Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473994
• Subject: XM_017026289.1
• Aligned Length: 1095
• Identities: 877
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGACCCAAGACTGGGCCAAGAAAAGACAGCGCTGGGGAAGAGAGAGACAGAGGAGTCGGGGGGATAAGAG  74

Query    1  -----------------------------------------------ATGTCCTCTGCTCACTTCAACC-GAG-  25
                                                           |.|.||.|  ..||||  |||| ||| 
Sbjct   75  GGAGAGAGACATACAGACGTGCAAGGGGTGGGGGCTAAGACAGAGACAAGCCCCC--ACCACT--AACCAGAGA  144

Query   26  ----GCCCTG----------CCT-------ACGG---------GCTGT-----CAG------------------  46
                ||||||          |||       ||||         |.|||     |||                  
Sbjct  145  CAGAGCCCTGGAGCTGAAGACCTGGGGGACACGGAGAGACAGAGATGTATGACCAGCACTCCTCTGCAAGCCAG  218

Query   47  --CCGAGG---------TTAAGAACA-----------------AGCTGGCCCAGAAGTATGACCACCAGCGGGA  92
              ||.|||         |||  .|||                 |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  CACCCAGGGACACCTCCTTA--GACATCCTTCTTCCCTTCCTGAGCTGGCCCAGAAGTATGACCACCAGCGGGA  290

Query   93  GCAGGAGCTGAGAGAGTGGATCGAGGGGGTGACAGGCCGTCGCATCGGCAACAACTTCATGGACGGCCTCAAAG  166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  GCAGGAGCTGAGAGAGTGGATCGAGGGGGTGACAGGCCGTCGCATCGGCAACAACTTCATGGACGGCCTCAAAG  364

Query  167  ATGGCATCATTCTTTGCGAATTCATCAATAAGCTGCAGCCAGGCTCCGTGAAGAAGATCAATGAGTCAACCCAA  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  ATGGCATCATTCTTTGCGAATTCATCAATAAGCTGCAGCCAGGCTCCGTGAAGAAGATCAATGAGTCAACCCAA  438

Query  241  AATTGGCACCAGCTGGAGAACATCGGCAACTTCATCAAGGCCATCACCAAGTATGGGGTGAAGCCCCACGACAT  314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  AATTGGCACCAGCTGGAGAACATCGGCAACTTCATCAAGGCCATCACCAAGTATGGGGTGAAGCCCCACGACAT  512

Query  315  TTTTGAGGCCAACGACCTGTTTGAGAACACCAACCATACACAGGTGCAGTCCACCCTCCTGGCTTTGGCCAGCA  388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  TTTTGAGGCCAACGACCTGTTTGAGAACACCAACCATACACAGGTGCAGTCCACCCTCCTGGCTTTGGCCAGCA  586

Query  389  TGGCGAAGACGAAAGGAAACAAGGTGAACGTGGGAGTGAAGTACGCAGAGAAGCAGGAGCGGAAATTCGAGCCG  462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  TGGCGAAGACGAAAGGAAACAAGGTGAACGTGGGAGTGAAGTACGCAGAGAAGCAGGAGCGGAAATTCGAGCCG  660

Query  463  GGGAAGCTAAGAGAAGGGCGGAACATCATTGGGCTGCAGATGGGCACCAACAAGTTTGCCAGCCAGCAGGGCAT  536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GGGAAGCTAAGAGAAGGGCGGAACATCATTGGGCTGCAGATGGGCACCAACAAGTTTGCCAGCCAGCAGGGCAT  734

Query  537  GACGGCCTATGGCACCCGGCGCCACCTCTACGACCCCAAGCTGGGCACAGACCAGCCTCTGGACCAGGCGACCA  610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  GACGGCCTATGGCACCCGGCGCCACCTCTACGACCCCAAGCTGGGCACAGACCAGCCTCTGGACCAGGCGACCA  808

Query  611  TCAGCCTGCAGATGGGCACCAACAAAGGAGCCAGCCAGGCTGGCATGACTGCGCCAGGGACCAAGCGGCAGATC  684
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  TCAGCCTGCAGATGGGCACCAACAAAGGAGCCAGCCAGGCTGGCATGACTGCGCCAGGGACCAAGCGGCAGATC  882

Query  685  TTCGAGCCGGGGCTGGGCATGGAGCACTGCGACACGCTCAATGTCAGCCTGCAGATGGGCAGCAACAAGGGCGC  758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  TTCGAGCCGGGGCTGGGCATGGAGCACTGCGACACGCTCAATGTCAGCCTGCAGATGGGCAGCAACAAGGGCGC  956

Query  759  CTCGCAGCGGGGCATGACGGTGTATGGGCTGCCACGCCAGGTCTACGACCCCAAGTACTGTCTGACTCCCGAGT  832
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  CTCGCAGCGGGGCATGACGGTGTATGGGCTGCCACGCCAGGTCTACGACCCCAAGTACTGTCTGACTCCCGAGT  1030

Query  833  ACCCAGAGCTGGGTGAGCCCGCCCACAACCACCACGCACACAACTACTACAATTCCGCC  891
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  ACCCAGAGCTGGGTGAGCCCGCCCACAACCACCACGCACACAACTACTACAATTCCGCC  1089