Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474851
- Subject:
- NM_001348187.1
- Aligned Length:
- 2481
- Identities:
- 2293
- Gaps:
- 186
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGTACTTGCGCAAAGACGACGAGGAGGCTGCGAAAAGTTAAGGGCCGGACCGCAGGCTGTGCTCGCTTCCGG 74
Query 1 -------------------ATGCTTGCGGACCTCGGCTTAATCGGAACCATAGGCGAGGATGACGAGGTGCCGG 55
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAGTGGCTTCTGCGACAACATGCTTGCGGACCTCGGCTTAATCGGAACCATAGGCGAGGATGACGAGGTGCCGG 148
Query 56 TGGAGCCCGAGTCTGACTCCGGGGACGAGGAAGAGGAGGGGCCCATTGTGCTGGGCAGACGACAAAAAGCTTTG 129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGAGCCCGAGTCTGACTCCGGGGACGAGGAAGAGGAGGGGCCCATTGTGCTGGGCAGACGACAAAAAGCTTTG 222
Query 130 GGGAAGAACCGCAGTGCTGATTTCAACCCTGATTTCGTTTTCACTGAGAAGGAGGGGACGTACGATGGCAGCTG 203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGAAGAACCGCAGTGCTGATTTCAACCCTGATTTCGTTTTCACTGAGAAGGAGGGGACGTACGATGGCAGCTG 296
Query 204 GGCCCTGGCTGATGTCATGAGCCAACTCAAGAAGAAGAGGGCAGCCACTACATTAGATGAGAAGATTGAGAAAG 277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGCCCTGGCTGATGTCATGAGCCAACTCAAGAAGAAGAGGGCAGCCACTACATTAGATGAGAAGATTGAGAAAG 370
Query 278 TTCGAAAGAAAAGGAAAACAGAGGATAAAGAAGCCAAGTCTGGGAAGTTGGAAAAGGAGAAAGAAGCAAAGGAA 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTCGAAAGAAAAGGAAAACAGAGGATAAAGAAGCCAAGTCTGGGAAGTTGGAAAAGGAGAAAGAAGCAAAGGAA 444
Query 352 GGCTCTGAACCAAAGGAGCAGGAAGACCTTCAAGAGAATGATGAGGAAGGCTCAGAAGATGAAGCCTCGGAGAC 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCTCTGAACCAAAGGAGCAGGAAGACCTTCAAGAGAATGATGAGGAAGGCTCAGAAGATGAAGCCTCGGAGAC 518
Query 426 TGACTACTCATCAGCTGATGAGAACATCCTCACCAAAGCAGATACACTCAAAGTAAAGGATCGGAAGAAGAAGA 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGACTACTCATCAGCTGATGAGAACATCCTCACCAAAGCAGATACACTCAAAGTAAAGGATCGGAAGAAGAAGA 592
Query 500 AGAAGAAAGGACAGGAAGCAGGAGGATTTTTTGAAGATGCATCTCAGTACGATGAAAACCTCTCGTTCCAGGAC 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAAGAAAGGACAGGAAGCAGGAGGATTTTTTGAAGATGCATCTCAGTACGATGAAAACCTCTCGTTCCAGGAC 666
Query 574 ATGAACCTTTCCCGCCCTCTTCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCCACCCCGATCCAGAAGGC 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATGAACCTTTCCCGCCCTCTTCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCCACCCCGATCCAGAAGGC 740
Query 648 GTGCATACCTGTGGGTCTATTGGGGAAGGACATCTGTGCCTGTGCAGCCACTGGGACAGGTAAAACTGCCGCCT 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTGCATACCTGTGGGTCTATTGGGGAAGGACATCTGTGCCTGTGCAGCCACTGGGACAGGTAAAACTGCCGCCT 814
Query 722 TTGCCCTGCCTGTTTTGGAGCGTCTGATTTATAAACCCCGCCAGGCTCCAGTCACCCGCGTGCTGGTGCTAGTG 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGCCCTGCCTGTTTTGGAGCGTCTGATTTATAAACCCCGCCAGGCTCCAGTCACCCGCGTGCTGGTGCTAGTG 888
Query 796 CCCACCCGAGAGCTGGGCATCCAGGTGCACTCTGTCACCAGACAGCTGGCCCAGTTCTGCAACATCACCACCTG 869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCCACCCGAGAGCTGGGCATCCAGGTGCACTCTGTCACCAGACAGCTGGCCCAGTTCTGCAACATCACCACCTG 962
Query 870 CCTGGCTGTGGGCGGCTTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCAGCTCTTCGGGCAGCGCCTGACATCCTCATCGCCA 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCTGGCTGTGGGCGGCTTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCAGCTCTTCGGGCAGCGCCTGACATCCTCATCGCCA 1036
Query 944 CCCCAGGCCGGCTCATCGATCACCTCCACAACTGCCCTTCCTTCCACCTGAGCAGCATCGAGGTGCTCATCCTG 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCCAGGCCGGCTCATCGATCACCTCCACAACTGCCCTTCCTTCCACCTGAGCAGCATCGAGGTGCTCATCCTG 1110
Query 1018 GACGAGGCTGA--------------------------------------------------------------- 1028
|||||||||||
Sbjct 1111 GACGAGGCTGACAGCCCGCCTGTCGACACAGCCTGGCCACACGCCCCCACTTTGTGGCTTCTGCATTTGCCATT 1184
Query 1029 ------------------------------CAGGATGCTGGATGAGTACTTTGAGGAGCAGATGAAGGAGATCA 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCCTCAGCCTGGAGCCATCTCCTGCCCCTTCAGGATGCTGGATGAGTACTTTGAGGAGCAGATGAAGGAGATCA 1258
Query 1073 TCCGAATGTGTTCCCACCACCGCCAGACCATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGACGAGGTGAAAGATCTGGCT 1146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCGAATGTGTTCCCACCACCGCCAGACCATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGACGAGGTGAAAGATCTGGCT 1332
Query 1147 TCTGTCTCCTTGAAGAATCCTGTCCGGATATTTGTGAACAGCAACACAGATGTGGCTCCCTTTCTGCGGCAGGA 1220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333 TCTGTCTCCTTGAAGAATCCTGTCCGGATATTTGTGAACAGCAACACAGATGTGGCTCCCTTCCTGCGGCAGGA 1406
Query 1221 GTTCATCCGGATCCGGCCTAATCGTGAAGGAGACCGGGAAGCCATCGTGGCAGCTTTGTTGACGAGGACCTTCA 1294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GTTCATCCGGATCCGGCCTAATCGTGAAGGAGACCGGGAAGCCATCGTGGCAGCTTTGTTGACGAGGACCTTCA 1480
Query 1295 CTGACCATGTGATGCTGTTCACGCAAACCAAGAAGCAGGCCCACCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTCATGGGG 1368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGACCATGTGATGCTGTTCACGCAAACCAAGAAGCAGGCCCACCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTCATGGGG 1554
Query 1369 CTGCAGGTGGGTGAGCTCCATGGCAACTTGTCACAGACGCAGCGGCTGGAGGCCCTCCGGCGTTTTAAGGATGA 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTGCAGGTGGGTGAGCTCCATGGCAACTTGTCACAGACGCAGCGGCTGGAGGCCCTCCGGCGTTTTAAGGATGA 1628
Query 1443 ACAGATTGACATCCTCGTGGCCACTGATGTGGCAGCCCGTGGACTTGACATTGAGGGGGTCAAAACGGTAATCA 1516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ACAGATTGACATCCTCGTGGCCACTGATGTGGCAGCCCGTGGACTTGACATTGAGGGGGTCAAAACGGTAATCA 1702
Query 1517 ACTTCACAATGCCTAATACCATCAAACATTATGTCCACCGGGTGGGGCGAACAGCACGTGCTGGCAGGGCTGGG 1590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACTTCACAATGCCTAATACCATCAAACATTATGTCCACCGGGTGGGGCGAACAGCACGTGCTGGCAGGGCTGGG 1776
Query 1591 CGCTCAGTCTCTCTGGTGGGAGAAGATGAGCGGAAGATGCTGAAGGAGATTGTAAAAGCTGCCAAGGCCCCTGT 1664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CGCTCAGTCTCTCTGGTGGGAGAAGATGAGCGGAAGATGCTGAAGGAGATTGTAAAAGCTGCCAAGGCCCCTGT 1850
Query 1665 GAAGGCCAGGATACTTCCCCAAGATGTCATCCTCAAATTCCGGGACAAGATTGAGAAAATGGAGAAAGATGTGT 1738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GAAGGCCAGGATACTTCCCCAAGATGTCATCCTCAAATTCCGGGACAAGATTGAGAAAATGGAGAAAGATGTGT 1924
Query 1739 ATGCAGTTCTGCAGCTAGAGGCGGAGGAAAAAGAGATGCAGCAGTCAGAAGCCCAGATCAATACAGCAAAGCGG 1812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATGCAGTTCTGCAGCTAGAGGCGGAGGAAAAAGAGATGCAGCAGTCAGAAGCCCAGATCAATACAGCAAAGCGG 1998
Query 1813 CTCCTGGAGAAGGGGAAGGAGGCAGTGGTCCAAGAGCCCGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAA 1886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTCCTGGAGAAGGGGAAGGAGGCAGTGGTCCAAGAGCCCGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAA 2072
Query 1887 GAAGGAGAAAATTGCCAAAGCTCTGCAGGAATTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTA 1960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GAAGGAGAAAATTGCCAAAGCTCTGCAGGAATTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTA 2146
Query 1961 TGAAGGATGCCAAAAAAAAGGGGGAGATGACAGCAGAGGAAAGGTCTCAGTTTGAAATCCTCAAGGCGCAGATG 2034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGAAGGATGCCAAAAAAAAGGGGGAGATGACAGCAGAGGAAAGGTCTCAGTTTGAAATCCTCAAGGCGCAGATG 2220
Query 2035 TTTGCTGAACGGCTAGCGAAGAGGAATCGCAGAGCCAAGCGGGCCCGAGCAATGCCCGAGGAGGAGCCAGTGAG 2108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TTTGCTGAACGGCTAGCGAAGAGGAATCGCAGAGCCAAGCGGGCCCGAGCAATGCCCGAGGAGGAGCCAGTGAG 2294
Query 2109 AGGTCCTGCCAAGAAGCAAAAGCAGGGGAAGAAATCTGTATTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGG 2182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AGGTCCTGCCAAGAAGCAAAAGCAGGGGAAGAAATCTGTATTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGG 2368
Query 2183 CCCTGAAACAGTATCGAGCTAGCCCTTCCTTTGAAGAAAGGAAACAGTTGGGCTTGCCCCACCAGAGACGAGGA 2256
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCCTGAAACAGTATCGAGCTGGCCCTTCCTTTGAAGAAAGGAAACAGTTGGGCTTGCCCCACCAGAGACGAGGA 2442
Query 2257 GGAAACTTTAAATCTAAATCCAGATACAAGAGGAGGAAG 2295
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GGAAACTTTAAATCTAAATCCAGATACAAGAGGAGGAAG 2481