Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474912
• Subject: XM_011513885.3
• Aligned Length: 790
• Identities: 628
• Gaps: 134

Alignment

Query   1  ATGAATGTGCGGAGGGTGGAAAGCATTTCGGCTCAGCTGGAGGAGGCCAGCTCTACAGGCGGTTTCCTGTACGC  74
                                                   |.|||           .|||.||           
Sbjct   1  ----------------------------------------ATGAG-----------TGGCTGT-----------  12

Query  75  TCAGAACAGCACCAAGCGCAGCATTAAAGAGCGGCTCATGAAGCTC------TTGC------CCTGCTCAG-CT  135
             |||        |||||..|   ||||        |.||||...|      ||||      |||.||||| ||
Sbjct  13  --AGA--------AAGCGGTG---TAAA--------CGTGAAATACTGAAATTTGCCCAGTACCTTCTCAGACT  65

Query 136  GCCAAAACGTCGTCTCCTGCTATTCA---AAACAGCGTGGAAGATGAACTGGAGATGGCCACCGTCAGGCATCG  206
           ...||.|.||  ||||      ||||   |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  66  ATTAACAGGT--TCTC------TTCATACAGACAGCGTGGAAGATGAACTGGAGATGGCCACCGTCAGGCATCG  131

Query 207  GCCCGAAGCCCTTGAGCTTCTGGAAGCCCAGAGCAAATTTACCAAGAAAGAGCTTCAGATCCTTTACAGAGGAT  280
           |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 132  GCCTGAAGCCCTTGAGCTTCTGGAAGCCCAGAGCAAATTTACCAAGAAAGAGCTTCAGATCCTTTACAGAGGAT  205

Query 281  TTAAGAACGAATGCCCCAGTGGTGTTGTTAATGAAGAAACCTTCAAAGAGATTTACTCGCAGTTCTTTCCACAG  354
           |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 206  TTAAGAATGAATGCCCCAGTGGTGTTGTTAATGAAGAAACCTTCAAAGAGATTTACTCGCAGTTCTTTCCACAG  279

Query 355  GGAGACTCTACAACATATGCACATTTTCTGTTCAATGCATTTGATACAGACCACAATGGAGCTGTGAGTTTCGA  428
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280  GGAGACTCTACAACATATGCACATTTTCTGTTCAATGCATTTGATACAGACCACAATGGAGCTGTGAGTTTCGA  353

Query 429  GGATTTCATCAAAGGTCTTTCCATTTTGCTCCGGGGGACAGTACAAGAAAAACTCAATTGGGCATTTAATCTGT  502
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354  GGATTTCATCAAAGGTCTTTCCATTTTGCTCCGGGGGACAGTACAAGAAAAACTCAATTGGGCATTTAATCTGT  427

Query 503  ATGACATAAATAAAGATGGCTACATCACTAAAGAGGAAATGCTTGATATAATGAAAGCAATATACGATATGATG  576
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 428  ATGACATAAATAAAGATGGCTACATCACTAAAGAGGAAATGCTTGATATAATGAAAGCAATATACGATATGATG  501

Query 577  GGTAAATGTACATATCCTGTCCTCAAAGAAGATGCTCCCAGACAACACGTTGAAACATTTTTTCAGAAAATGGA  650
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502  GGTAAATGTACATATCCTGTCCTCAAAGAAGATGCTCCCAGACAACACGTTGAAACATTTTTTCAGAAAATGGA  575

Query 651  CAAAAATAAAGATGGGGTTGTTACCATAGATGAGTTCATTGAAAGCTGCCAAAAAG------ATGAAAACATAA  718
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||...|||
Sbjct 576  CAAAAATAAAGATGGGGTTGTTACCATAGATGAGTTCATTGAAAGCTGCCAAAAAGTAAGTAATGAAAGTGTAA  649

Query 719  T-GCGCTCCATGCAGCT----------CTTTGAAAATGTG-ATT------  750
           | .|..||.||.|||||          ||   |||.||.| |||      
Sbjct 650  TAACTATCAATTCAGCTATCATAACAGCT---AAACTGAGTATTAGCAGC  696