCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTACCTGTTGAAAACACCGAGGGCCCCAGTCTGCTGAACCAGAAGGGGACAGCCGTGGAGACGGAGGGCAG  74

Query   75  CGGCAGCCGGCATCCTCCCTGGGCGAGAGGCTGCGGCATGTTTACCTTCCTGTCATCTGTCACTGCTGCTGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGCAGCCGGCATCCTCCCTGGGCGAGAGGCTGCGGCATGTTTACCTTCCTGTCATCTGTCACTGCTGCTGTCA  148

Query  149  GTGGCCTCCTGGTGGGTTATGAACTTGGGATCATCTCTGGGGCTCTTCTTCAGATCAAAACCTTATTAGCCCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGGCCTCCTGGTGGGTTATGAACTTGGGATCATCTCTGGGGCTCTTCTTCAGATCAAAACCTTATTAGCCCTG  222

Query  223  AGCTGCCATGAGCAGGAAATGGTTGTGAGCTCCCTCGTCATTGGAGCCCTCCTTGCCTCACTCACCGGAGGGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCTGCCATGAGCAGGAAATGGTTGTGAGCTCCCTCGTCATTGGAGCCCTCCTTGCCTCACTCACCGGAGGGGT  296

Query  297  CCTGATAGACAGATATGGAAGAAGGACAGCAATCATCTTGTCATCCTGCCTGCTTGGACTCGGAAGCTTAGTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGATAGACAGATATGGAAGAAGGACAGCAATCATCTTGTCATCCTGCCTGCTTGGACTCGGAAGCTTAGTCT  370

Query  371  TGATCCTCAGTTTATCCTACACGGTTCTTATAGTGGGACGCATTGCCATAGGGGTCTCCATCTCCCTCTCTTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGATCCTCAGTTTATCCTACACGGTTCTTATAGTGGGACGCATTGCCATAGGGGTCTCCATCTCCCTCTCTTCC  444

Query  445  ATTGCCACTTGTGTTTACATCGCAGAGATTGCTCCTCAACACAGAAGAGGCCTTCTTGTGTCACTGAATGAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGCCACTTGTGTTTACATCGCAGAGATTGCTCCTCAACACAGAAGAGGCCTTCTTGTGTCACTGAATGAGCT  518

Query  519  GATGATTGTCATCGGCATTCTTTCTGCCTATATTTCAAATTACGCATTTGCCAATGTTTTCCATGGCTGGAAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATGATTGTCATCGGCATTCTTTCTGCCTATATTTCAAATTACGCATTTGCCAATGTTTTCCATGGCTGGAAGT  592

Query  593  ACATGTTTGGTCTTGTGATTCCCTTGGGAGTTTTGCAAGCAATTGCAATGTATTTTCTTCCTCCAAGCCCTCGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACATGTTTGGTCTTGTGATTCCCTTGGGAGTTTTGCAAGCAATTGCAATGTATTTTCTTCCTCCAAGCCCTCGG  666

Query  667  TTTCTGGTGATGAAAGGACAAGAGGGAGCTGCTAGCAAGGTTCTTGGAAGGTTAAGAGCACTCTCAGATACAAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTCTGGTGATGAAAGGACAAGAGGGAGCTGCTAGCAAGGTTCTTGGAAGGTTAAGAGCACTCTCAGATACAAC  740

Query  741  TGAGGAACTCACTGTGATCAAATCCTCCCTGAAAGATGAATATCAGTACAGTTTTTGGGATCTGTTTCGTTCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAGGAACTCACTGTGATCAAATCCTCCCTGAAAGATGAATATCAGTACAGTTTTTGGGATCTGTTTCGTTCAA  814

Query  815  AAGACAACATGCGGACCCGAATAATGATAGGACTAACACTAGTATTTTTTGTACAAATCACTGGCCAACCAAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGACAACATGCGGACCCGAATAATGATAGGACTAACACTAGTATTTTTTGTACAAATCACTGGCCAACCAAAC  888

Query  889  ATATTGTTCTATGCATCAACTGTTTTGAAGTCAGTTGGATTTCAAAGCAATGAGGCAGCTAGCCTCGCCTCCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATATTGTTCTATGCATCAACTGTTTTGAAGTCAGTTGGATTTCAAAGCAATGAGGCAGCTAGCCTCGCCTCCAC  962

Query  963  TGGGGTTGGAGTCGTCAAGGTCATTAGCACCATCCCTGCCACTCTTCTTGTAGACCATGTTGGCAGCAAAACAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  TGGGGTTGGAGTCGTCAAGGTCATTAGCACCATCCCTGCCACTCTTCTTGTAGACCATGTCGGCAGCAAAACAT  1036

Query 1037  TCCTCTGCATTGGCTCCTCTGTGATGGCAGCTTCGTTGGTGACCATGGGCATCGTAAATCTCAACATCCACATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCTCTGCATTGGCTCCTCTGTGATGGCAGCTTCGTTGGTGACCATGGGCATCGTAAATCTCAACATCCACATG  1110

Query 1111  AACTTCACCCATATCTGCAGAAGCCACAATTCTATCAACCAGTCCTTGGATGAGTCTGTGATTTATGGACCAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACTTCACCCATATCTGCAGAAGCCACAATTCTATCAACCAGTCCTTGGATGAGTCTGTGATTTATGGACCAGG  1184

Query 1185  AAACCTGTCAACCAACAACAATACTCTCAGAGACCACTTCAAAGGGATTTCTTCCCATAGCAGAAGCTCACTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAACCTGTCAACCAACAACAATACTCTCAGAGACCACTTCAAAGGGATTTCTTCCCATAGCAGAAGCTCACTCA  1258

Query 1259  TGCCCCTGAGAAATGATGTGGATAAGAGAGGGGAGACGACCTCAGCATCCTTGCTAAATGCTGGATTAAGCCAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCCCCTGAGAAATGATGTGGATAAGAGAGGGGAGACGACCTCAGCATCCTTGCTAAATGCTGGATTAAGCCAC  1332

Query 1333  ACTGAATACCAGATAGTCACAGACCCTGGGGACGTCCCAGCTTTTTTGAAATGGCTGTCCTTAGCCAGCTTGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACTGAATACCAGATAGTCACAGACCCTGGGGACGTCCCAGCTTTTTTGAAATGGCTGTCCTTAGCCAGCTTGCT  1406

Query 1407  TGTTTATGTTGCTGCTTTTTCAATTGGTCTAGGACCAATGCCCTGGCTGGTGCTCAGCGAG-----ATCTTTCC  1475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    |||     ||||||  
Sbjct 1407  TGTTTATGTTGCTGCTTTTTCAATTGGTCTAGGACCAA--------------------GAGATGTTATCTTT--  1458

Query 1476  TGGTGGGATCAGAGGACGAGCCA-------TGGCTTTAACTTCT----AGCATGA-ACTGGGGCATCAATCTCC  1537
                   |||   |||| ||.||       ||.|.|   ||.||    ||..||| |||         ||||| 
Sbjct 1459  -------ATC---GGAC-AGTCAACAAACTTGCCCT---CTGCTCCAGAGGGTGACACT---------ATCTC-  1508

Query 1538  TCATCTCGCTGAC-ATTTTTGACTGTAACTGATCTTATTGGCCTGC--CATGGGTGTGCT-TTATATATACAAT  1607
             .|||||...||| ||||.|.| ||.|             ||||.|  ||.|     ||| |||||.|.|||..
Sbjct 1509  -TATCTCCAAGACTATTTATTA-TGCA-------------GCCTACAACAAG-----GCTATTATACAAACAGC  1562

Query 1608  CATG-------AGTCT--AGCA-------TCCCTGCTTTTTGTTGTTATGTTTATACC--TGAGACAAAGGGAT  1663
            |.||       ||.||  ||||       ||..|||.||||               ||  |.|||||       
Sbjct 1563  CTTGGAAAGACAGCCTAGAGCAAAGACAGTCAGTGCCTTTT---------------CCCATAAGACA-------  1614

Query 1664  GCTCTTTGGAACAAATATCAATGGAGCTAGCAAAAGTGAACTATGTGAAAAACAACATTTGTTTTATGAGTCAT  1737
                                                                                      
Sbjct 1615  --------------------------------------------------------------------------  1614

Query 1738  CACCAAGAAGAATTAGTGCCAAAACAGCCTCAAAAAAGAAAACCCCAGGAGCAGCTCTTGGAGTGTAACAAGCT  1811
                                                                                      
Sbjct 1615  --------------------------------------------------------------------------  1614

Query 1812  GTGTGGTAGGGGCCAATCCAGGCAGCTTTCTCCAGAGACC  1851
                                                    
Sbjct 1615  ----------------------------------------  1614