Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474290
- Subject:
- XM_006530533.4
- Aligned Length:
- 3265
- Identities:
- 2883
- Gaps:
- 17
Alignment
Query 1 ATGGCCTGCTCACCTGATGCAGTCGTCTCTCCGTCTTCCGCTTTCTTAAGGTCTGGCTCAGTTTATGAACCTCT 74
||||||..||||||||||||||.|.||||| ||..|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCAACTCACCTGATGCAGCCTTCTCT---TCACCTGCTTTGTTAAGGTCTGGCTCAGTTTATGAACCTCT 71
Query 75 TAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACTCTCTGGGATAAGTTGGACCATTATTACAGAATTGTCA 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 72 TAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACTCTATGGGATAAGTTGGATCATTATTACAGAATTGTCA 145
Query 149 AGTCAACATTGCTGCTGTATCAAAGTCCAACTACCGGTCTCTTTCCCACTAAAACATGCGGTGGTGACCAGAAG 222
|||||||..|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||..|||||
Sbjct 146 AGTCAACGATGCTGATGTATCAAAGTCCAACTACCGGTCTCTTTCCTACTAAAACATGTGGTGGAGAAGAGAAG 219
Query 223 GCCAAGATCCAGGACAGCCTATACTGCGCTGCTGGGGCCTGGGCTTTGGCTCTTGCATACAGGCGAATTGATGA 296
.||||..|.||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 220 TCCAAAGTGCACGAGAGTCTGTACTGTGCTGCGGGTGCCTGGGCCTTGGCGCTAGCATACAGGCGCATTGATGA 293
Query 297 CGACAAGGGAAGGACCCATGAGCTGGAGCACTCAGCTATAAAATGCATGAGAGGAATTCTCTACTGCTATATGC 370
.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 294 TGACAAGGGACGGACCCATGAGCTGGAGCACTCGGCCATAAAGTGTATGAGAGGAATTCTCTACTGCTACATGC 367
Query 371 GTCAGGCCGATAAGGTCCAGCAGTTTAAGCAGGATCCACGCCCAACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAATGTG 444
|.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 368 GGCAGGCTGATAAGGTCCAACAGTTTAAACAAGATCCCCGGCCCACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAGTGTG 441
Query 445 CATACAGGAGATGAGTTGCTTTCCTATGAGGAATATGGTCATCTTCAGATAAATGCAGTGTCACTTTATCTCCT 518
||.||.||.|||||||||||...||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||
Sbjct 442 CACACTGGGGATGAGTTGCTCAGCTATGAAGAATATGGCCATCTTCAGATAAATGCAGTCTCACTCTTTCTCCT 515
Query 519 TTACCTTGTGGAAATGATTTCCTCAGGACTCCAGATTATCTACAACACTGATGAGGTCTCTTTTATTCAAAACC 592
||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 516 TTACCTGGTAGAAATGATTTCCTCAGGCCTCCAGATAATCTATAACACGGATGAGGTTTCTTTTATTCAAAACC 589
Query 593 TTGTATTTTGTGTGGAAAGAGTTTACCGTGTGCCTGACTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAATAAT 666
|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 590 TTGTATTTTGTGTAGAGAGAGTTTACCGTGTTCCTGACTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAACAAT 663
Query 667 GGCAGCACAGAGCTACATTCGAGCTCGGTTGGTTTAGCAAAAGCAGCTCTAGAAGCAATTAATGGATTCAACCT 740
||.||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 664 GGTAGTACCGAACTGCACTCAAGCTCTGTTGGTTTAGCAAAAGCAGCCTTAGAAGCAATTAATGGATTTAACCT 737
Query 741 TTTTGGCAACCAGGGCTGTTCGTGGTCAGTTATATTTGTGGATCTCGATGCTCACAATCGCAACAGGCAAACTT 814
.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 738 CTTTGGAAACCAGGGGTGTTCCTGGTCAGTTATATTTGTGGATCTCGATGCTCACAACCGCAACAGGCAGACAT 811
Query 815 TGTGCTCGCTGTTACCCAGAGAATCAAGATCACATAATACAGATGCTGCCCTGCTCCCCTGCATCAGTTATCCT 888
|||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 812 TGTGCTCACTGTTACCCAGAGAATCACGCTCTCATAACACAGATGCTGCCCTGCTCCCGTGCATCAGTTACCCT 885
Query 889 GCATTTGCCCTGGATGATGAAGTTCTTTTTAGCCAGACACTTGATAAAGTGGTTAGAAAATTAAAAGGAAAATA 962
||.||||||.||||||||||||..||.||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||
Sbjct 886 GCGTTTGCCTTGGATGATGAAGCACTGTTCAGCCAGACACTTGATAAAGTGATAAGAAAATTGAAAGGAAAATA 959
Query 963 TGGATTTAAACGTTTCTTGAGAGATGGGTATAGAACATCATTGGAAGATCCCAACAGATGCTACTACAAGCCAG 1036
|||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||
Sbjct 960 TGGATTTAAGCGTTTCTTGCGAGATGGGTACAGAACGCCATTGGAAGATCCCAACAGACGCTATTACAAACCAG 1033
Query 1037 CTGAAATTAAGCTATTTGATGGCATTGAATGTGAATTTCCCATATTTTTCCTTTATATGATGATTGATGGAGTT 1110
|.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1034 CAGAGATTAAGCTGTTTGATGGCATTGAATGTGAATTTCCCATATTCTTCCTTTACATGATGATCGATGGTGTT 1107
Query 1111 TTTAGAGGCAATCCTAAGCAAGTACAGGAATATCAGGATCTTTTGACTCCAGTACTTCATCATACCACAGAAGG 1184
|||||||||||||.|.|.|||||..|||||||||||||.||||||||.||..|.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1108 TTTAGAGGCAATCTTGAACAAGTCAAGGAATATCAGGACCTTTTGACACCTTTGCTTCATCAGACCACAGAAGG 1181
Query 1185 ATATCCTGTTGTACCAAAGTACTATTATGTGCCAGCTGACTTTGTAGAATATGAAAAAAATAACCCTGGTAGTC 1258
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||
Sbjct 1182 ATATCCTGTTGTGCCAAAGTACTATTATGTGCCAGCTGACTTTGTAGAATGTGAAAAAAGAAACCCTGGTAGTC 1255
Query 1259 AAAAACGATTTCCTAGCAACTGTGGCCGTGATGGAAAACTGTTTCTTTGGGGACAAGCACTTTATATCATCGCA 1332
|.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1256 AGAAGCGGTTTCCAAGTAACTGTGGCCGTGATGGGAAGTTGTTTCTTTGGGGACAAGCTCTTTATATCATTGCA 1329
Query 1333 AAACTCCTGGCTGATGAACTTATTAGTCCTAAAGACATTGATCCTGTCCAGCGCTATGTCCCACTAAAGGATCA 1406
||||||||.||||||||..|.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||..||.||||
Sbjct 1330 AAACTCCTAGCTGATGAGTTAATCAGCCCTAAAGACATTGACCCTGTCCAGCGCTTTGTCCCACTTCAGAATCA 1403
Query 1407 ACGTAACGTGAGCATGAGGTTTTCCAATCAGGGCCCACTGGAAAATGACTTGGTAGTTCATGTGGCACTTATAG 1480
||||||||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||
Sbjct 1404 ACGTAACGTGAGCATGAGATACTCCAATCAGGGCCCACTGGAAAATGACTTGGTGGTTCATGTAGCACTTGTAG 1477
Query 1481 CAGAAAGCCAAAGACTTCAAGTTTTTCTGAACACATATGGTATTCAAACTCAAACTCCTCAACAAGTAGAACCC 1554
|||||||||||.|.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1478 CAGAAAGCCAACGCCTTCAAGTTTTTCTCAATACATATGGTATTCAAACCCAAACTCCTCAGCAGGTGGAACCC 1551
Query 1555 ATTCAGATATGGCCTCAGCAGGAGCTTGTGAAAGCTTATTTGCAGCTGGGTATCAATGAAAAGTTAGGACTCTC 1628
||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1552 ATTCAGATCTGGCCTCAGCAGGAGCTTGTAAAAGCTTATTTCCACCTGGGAATCAATGAAAAGTTGGGTCTGTC 1625
Query 1629 TGGAAGGCCAGACAGGCCCATTGGCTGCCTCGGGACATCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTT 1702
||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 TGGAAGGCCAGATAGGCCCATTGGCTGCCTTGGTACATCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTT 1699
Query 1703 GTTACCCGATTATTTTCGACCTAAGTGATTTCTACATGTCTCAGGATGTTTTCCTGCTGATAGATGACATAAAG 1776
|||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1700 GTTACCCTATCATCTTTGACCTGAGTGATTTCTACATGTCTCAGGACGTTCTGCTGCTCATAGATGACATAAAG 1773
Query 1777 AATGCGCTGCAGTTCATTAAACAATATTGGAAAATGCATGGACGTCCACTTTTCCTTGTTCTCATCCGGGAAGA 1850
||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1774 AACGCACTACAGTTCATTAAGCAATATTGGAAAATGCATGGACGCCCACTTTTTCTTGTTCTCATCCGAGAAGA 1847
Query 1851 CAATATAAGAGGTAGCCGGTTCAACCCCATATTAGATATGCTGGCAGCCCTTAAAAAAGGAATAATTGGAGGAG 1924
|||.||||||||||||.|.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1848 CAACATAAGAGGTAGCAGATTCAACCCAATATTAGACATGCTGGCAGCCTTTAAAAAGGGAATAATTGGAGGAG 1921
Query 1925 TCAAAGTTCATGTGGATCGTCTACAGACACTAATATCTGGAGCTGTGGTAGAACAACTTGATTTCCTACGAATC 1998
|||||||||||||.||||||.||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 1922 TCAAAGTTCATGTTGATCGTTTACAGACATTGATATCCGGAGCTGTAGTAGAGCAGCTTGACTTTCTACGAATT 1995
Query 1999 AGTGACACAGAAGAGCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTGAGGAACTAGAACCTCCCAAACATTCAAAAGTCAAACG 2072
||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||..|||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1996 AGTGACACAGAAAAGCTTCCAGAATTTAAGAGCTTTGAAGAACTAGAATTTCCTAAGCATTCAAAAGTCAAACG 2069
Query 2073 GCAAAGCAGCACCCCTAG-TGCTCCTGAACTGGG----ACAGCAGCCGGATGTCAACATTAGTGAATGGAAGGA 2141
|||.|||||.|||.| || ||||||||| || |||..||||.|...|||.|||||..||.|||||..|
Sbjct 2070 GCAGAGCAGTACCGC-AGATGCTCCTGA----GGCGCAACACGAGCCAGGCATCACCATTACCGAGTGGAAAAA 2138
Query 2142 CAAACCCACCCATGAAATTCTTCAAAAACTGAATGATTGCAGTTGTCTGGCTAGCCAAGCCATCCTGCTGGGTA 2215
||||.|||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||||||.|.|||.|||||||||||||||
Sbjct 2139 CAAATCCACCCACGAAATCCTTCAGAAGCTGAATGACTGCGGTTGTCTGGCTGGTCAAACCATCCTGCTGGGTA 2212
Query 2216 TACTGCTCAAAAGAGAAGGCCCCAACTTCATCACAAAGGAAGGTACCGTTTCTGATCACATTGAGAGAGTCTAT 2289
||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||.||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2213 TACTGCTCAAAAGAGAGGGCCCTAACTTTATCACAATGGAAGGAACTGTGTCTGATCACATTGAGAGAGTGTAT 2286
Query 2290 AGAAGAGCTGGCAGCCAAAAACTTTGGTCGGTTGTACGCCGTGCAGCAAGTCTTTTAAGTAAAGTAGTGGACAG 2363
|||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2287 AGAAGAGCTGGCAGCAAAAAGCTTTGGTCGGTTGTACGCCGTGCAGCAAGTCTTTTAAATAAAGTAGTGGACAG 2360
Query 2364 CCTGGCCCCATCCATTACTAATGTTTTAGTGCAGGGCAAACAGGTAACTCTGGGTGCCTTTGGGCATGAAGAAG 2437
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 2361 CCTGGCCCCATCCATTACTAATGTTTTAGTGCAGGGCAAACAGGTAACTCTAGGTGCCTTTGGACATGAAGAGG 2434
Query 2438 AAGTTATCTCTAATCCTTTGTCTCCAAGAGTGATTCAAAACATCATCTATTATAAGTGTAACACCCATGATGAG 2511
|.||.||||||||.||..|||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 2435 AGGTCATCTCTAACCCACTGTCTCCAAGAGTGATTAAGAACATAATCTATTATAAGTGCAATACCCACGATGAG 2508
Query 2512 AGGGAAGCGGTCATTCAGCAAGAACTGGTCATCCATATTGGCTGGATCATCTCCAATAACCCTGAGTTATTCAG 2585
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||
Sbjct 2509 AGGGAGGCAGTCATTCAGCAAGAACTGGTCATCCACATCGGCTGGATCATCTCCAACAGCCCTGAGTTGTTCAG 2582
Query 2586 TGGCATGCTGAAAATACGAATCGGGTGGATCATCCATGCCATGGAGTATGAACTTCAGATCCGTGGCGGAGACA 2659
.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||.|
Sbjct 2583 CGGCATGCTGAAAATACGCATTGGGTGGATCATCCACGCCATGGAGTATGAACTGCAGGTCCGGGGCGGGGATA 2656
Query 2660 AGCCAGCCTTGGACTTGTATCAGCTGTCACCTAGTGAAGTTAAACAGCTTCTGCTGGATATTCTGCAGCCTCAA 2733
|||||||..||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 2657 AGCCAGCTGTGGACTTGTACCAGCTCTCGCCCAGTGAAGTGAAGCAGCTGCTGCTAGACATTCTCCAGCCTCAA 2730
Query 2734 CAGAATGGAAGATGTTGGCTGAACAGGCGTCAGATCGATGGGTCTTTGAATAGAACTCCCACCGG-GTTCTATG 2806
||||.|||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||| |||| .|||||||
Sbjct 2731 CAGAGTGGAAGATGTTGGTTGAATAGACGTCAGATTGATGGGTCATTGAATAGAACACCC-CCGGAATTCTATG 2803
Query 2807 ACCGAGTGTGGCAGATTCTGGAGCGCACGCCCAATGGGATCATTGTTGCTGGGAAGCATTTGCCTCAGCAACCA 2880
||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 2804 ACCGAGTGTGGCAGATCCTGGAACGCACACCTAATGGTATCGTTGTAGCTGGAAAGCATTTGCCACAGCAACCA 2877
Query 2881 ACCCTGTCAGATATGACCATGTATGAGATGAATTTCTCTCTCCTTGTTGAAGACACGTTGGGAAATATTGACCA 2954
||..||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.|.|||||||.||||||||
Sbjct 2878 ACTTTGTCGGATATGACCATGTATGAGATGAATTTTTCTCTCCTTGTTGAAGATATGCTGGGAAACATTGACCA 2951
Query 2955 GCCACAGTACAGACAGATCGTTGTAGAGTTACTTATGGTTGTATCCATTGTACTGGAAAGAAACCCCGAGCTAG 3028
||||.||||.|||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 2952 GCCAAAGTATAGACAGATCATAGTTGAGTTACTAATGGTCGTATCCATTGTGCTGGAAAGAAACCCTGAACTGG 3025
Query 3029 AATTTCAAGACAAAGTAGATCTAGACAGACTGGTCAAAGAAGCATTTAATGAATTTCAAAAAGATCAGAGTCGG 3102
|.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 3026 AGTTTCAAGACAAAGTGGATCTGGACAGACTGGTTAAAGAAGCGTTTCATGAGTTTCAAAAAGATGAGAGTCGG 3099
Query 3103 CTAAAGGAAATTGAAAAACAAGATGACATGACTTCCTTTTACAACACTCCTCCCCTGGGAAAAAGAGGAACATG 3176
|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 3100 CTAAAAGAAATCGAAAAACAAGATGATATGACTTCCTTTTACAACACGCCCCCACTGGGAAAAAGAGGAACCTG 3173
Query 3177 CAGCTATTTGACAAAGGCGGTGATGAATCT-GCTGCTGGAAGGAGAAGTCAAGCCAAACAATGATGACCCGTGT 3249
||||||.|||||.||||..|||||||| || .|||||.||.||||||||||||||.|.||||||.|||.|.||.
Sbjct 3174 CAGCTACTTGACGAAGGTTGTGATGAA-CTCACTGCTCGAGGGAGAAGTCAAGCCCAGCAATGAGGACTCCTGC 3246
Query 3250 CTGATTAGC 3258
|||.|||||
Sbjct 3247 CTGGTTAGC 3255