Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474103
• Subject: XM_011527285.2
• Aligned Length: 2191
• Identities: 1549
• Gaps: 413

Alignment

Query    1  ATGATTTCACCTTCACTTGAACTGCTTCATTCAGGACTCTGCAAATTCCCTGAAGTAGAAGGAAAAATGACCAC  74
                                                                              ||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------------ATGACCAC  8

Query   75  ATTCAAAGAGGCAGTGACATTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTG  148
            .||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||.||
Sbjct    9  GTTGAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAAGAGCTGAGGCTGCTGGACCTTG  82

Query  149  CCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTAGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTAGGGAATCAACCATTC  222
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.||.||
Sbjct   83  CCCAGAGGAAACTGTACCGAGAAGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAATCACTC  156

Query  223  CACCAAGATACTTTCCACTT-CTTAGGGAAGGAAAAGTTTTGGAAGATGAAGACAACAAGCCAAAGAGAAGGGA  295
            |||..||||||||||||||| ||.|.|||| |||||||||||||.||||.|||||.|||.||||||||||||||
Sbjct  157  CACAGAGATACTTTCCACTTCCTAAAGGAA-GAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGA  229

Query  296  ATTCAGGAGGCAAGATCCAAATTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGAGTGGTCCTGTCAG  369
            |||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||..|.||.|.||||.
Sbjct  230  ATTTAGGAGGCAAGATCCAAATGGAGATGGAGACTGTTTCAGAATCAGGAACACATGAAGGCTTGTTCAGTCAT  303

Query  370  CAAATATGGGAACAAATTGCAAGTGACCTAACCAGGTCTCAAAACTCCATAAGG--AACAGCTCTCAGTTCTTC  441
            ||||..||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.|||||||  ||  |||||||.||||||||.|
Sbjct  304  CAAACCTGGGAACAAATTTCAAGTGACTTAACCAGGTTTCAAGACTCCAT--GGTAAACAGCTTTCAGTTCTCC  375

Query  442  AAAGAAGGTGATGTCCCCTGCCAGATTGAGGCAAGACTATCTATAAGTCACGTGCAACAGAAACCTTACCGTTG  515
            |||.|||.||||.|.|||||||||.||||.|||.||||||||||||.||||||...||||||||||| |.|..|
Sbjct  376  AAACAAGATGATATGCCCTGCCAGGTTGATGCAGGACTATCTATAATTCACGTAAGACAGAAACCTT-CTGAGG  448

Query  516  TAATGA-ATGTAAACAGTCCATCAGTGATGTTTCTGTCTTTGATCTTCATCAACAATCACACTCAGGAGAGAAA  588
            ..|.|| .||||||.|||||.|.||||||||.||.|||.|||||||||||||||||..|||.|||.|||||||.
Sbjct  449  GTAGGACGTGTAAAAAGTCCTTTAGTGATGTCTCCGTCCTTGATCTTCATCAACAACTACAGTCAAGAGAGAAG  522

Query  589  TCTCATACATGTGGTGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACAGCCCAGCCCTTCATATTCATCAGAGAGTCCATAT  662
            |||||||||||||.|||.||||||||.||.||||||||.|||.||||.||||.|||||||||||||||.||.||
Sbjct  523  TCTCATACATGTGATGAATGTGGAAAGAGTTTCTGTTATAGCTCAGCTCTTCGTATTCATCAGAGAGTTCACAT  596

Query  663  GGGAGAAAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAATCAGAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGA  736
            |||.||.|||..||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  597  GGGGGAGAAACTCTATAATTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTCAATCAGAGCTCACATCTGCAAATTCATCAGA  670

Query  737  GAGTCCATACTGGAGAGAAACCATTCAAACGTGGGCAATGTGGGAAAGGCTTCCATAGTAGATCAGCACTTAAT  810
            ||.||||.|||||||||||||||||||||.|||.|||.||||||||||||||...|.|||||||||.||||.||
Sbjct  671  GAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTTAGTCGTAGATCAGGACTTTAT  744

Query  811  GTTCATTGCAAATTGCACACAGGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGGAATGTGGGAAAGCCTTCATTCATGATTC  884
            ||||||.|.|||||.||||||||||.|||||||.|||.|||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  745  GTTCATCGTAAATTACACACAGGAGTGAAACCTCATATTTGTGAGAAATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGATTC  818

Query  885  ACAGCTTCAGGAACATCAGAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGAGCTTCC  958
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  819  CCAGCTTCAGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTTGTAAGAGCTTCC  892

Query  959  GTGTTAGATCAAGACTTAATAGGCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTCAGATGTGATACATGTGGC  1032
            ||..||||.|||..|||||||||||||||||||||||||...||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  893  GTAGTAGAGCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTTCACATGCGAGAGAAACCATTCAGATGTGATACATGTGGT  966

Query 1033  AAGAACTTTCGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATTCCATGGTCCACATAGAAGAGAAGCCATACAAATGTGA  1106
            ||||.||||.|||.||.|||||||||||||||||||..|||||||||||.||.||||||.|..|||||||||||
Sbjct  967  AAGAGCTTTGGTCTGAAATCAGCACTTAATAGTCATCGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACGGTACAAATGTGA  1040

Query 1107  GCAATGTGGAAAAGGCTTCATTTGTAGGCGAGATTTTTGTAAGCATCAGATGGTCCACACAGGAGAGAAACCAT  1180
            |.|||||||||||.|||||||||.|||||.||||.|||.||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||||
Sbjct 1041  GGAATGTGGAAAACGCTTCATTTATAGGCAAGATCTTTATAAGCATCAGATAGACCACACAGGGGAGAAGCCAT  1114

Query 1181  ATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGACCTTCAGATGGTCCTCATGTCTTTTGAACCATCAGCAAGTCCACAGTGGA  1254
            |||||||||||||||||||.||||.||||||||||.|||||.||||||..|..|||..||.|||||||||||||
Sbjct 1115  ATAATTGTAAAGAATGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAGGTCTTTCAAGACATGTGCGAGTCCACAGTGGA  1188

Query 1255  CAAAAATCCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACGACGATCTTCCCATCAGAGATC  1328
            .|.|.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||.||.||||||.|
Sbjct 1189  GAGACAACATTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACGTTATTCTCACCAGAGAGC  1262

Query 1329  CCACAATGGAGAAAAGCCATATAACTGTGAGGAGTGTGGTAAGGACTATAAAAGGAGGTTGGATCTTGAGTTTC  1402
            .||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||.||||.|||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1263  GCACAGTGGAGAAAAGCCATATAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACAAAAGGAGGTTGGATCTTGACTTTC  1336

Query 1403  ACCAGAGGGTCCACACGGGTGAGAGACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGCAAGAGCTTTGGCTGGGCCTCCTGT  1476
            |.|||||||||||||..||.||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1337  ATCAGAGGGTCCACAGAGGAGAGAAACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTGGCTGGGCCTCGTGT  1410

Query 1477  CTTTTGAAACATCAG-----------------------------------------------------------  1491
            ||||||||.||||||                                                           
Sbjct 1411  CTTTTGAATCATCAGAGAATCCACAGTGGAGAAAAACCATTTAAATGTGAAGAATGTGGGAAAAGATTTACTCA  1484

Query 1492  -------------------------AGACTCCACAGTGGGGAAAAACCTTTCAAATGTGAAGAGTGTGGAAAGA  1540
                                     |||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1485  GAATTCACAACTTTATACCCATCGTAGAGTCCACAGTGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAAA  1558

Query 1541  GATTTACTCAGAGTACACAACTTCATTCCCATCAGACATGCCATACTGGAGAAAAGCTATACAAATGTGAGCAG  1614
            ||||||||||||.|.||||||||.||||.||||..|.|..|||.|||||||.|||||.||||||||||||..||
Sbjct 1559  GATTTACTCAGAATTCACAACTTTATTCTCATCGCAGAGTCCACACTGGAGTAAAGCCATACAAATGTGAAGAG  1632

Query 1615  TGTGAGAAGGGGTACAACAGTAAATTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACAGGGGAGAGCGACCCTATAA  1688
            ||||.||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||||||.||||.|||||
Sbjct 1633  TGTGGGAAGGGCTTCAACAGTAAGTTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACACCGGAGAGAGACCTTATAA  1706

Query 1689  TTGTAAGGAATGTGGAAAGAGCTTTGGCTGGGCTTCATGTCTTTTGAAACATCAGAGACTCCACAGTGGAGAAA  1762
            ||||||.||||||||.|||||||||.||.||||.|||.||.|||||||.|||.||||||||||..|||..||||
Sbjct 1707  TTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATGGTGATGAAA  1780

Query 1763  AGCCATTGAAATCTG--GAGTGTGGGAAGAGATCTACTCAGAATTCACAGCTTCATTTACATCAGTAAG---TC  1831
            |||||||.||||.||  ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||..||||||  ||   ||
Sbjct 1781  AGCCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGATTTACTGAGAATTCACAGCTTCATTCCCATCAG--AGGGTTC  1852

Query 1832  TATGTGGGAGAAAAGCCATA------------------------------------------------------  1851
            ....|||| |||||||||||                                                      
Sbjct 1853  ACACTGGG-GAAAAGCCATACAAATGTGAGAAGTGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAACTCATCTAACCCA  1925

Query 1852  --------------------------------------------------------------------------  1851
                                                                                      
Sbjct 1926  TCAGAGACTCCACAGTAGAGAAAAACTACTTCAATGTGAGGACTGTGGGAAGAGCATTGTGCACAGTTCATGCC  1999

Query 1852  --------------------------------------------------------------------------  1851
                                                                                      
Sbjct 2000  TTAAAGACCAACAAAGAGACCAAAGTGGAGAGAAAACATCTAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGG  2073

Query 1852  ---------------------------------------------  1851
                                                         
Sbjct 2074  CGCTTGAATCTTGATACGCTTTTGTCATTATTTTTAAATGACACA  2118