Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475378
- Subject:
- NM_001317238.2
- Aligned Length:
- 1981
- Identities:
- 1744
- Gaps:
- 212
Alignment
Query 1 ATGTCGTGGCTCTTCGGCGTTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGGCGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGTTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT 148
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Sbjct 1 ---------------------------------------------------------------ATGCAGC---- 7
Query 149 TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGC-----CAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAG-CACTCGCGTTACGCCAAG 216
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Sbjct 8 TGGA-------AGCCCTGAACCTGCTGCACACACTAGTCTGGGCAC-----GGAGTCTCTGCCGT---GCC--G 64
Query 217 GAGGCCCTGAATCTGGCGCAGATGCAGGAGCAGACGCT-----GCAGTTG--------GAGCAACAGTCCAAGC 277
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Sbjct 65 GAG---CT-------GTGCAGACACAGGAGC---GGCTGTCAGGCAG-TGCCAGCCCTGAGCA--AGTGCCAGC 122
Query 278 T------------------CAAAGAGTATGAGGCCGCCGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAG 333
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Sbjct 123 TGGTGAGTGCTGTGCTCTGC-AGGAGTATGAGGCCGCCGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAG 195
Query 334 GCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCCGGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCT 407
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Sbjct 196 GCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCCGGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCT 269
Query 408 GGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAGCGACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGG 481
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Sbjct 270 GGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAGCAACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGG 343
Query 482 AGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCACCGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAG 555
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Sbjct 344 AGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCACCGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAG 417
Query 556 ATGCTGCGAGTGGAGACCGAGGCCCGGGCGCGCGCCAAGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCA 629
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Sbjct 418 ATGCTGCGAGTGGAGACCGAGGCCCGGGCGCGCGCCAAGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCA 491
Query 630 GATCCGCCTGAAGGCGTCCGAGCACCGTCAGACCGTCTTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGG 703
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Sbjct 492 GATCCGCCTGAAGGCGTCCGAGCACCGTCAGACCGTCTTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGG 565
Query 704 AAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACCGGGACAAAGTGACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTC 777
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Sbjct 566 AAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACCGGGACAAAGTGACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTC 639
Query 778 GGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCGACAGCCGTCACTGGCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCT 851
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Sbjct 640 GGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCGACAGCCGTCACTGGCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCT 713
Query 852 AGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTGGAGGCGCTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCA 925
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Sbjct 714 AGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTGGAGGCGCTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCA 787
Query 926 GTCGACCCCAGGACGTGCTGGAGGGTGTTGTGCTTAGTCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATA 999
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Sbjct 788 GTCGACCCCAGGACGTGCTGGAGGGTGTTGTGCTTAGTCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATA 861
Query 1000 GCAACCAGGAACACCAAGAAGAACCGGGGCCTGTACAGGCACATCCTGCTGTATGGGCCACCAGGCACCGGGAA 1073
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Sbjct 862 GCAACCAGGAACACCAAGAAGAACCGGGGCCTGTACAGGCACATCCTGCTGTATGGGCCACCAGGCACCGGGAA 935
Query 1074 GACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGGCATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCC 1147
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Sbjct 936 GACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGGCATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCC 1009
Query 1148 CCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGCTCTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTG 1221
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Sbjct 1010 CCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGCTCTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTG 1083
Query 1222 CTCTTCATGGATGAAGCAGACGCCTTCCTTCGGAAGCGAGCCACTGAGGAGATAAGCAAGGACCTCAGAGCCAC 1295
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Sbjct 1084 CTCTTCATGGATGAAGCAGACGCCTTCCTTCGGAAGCGAGCCACTGAGGAGATAAGCAAGGACCTCAGAGCCAC 1157
Query 1296 ACTGAACGCCTTCCTGTACCACATGGGCCAACACAGCAACAAATTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAATCTGCCTG 1369
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Sbjct 1158 ACTGAACGCCTTCCTGTACCACATGGGCCAACACAGCAACAAATTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAATCTGCCTG 1231
Query 1370 AGCAGTTCGACTGTGCCATCAACAGCCGCATTGACGTGATGGTCCACTTCGACCTGCCGCAGCAGGAGGAGCGG 1443
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Sbjct 1232 AGCAGTTCGACTGTGCCATCAACAGCCGCATTGACGTGATGGTCCACTTCGACCTGCCGCAGCAGGAGGAGCGG 1305
Query 1444 GAGCGCCTGGTGAGACTGCATTTTGACAACTGTGTTCTTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAACGGCGCCTGAAGCT 1517
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Sbjct 1306 GAGCGCCTGGTGAGACTGCATTTTGACAACTGTGTTCTTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAACGGCGCCTGAAGCT 1379
Query 1518 GGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGTCGCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCG 1591
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Sbjct 1380 GGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGTCGCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCG 1453
Query 1592 CTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCATATGCCTCCAAGGACGGGGTCCTCACTGAGGCCATGATGGAC 1665
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Sbjct 1454 CTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCATATGCCTCCAAGGACGGGGTCCTCACTGAGGCCATGATGGAC 1527
Query 1666 GCCTGTGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGTACCGACAGAAGATGCGCTGGCTGAAGGCGGAGGGGCCTGGGCGCGG 1739
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Sbjct 1528 GCCTGTGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGTACCGACAGAAGATGCGCTGGCTGAAGGCGGAGGGGCCTGGGCGCGG 1601
Query 1740 GGTCGAGCACCCCCTATCCGGAGTCCAAGGCGAGACCCTCACCTCATGGAGCCTGGCCACGGACCCCTCCTACC 1813
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Sbjct 1602 GGTCGAGCACCCCCTATCCGGAGTCCAAGGCGAGACCCTCACCTCATGGAGCCTGGCCACGGACCCCTCCTACC 1675
Query 1814 CCTGCCTTGCCGGCCCCTGCACATTTAGGATATGCTCCTGGATGGGGACTGGGCTGTGCCCAGGGCCTCTGTCC 1887
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Sbjct 1676 CCTGCCTTGCCGGCCCCTGCACATTTAGGATATGCTCCTGGATGGGGACTGGGCTGTGCCCAGGGCCTCTGTCC 1749
Query 1888 CCCAGGATGTCTTGTGGTGGCGGTCGGCCGTTCTGCCCCCCAGGGCACCCCCTGTTG 1944
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Sbjct 1750 CCCAGGATGTCTTGTGGTGGCGGTCGGCCGTTCTGCCCCCCAGGGCACCCCCTGTTG 1806