Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474944
• Subject: NM_015488.5
• Aligned Length: 1189
• Identities: 1022
• Gaps: 140

Alignment

Query    1  ATGGCTTGGC-----------------------AGGGCTG-------------GCCCGCGGCGTGGCAGTGGG-  37
            |||||  |||                       |||||.|             |||||||.|.|  |.|.||| 
Sbjct    1  ATGGC--GGCGGTGGTAGCTGCTACGGCGCTGAAGGGCCGGGGGGCGAGAAATGCCCGCGTCCT--CCGGGGGA  70

Query   38  ---TCGCCGG-----CTGCT-----GGCTCCTC----CTCGTCCTTGTCCTCGTCCTACTTGTGAGCCC-----  89
               ||||.||     |.|||     ||||.|||    |..|.||                  .|.||||     
Sbjct   71  TTCTCGCAGGAGCCACAGCTAACAAGGCTTCTCATAACAGGACC------------------CGGGCCCTGCAA  126

Query   90  --CCGCGGCTGCC--GAGCGC--GGCGGGGCC----------TCCGCGGTCTGCT------CAT----------  131
              ||.|.|||.||  |||.||  ||.||..||          |||.|||  .|||      |||          
Sbjct  127  AGCCACAGCTCCCCAGAGGGCAAGGAGGAACCTGAACCCCTATCCCCGG--AGCTGGAATACATTCCCAGAAAG  198

Query  132  -GGCGCACAG----CCA----------GCGGCTGCTCTTCCGAATCGGGTACAGCCTGTACACCCGCACCTGGC  190
             ||.||| ||    |||          |.|.|||..||         |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  199  AGGGGCA-AGAACCCCATGAAAGCTGTGGGACTGGCCT---------GGTACAGCCTGTACACCCGCACCTGGC  262

Query  191  TCGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTGCGCAGGGCTCGGAATCGCTACCCTAAAGGCCACTCGAAAACCCAG  264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  263  TCGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTGCGCAGGGCTCGGAATCGCTACCCTAAAGGCCACTCGAAAACCCAG  336

Query  265  CCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCTCTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGA  338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  337  CCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCTCTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGA  410

Query  339  CACCCAGGCCCAGCTGGCTGTGGCTGTGGACCCTTCAGACCCTCGGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAG  412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  CACCCAGGCCCAGCTGGCTGTGGCTGTGGACCCTTCAGACCCTCGGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAG  484

Query  413  GGGTCACCTTGGTCGCCATTCTGTGTACTCACAAGCACTGGGACCACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGG  486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  GGGTCACCTTGGTCGCCATTCTGTGTACTCACAAGCACTGGGACCACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGG  558

Query  487  CGGCACCGGGACTGTCGGGTGTACGGGAGCCCTCAGGACGGCATCCCCTACCTCACCCATCCCCTGTGTCATCA  560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  CGGCACCGGGACTGTCGGGTGTACGGGAGCCCTCAGGACGGCATCCCCTACCTCACCCATCCCCTGTGTCATCA  632

Query  561  AGATGTGGTCAGCGTGGGACGGCTTCAGATCCGGGCCCTGGCTACACCTGGCCACACACAAGGCCATCTGGTCT  634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  AGATGTGGTCAGCGTGGGACGGCTTCAGATCCGGGCCCTGGCTACACCTGGCCACACACAAGGCCATCTGGTCT  706

Query  635  ACCTACTGGATGGGGAGCCCTACAAGGGTCCCTCCTGCCTCTTCTCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGT  708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  ACCTACTGGATGGGGAGCCCTACAAGGGTCCCTCCTGCCTCTTCTCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGT  780

Query  709  GGGCGGACCTTTGAGGGCAATGCAGAGACCATGCTGAGCTCACTGGACACTGTGCTGGGGCTAGGGGATGACAC  782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  GGGCGGACCTTTGAGGGCAATGCAGAGACCATGCTGAGCTCACTGGACACTGTGCTGGGGCTAGGGGATGACAC  854

Query  783  CCTTCTGTGGCCTGGTCATGAGTATGCAGAGGAGAACCTGGGCTTTGCAGGTGTGGTGGAGCCCGAGAACCTGG  856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  CCTTCTGTGGCCTGGTCATGAGTATGCAGAGGAGAACCTGGGCTTTGCAGGTGTGGTGGAGCCCGAGAACCTGG  928

Query  857  CCCGGGAGAGGAAGATGCAGTGGGTGCAGCGGCAGCGGCTGGAGCGCAAGGGCACGTGCCCATCTACCCTGGGA  930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  CCCGGGAGAGGAAGATGCAGTGGGTGCAGCGGCAGCGGCTGGAGCGCAAGGGCACGTGCCCATCTACCCTGGGA  1002

Query  931  GAGGAGCGCTCCTACAACCCGTTCCTGAGAACCCACTGCCTGGCGCTACAGGAGGCTCTGGGGCCGGGGCCGGG  1004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  GAGGAGCGCTCCTACAACCCGTTCCTGAGAACCCACTGCCTGGCGCTACAGGAGGCTCTGGGGCCGGGGCCGGG  1076

Query 1005  CCCCACTGGGGATGATGACTACTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAAGAGCTCCGCCGGCTGAAGGATATGCACAAGA  1078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  CCCCACTGGGGATGATGACTACTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAAGAGCTCCGCCGGCTGAAGGATATGCACAAGA  1150

Query 1079  GCAAG  1083
            |||||
Sbjct 1151  GCAAG  1155