Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475094
• Subject: XM_011538225.3
• Aligned Length: 2487
• Identities: 2485
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGACGGATGAACAGGTGTGCGAGACTGTGGAGAAATACGGAGCCAACCGGGAGGAGTGTGCCCGCCTCAACGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACGGATGAACAGGTGTGCGAGACTGTGGAGAAATACGGAGCCAACCGGGAGGAGTGTGCCCGCCTCAACGC  74

Query   75  CTCCCTCTCCTGCCTCAGGAATGTCCACATGTCAGGAGGCAACCTTTCCAAACAAGACTGGACCATCCAGTGGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCCTCTCCTGCCTCAGGAATGTCCACATGTCAGGAGGCAACCTTTCCAAACAAGACTGGACCATCCAGTGGC  148

Query  149  CCACCACAGAGACGGGGAAGGAGAACAATCCCGTGTGCCCCCCGGAGCCCACCCCGTGGATCCGCACCCATCTC  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCACGACAGAGACGGGGAAGGAGAACAATCCCGTGTGCCCCCCGGAGCCCACCCCGTGGATCCGCACCCATCTC  222

Query  223  TCCCAGAGCCCCAGGGTCCCGTCCAAGTGCGTCCAGCACTATTGTCACACCAGCCCCACTCCCGGGGCCCCTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCCAGAGCCCCAGGGTCCCGTCCAAGTGCGTCCAGCACTATTGTCACACCAGCCCCACTCCCGGGGCCCCTGT  296

Query  297  GTACACCCACGTGGACAGGCTTACCGTGGACGCCTACCCGGGCTTGTGCCCGCCCCCGCCACTGGAGTCGGGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTACACCCACGTGGACAGGCTTACCGTGGACGCCTACCCGGGCTTGTGCCCGCCCCCGCCACTGGAGTCGGGCC  370

Query  371  ACCGTTCCCTGCCCCCATCGCCCCGGCAGCGGCACGCGGTCCGCACCCCGCCGCGCACCCCCAACATCGTCACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCGTTCCCTGCCCCCATCGCCCCGGCAGCGGCACGCGGTCCGCACCCCGCCGCGCACCCCCAACATCGTCACC  444

Query  445  ACCGTGACCCCGCCGGGCACGCCGCCCATGAGGAAGAAGAACAAGCTGAAGCCCCCGGGGACCCCACCGCCCTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCGTGACCCCGCCGGGCACGCCGCCCATGAGGAAGAAGAACAAGCTGAAGCCCCCGGGGACCCCACCGCCCTC  518

Query  519  CTCCCGAAAACTGATACACTTGATCCCGGGATTCACCGCGCTGCATCGGAGCAAATCCCACGAGTTCCAGCTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCCCGAAAACTGATACACTTGATCCCGGGATTCACCGCGCTGCATCGGAGCAAATCCCACGAGTTCCAGCTGG  592

Query  593  GGCACCGCGTGGACGAGGCCCACACGCCCAAAGCCAAGAAGAAGAGCAAACCCTTGAACCTCAAGATCCACAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGCACCGCGTGGACGAGGCCCACACGCCCAAAGCCAAGAAGAAGAGCAAACCCTTGAACCTCAAGATCCACAGC  666

Query  667  AGCGTAGGCAGCTGCGAGAACATCCCCTCTCAGCAGCGCTCCCCGCTGCTGTCCGAGCGCTCCCTCCGCTCCTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCGTAGGCAGCTGCGAGAACATCCCCTCTCAGCAGCGCTCCCCGCTGCTGTCCGAGCGCTCCCTCCGCTCCTT  740

Query  741  CTTTGTGGGACACGCACCTTTCCTGCCTTCCACCCCTCCTGTTCACACTGAGGCCAACTTCTCTGCAAACACAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTTGTGGGACACGCACCTTTCCTGCCTTCCACCCCTCCTGTTCACACTGAGGCCAACTTCTCTGCAAACACAC  814

Query  815  TGTCAGTGCCACGCTGGTCCCCGCAGATCCCTCGCAGAGATCTTGGCAACTCCATCAAGCACAGGTTTTCCACC  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTCAGTGCCACGCTGGTCCCCGCAGATCCCTCGCAGAGATCTCGGCAACTCCATCAAGCACAGGTTTTCCACC  888

Query  889  AAGTACTGGATGTCTCAGACGTGCACAGTCTGTGGGAAAGGGATGCTTTTTGGCCTCAAGTGTAAAAACTGCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGTACTGGATGTCTCAGACGTGCACAGTCTGTGGGAAAGGGATGCTTTTTGGCCTCAAGTGTAAAAACTGCAA  962

Query  963  GTTAAAGTGCCACAACAAATGCACCAAAGAAGCCCCACCCTGTCATCTTCTGATCATCCACCGAGGAGATCCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTAAAGTGCCACAACAAATGCACCAAAGAAGCCCCACCCTGTCATCTTCTGATCATCCACCGAGGAGATCCAG  1036

Query 1037  CAAGGTTAGTCCGGACAGAGTCCGTTCCGTGTGACATCAACAACCCTCTACGGAAGCCACCTCGCTATTCAGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAAGGTTAGTCCGGACAGAGTCCGTTCCGTGTGACATCAACAACCCTCTACGGAAGCCACCTCGCTATTCAGAC  1110

Query 1111  CTGCACATCAGTCAGACGCTCCCCAAAACCAACAAAATCAACAAGGACCACATCCCTGTCCCTTACCAGCCAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGCACATCAGTCAGACGCTCCCCAAAACCAACAAAATCAACAAGGACCACATCCCTGTCCCTTACCAGCCAGA  1184

Query 1185  CTCCAGCAGCAACCCCTCCTCCACGACGTCCTCCACGCCCTCCTCGCCAGCACCCCCCCTCCCTCCTAGTGCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCCAGCAGCAACCCCTCCTCCACGACGTCCTCCACGCCCTCCTCGCCAGCACCCCCCCTCCCTCCTAGTGCCA  1258

Query 1259  CGCCGCCTTCTCCCCTACACCCTTCCCCACAGTGCACACGGCAGCAGAAGAACTTCAACCTGCCAGCATCCCAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGCCGCCTTCTCCCCTACACCCTTCCCCACAGTGCACACGGCAGCAGAAGAACTTCAACCTGCCAGCATCCCAC  1332

Query 1333  TACTACAAATACAAGCAGCAGTTCATCTTCCCAGATGTGGTGCCGGTGCCGGAGACGCCGACCCGGGCGCCCCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TACTACAAATACAAGCAGCAGTTCATCTTCCCAGATGTGGTGCCGGTGCCGGAGACGCCGACCCGGGCGCCCCA  1406

Query 1407  GGTCATCCTGCATCCGGTGACCTCGAATCCAATCTTGGAAGGAAATCCATTACTTCAAATTGAAGTGGAGCCAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTCATCCTGCATCCGGTGACCTCGAATCCAATCTTGGAAGGAAATCCATTACTTCAAATTGAAGTGGAGCCAA  1480

Query 1481  CGTCGGAGAATGAAGAGGTCCATGATGAGGCCGAAGAGTCAGAGGATGACTTCGAGGAGATGAACCTGTCCCTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CGTCGGAGAATGAAGAGGTCCATGATGAGGCCGAAGAGTCAGAGGATGACTTCGAGGAGATGAACCTGTCCCTC  1554

Query 1555  CTCTCGGCCCGGAGCTTCCCACGCAAGGCCAGCCAGACCAGCATCTTCCTTCAGGAGTGGGACATCCCCTTTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTCTCGGCCCGGAGCTTCCCACGCAAGGCCAGCCAGACCAGCATCTTCCTTCAGGAGTGGGACATCCCCTTTGA  1628

Query 1629  GCAGCTGGAGATCGGCGAGCTCATTGGAAAGGGCCGCTTTGGGCAAGTGTACCACGGCCGCTGGCATGGCGAGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCAGCTGGAGATCGGCGAGCTCATTGGAAAGGGCCGCTTTGGGCAAGTGTACCACGGCCGCTGGCATGGCGAGG  1702

Query 1703  TGGCCATCCGGCTGATTGACATTGAGAGGGACAACGAGGACCAGCTCAAGGCCTTCAAGCGGGAGGTGATGGCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGCCATCCGGCTGATTGACATTGAGAGGGACAACGAGGACCAGCTCAAGGCCTTCAAGCGGGAGGTGATGGCC  1776

Query 1777  TACAGGCAGACACGGCATGAGAACGTGGTGCTTTTCATGGGTGCCTGCATGAGCCCGCCTCACCTGGCCATCAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TACAGGCAGACACGGCATGAGAACGTGGTGCTTTTCATGGGTGCCTGCATGAGCCCGCCTCACCTGGCCATCAT  1850

Query 1851  CACCAGCCTCTGTAAGGGACGGACGCTCTATTCCGTTGTGAGGGATGCCAAAATCGTTTTGGATGTCAACAAAA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CACCAGCCTCTGTAAGGGACGGACGCTCTATTCCGTTGTGAGGGATGCCAAAATCGTTTTGGATGTCAACAAAA  1924

Query 1925  CCAGGCAGATTGCTCAAGAAATTGTGAAGGGCATGGGCTACCTCCACGCCAAGGGAATCCTACACAAGGACCTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCAGGCAGATTGCTCAAGAAATTGTGAAGGGCATGGGCTACCTCCACGCCAAGGGAATCCTACACAAGGACCTC  1998

Query 1999  AAGTCAAAGAACGTCTTCTATGACAACGGCAAAGTGGTCATCACGGACTTTGGACTCTTCAGCATTTCTGGGGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAGTCAAAGAACGTCTTCTATGACAACGGCAAAGTGGTCATCACGGACTTTGGACTCTTCAGCATTTCTGGGGT  2072

Query 2073  GCTGCAGGCTGGCAGGCGGGAGGACAAACTGCGCATCCAGAATGGCTGGCTATGCCACCTGGCACCAGAGATCA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCTGCAGGCTGGCAGGCGGGAGGACAAACTGCGCATCCAGAATGGCTGGCTATGCCACCTGGCACCAGAGATCA  2146

Query 2147  TCCGCCAGCTGTCCCCCGACACAGAGGAGGATAAGCTCCCCTTCTCCAAGCACTCTGACGTCTTTGCCCTTGGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCCGCCAGCTGTCCCCCGACACAGAGGAGGATAAGCTCCCCTTCTCCAAGCACTCTGACGTCTTTGCCCTTGGC  2220

Query 2221  ACAATCTGGTATGAACTCCACGCCAGGGAATGGCCTTTCAAGACCCAACCAGCAGAGGCAATAATCTGGCAAAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ACAATCTGGTATGAACTCCACGCCAGGGAATGGCCTTTCAAGACCCAACCAGCAGAGGCAATAATCTGGCAAAT  2294

Query 2295  GGGCACAGGCATGAAACCCAACCTCAGCCAGATTGGCATGGGAAAAGAAATCTCGGACATTCTTCTCTTCTGCT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGGCACAGGCATGAAACCCAACCTCAGCCAGATTGGCATGGGAAAAGAAATCTCGGACATTCTTCTCTTCTGCT  2368

Query 2369  GGGCCTTTGAACAAGAAGAGAGACCTACCTTCACCAAGCTCATGGACATGCTGGAGAAACTGCCAAAGCGAAAC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GGGCCTTTGAACAAGAAGAGAGACCTACCTTCACCAAGCTCATGGACATGCTGGAGAAACTGCCAAAGCGAAAC  2442

Query 2443  CGTCGCCTGTCTCACCCTGGACATTTCTGGAAGTCTGCAGAGCTG  2487
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CGTCGCCTGTCTCACCCTGGACATTTCTGGAAGTCTGCAGAGCTG  2487