Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474158
• Subject: XM_017321385.1
• Aligned Length: 1119
• Identities: 878
• Gaps: 132

Alignment

Query    1  ATGGGGAAGGTGAAGGTCGGAGTCAACGGATTTGGTCGTATTGGGCGCCTGGTCACCAGGGCTGCTTTTAACTC  74
                  |.||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..||..|..
Sbjct    1  ------ATGGTGAAGGTCGGTGTGAACGGATTTGGCCGTATTGGGCGCCTGGTCACCAGGGCTGCCATTTGCAG  68

Query   75  TGGTAAAGTGGATATTGTTGCCATCAATGACCCCTTCATTGACCTCAACTACATGGTTTACATGTTCCAATATG  148
            |||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct   69  TGGCAAAGTGGAGATTGTTGCCATCAACGACCCCTTCATTGACCTCAACTACATGGTCTACATGTTCCAGTATG  142

Query  149  ATTCCACCCATGGCAAATTCCATGGCACCGTCAAGGCTGAGAACGGGAAGCTTGTCATCAATGGAAATCCCATC  222
            |.|||||.||.|||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct  143  ACTCCACTCACGGCAAATTCAACGGCACAGTCAAGGCCGAGAATGGGAAGCTTGTCATCAACGGGAAGCCCATC  216

Query  223  ACCATCTTCCAGGAGCGAGATCCCTCCAAAATCAAGTGGGGCGATGCTGGCGCTGAGTACGTCGTGGAGTCCAC  296
            ||||||||||||||||||||.|||.|.||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  217  ACCATCTTCCAGGAGCGAGACCCCACTAACATCAAATGGGGTGAGGCCGGTGCTGAGTATGTCGTGGAGTCTAC  290

Query  297  TGGCGTCTTCACCACCATGGAGAAGGCTGGGGCTCATTTGCAGGGGGGAGCCAAAAGGGTCATCATCTCTGCCC  370
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  291  TGGTGTCTTCACCACCATGGAGAAGGCCGGGGCCCACTTGAAGGGTGGAGCCAAAAGGGTCATCATCTCCGCCC  364

Query  371  CCTCTGCTGACGCCCCCATGTTCGTCATGGGTGTGAACCATGAGAAGTATGACAACAGCCTCAAGATCATCAGC  444
            |.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||...||||||||..|||||
Sbjct  365  CTTCTGCCGATGCCCCCATGTTTGTGATGGGTGTGAACCACGAGAAATATGACAACTCACTCAAGATTGTCAGC  438

Query  445  AATGCCTCCTGCACCACCAACTGCTTAGCACCCCTGGCCAAGGTCATCCATGACAACTTTGGTATCGTGGAAGG  518
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  439  AATGCATCCTGCACCACCAACTGCTTAGCCCCCCTGGCCAAGGTCATCCATGACAACTTTGGCATTGTGGAAGG  512

Query  519  ACTCATGACCACAGTCCATGCCATCACTGCCACCCAGAAGACTGTGGATGGCCCCTCCGGGAAACTGTGGCGTG  592
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  513  GCTCATGACCACAGTCCATGCCATCACTGCCACCCAGAAGACTGTGGATGGCCCCTCTGGAAAGCTGTGGCGTG  586

Query  593  ATGGCCGCGGGGCTCTCCAGAACATCATCCCTGCCTCTACTGGCGCTGCCAAGGCTGTGGGCAAGGTCATCCCT  666
            |||||||.||||||..||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  587  ATGGCCGTGGGGCTGCCCAGAACATCATCCCTGCATCCACTGGTGCTGCCAAGGCTGTGGGCAAGGTCATCCCA  660

Query  667  GAGCTGAACGGGAAGCTCACTGGCATGGCCTTCCGTGTCCCCACTGCCAACGTGTCAGTGGTGGACCTGACCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..||||.|||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  661  GAGCTGAACGGGAAGCTCACTGGCATGGCCTTCCGTGTTCCTACCCCCAATGTGTCCGTCGTGGATCTGACGTG  734

Query  741  CCGTCTAGAAAAACCT----------------------------------------------------------  756
            |||.||.||.||||||                                                          
Sbjct  735  CCGCCTGGAGAAACCTGTATGTATGGGGAGAGCTGGGCTTGTCTCTGGTGTGACAGTGACTTGGGACAAGGATA  808

Query  757  --------------------------GCCAAATATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGCAGGCGTCGGAGGGC  804
                                      |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  809  GTCATTTTGGGGTTTGTTCTTATCAGGCCAAGTATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGCAGGCATCTGAGGGC  882

Query  805  CCCCTCAAGGGCATCCTGGGCTACACTGAGCACCAGGTGGTCTCCTCTGACTTCAACAGCGACACCCACTCCTC  878
            ||.||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||.|||||||..||||||||||||.||.|||||||.||
Sbjct  883  CCACTGAAGGGCATCTTGGGCTACACTGAGGACCAGGTTGTCTCCTGCGACTTCAACAGCAACTCCCACTCTTC  956

Query  879  CACCTTCGACGCTGGGGCTGGCATTGCCCTCAACGACCACTTTGTCAAGCTCATTTCCTGGTAT----------  942
            |||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct  957  CACCTTCGATGCCGGGGCTGGCATTGCTCTCAATGACAACTTTGTCAAGCTCATTTCCTGGTATGTGGGGATGG  1030

Query  943  GACAAC--GAATTTGGCT-ACAGCAACAGGG----TGGTGGACCTCATGGCCCACATGGC---CTCCAAGGAG-  1005
            || |||  ||.|||   | |.||||||.|||    |||| |.|||| |||      ||||   |||..|..|| 
Sbjct 1031  GA-AACCTGACTTT---TAAGAGCAACTGGGGGTTTGGT-GCCCTC-TGG------TGGCTAGCTCAGAAAAGA  1092

Query 1006  ---------  1005
                     
Sbjct 1093  AACCCAAAC  1101