Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475485
- Subject:
- NM_001348187.1
- Aligned Length:
- 2481
- Identities:
- 2387
- Gaps:
- 93
Alignment
Query 1 ATGGTACTTGCGCAAAGACGACGAGGAGGCTGCGAAAAGTTAAGGGCCGGACCGCAGGCTGTGCTCGCTTCCGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTACTTGCGCAAAGACGACGAGGAGGCTGCGAAAAGTTAAGGGCCGGACCGCAGGCTGTGCTCGCTTCCGG 74
Query 75 AAGTGGCTTCTGCGACAACATGCTTGCGGACCTCGGCTTAATCGGAACCATAGGCGAGGATGACGAGGTGCCGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAGTGGCTTCTGCGACAACATGCTTGCGGACCTCGGCTTAATCGGAACCATAGGCGAGGATGACGAGGTGCCGG 148
Query 149 TGGAGCCCGAGTCTGACTCCGGGGACGAGGAAGAGGAGGGGCCCATTGTGCTGGGCAGACGACAAAAAGCTTTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGAGCCCGAGTCTGACTCCGGGGACGAGGAAGAGGAGGGGCCCATTGTGCTGGGCAGACGACAAAAAGCTTTG 222
Query 223 GGGAAGAACCGCAGTGCTGATTTCAACCCTGATTTCGTTTTCACTGAGAAGGAGGGGACGTACGATGGCAGCTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGAAGAACCGCAGTGCTGATTTCAACCCTGATTTCGTTTTCACTGAGAAGGAGGGGACGTACGATGGCAGCTG 296
Query 297 GGCCCTGGCTGATGTCATGAGCCAACTCAAGAAGAAGAGGGCAGCCACTACATTAGATGAGAAGATTGAGAAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGCCCTGGCTGATGTCATGAGCCAACTCAAGAAGAAGAGGGCAGCCACTACATTAGATGAGAAGATTGAGAAAG 370
Query 371 TTCGAAAGAAAAGGAAAACAGAGGATAAAGAAGCCAAGTCTGGGAAGTTGGAAAAGGAGAAAGAAGCAAAGGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTCGAAAGAAAAGGAAAACAGAGGATAAAGAAGCCAAGTCTGGGAAGTTGGAAAAGGAGAAAGAAGCAAAGGAA 444
Query 445 GGCTCTGAACCAAAGGAGCAGGAAGACCTTCAAGAGAATGATGAGGAAGGCTCAGAAGATGAAGCCTCGGAGAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCTCTGAACCAAAGGAGCAGGAAGACCTTCAAGAGAATGATGAGGAAGGCTCAGAAGATGAAGCCTCGGAGAC 518
Query 519 TGACTACTCATCAGCTGATGAGAACATCCTCACCAAAGCAGATACACTCAAAGTAAAGGATCGGAAGAAGAAGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGACTACTCATCAGCTGATGAGAACATCCTCACCAAAGCAGATACACTCAAAGTAAAGGATCGGAAGAAGAAGA 592
Query 593 AGAAGAAAGGACAGGAAGCAGGAGGATTTTTTGAAGATGCATCTCAGTACGATGAAAACCTCTCGTTCCAGGAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAAGAAAGGACAGGAAGCAGGAGGATTTTTTGAAGATGCATCTCAGTACGATGAAAACCTCTCGTTCCAGGAC 666
Query 667 ATGAACCTTTCCCGCCCTCTTCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCCACCCCGATCCAGAAGGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATGAACCTTTCCCGCCCTCTTCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCCACCCCGATCCAGAAGGC 740
Query 741 GTGCATACCTGTGGGTCTATTGGGGAAGGACATCTGTGCCTGTGCAGCCACTGGGACAGGTAAAACTGCCGCCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTGCATACCTGTGGGTCTATTGGGGAAGGACATCTGTGCCTGTGCAGCCACTGGGACAGGTAAAACTGCCGCCT 814
Query 815 TTGCCCTGCCTGTTTTGGAGCGTCTGATTTATAAACCCCGCCAGGCTCCAGTCACCCGCGTGCTGGTGCTAGTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGCCCTGCCTGTTTTGGAGCGTCTGATTTATAAACCCCGCCAGGCTCCAGTCACCCGCGTGCTGGTGCTAGTG 888
Query 889 CCCACCCGAGAGCTGGGCATCCAGGTGCACTCTGTCACCAGACAGCTGGCCCAGTTCTGCAACATCACCACCTG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCCACCCGAGAGCTGGGCATCCAGGTGCACTCTGTCACCAGACAGCTGGCCCAGTTCTGCAACATCACCACCTG 962
Query 963 CCTGGCTGTGGGCGGCTTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCAGCTCTTCGGGCAGCGCCTGACATCCTCATCGCCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCTGGCTGTGGGCGGCTTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCAGCTCTTCGGGCAGCGCCTGACATCCTCATCGCCA 1036
Query 1037 CCCCAGGCCGGCTCATCGATCACCTCCACAACTGCCCTTCCTTCCACCTGAGCAGCATCGAGGTGCTCATCCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCCAGGCCGGCTCATCGATCACCTCCACAACTGCCCTTCCTTCCACCTGAGCAGCATCGAGGTGCTCATCCTG 1110
Query 1111 GACGAGGCTGA--------------------------------------------------------------- 1121
|||||||||||
Sbjct 1111 GACGAGGCTGACAGCCCGCCTGTCGACACAGCCTGGCCACACGCCCCCACTTTGTGGCTTCTGCATTTGCCATT 1184
Query 1122 ------------------------------CAGGATGCTGGATGAGTACTTTGAGGAGCAGATGAAGGAGATCA 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCCTCAGCCTGGAGCCATCTCCTGCCCCTTCAGGATGCTGGATGAGTACTTTGAGGAGCAGATGAAGGAGATCA 1258
Query 1166 TCCGAATGTGTTCCCACCACCGCCAGACCATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGACGAGGTGAAAGATCTGGCT 1239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCGAATGTGTTCCCACCACCGCCAGACCATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGACGAGGTGAAAGATCTGGCT 1332
Query 1240 TCTGTCTCCTTGAAGAATCCTGTCCGGATATTTGTGAACAGCAACACAGATGTGGCTCCCTTCCTGCGGCAGGA 1313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCTGTCTCCTTGAAGAATCCTGTCCGGATATTTGTGAACAGCAACACAGATGTGGCTCCCTTCCTGCGGCAGGA 1406
Query 1314 GTTCATCCGGATCCGGCCTAATCGTGAAGGAGACCGGGAAGCCATCGTGGCAGCTTTGTTGACGAGGACCTTCA 1387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GTTCATCCGGATCCGGCCTAATCGTGAAGGAGACCGGGAAGCCATCGTGGCAGCTTTGTTGACGAGGACCTTCA 1480
Query 1388 CTGACCATGTGATGCTGTTCACGCAAACCAAGAAGCAGGCCCACCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTCATGGGG 1461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGACCATGTGATGCTGTTCACGCAAACCAAGAAGCAGGCCCACCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTCATGGGG 1554
Query 1462 CTGCAGGTGGGTGAGCTCCATGGCAACTTGTCACAGACGCAGCGGCTGGAGGCCCTCCGGCGTTTTAAGGATGA 1535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTGCAGGTGGGTGAGCTCCATGGCAACTTGTCACAGACGCAGCGGCTGGAGGCCCTCCGGCGTTTTAAGGATGA 1628
Query 1536 ACAGATTGACATCCTCGTGGCCACTGATGTGGCAGCCCGTGGACTTGACATTGAGGGGGTCAAAACGGTAATCA 1609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ACAGATTGACATCCTCGTGGCCACTGATGTGGCAGCCCGTGGACTTGACATTGAGGGGGTCAAAACGGTAATCA 1702
Query 1610 ACTTCACAATGCCTAATACCATCAAACATTATGTCCACCGGGTGGGGCGAACAGCACGTGCTGGCAGGGCTGGG 1683
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACTTCACAATGCCTAATACCATCAAACATTATGTCCACCGGGTGGGGCGAACAGCACGTGCTGGCAGGGCTGGG 1776
Query 1684 CGCTCAGTCTCTCTGGTGGGAGAAGATGAGCGGAAGATGCTGAAGGAGATTGTAAAAGCTGCCAAGGCCCCTGT 1757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CGCTCAGTCTCTCTGGTGGGAGAAGATGAGCGGAAGATGCTGAAGGAGATTGTAAAAGCTGCCAAGGCCCCTGT 1850
Query 1758 GAAGGCCAGGATACTTCCCCAAGATGTCATCCTCAAATTCCGGGACAAGATTGAGAAAATGGAGAAAGATGTGT 1831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GAAGGCCAGGATACTTCCCCAAGATGTCATCCTCAAATTCCGGGACAAGATTGAGAAAATGGAGAAAGATGTGT 1924
Query 1832 ATGCAGTTCTGCAGCTAGAGGCGGAGGAAAAAGAGATGCAGCAGTCAGAAGCCCAGATCAATACAGCAAAGCGG 1905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATGCAGTTCTGCAGCTAGAGGCGGAGGAAAAAGAGATGCAGCAGTCAGAAGCCCAGATCAATACAGCAAAGCGG 1998
Query 1906 CTCCTGGAGAAGGGGAAGGAGGCAGTGGTCCAAGAGCCCGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAA 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTCCTGGAGAAGGGGAAGGAGGCAGTGGTCCAAGAGCCCGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAA 2072
Query 1980 GAAGGAGAAAATTGCCAAAGCTCTGCAGGAATTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTA 2053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GAAGGAGAAAATTGCCAAAGCTCTGCAGGAATTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTA 2146
Query 2054 TGAAGGATGCCAAAAAAAAGGGGGAGATGACAGCAGAGGAAAGGTCTCAGTTTGAAACCCTCAAGGCGCAGATG 2127
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGAAGGATGCCAAAAAAAAGGGGGAGATGACAGCAGAGGAAAGGTCTCAGTTTGAAATCCTCAAGGCGCAGATG 2220
Query 2128 TTTGCTGAACGGCTAGCGAAGAGGAATCGCAGAGCCAAGCGGGCCCGAGCAATGCCCGAGGAGGAGCCAGTGAG 2201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TTTGCTGAACGGCTAGCGAAGAGGAATCGCAGAGCCAAGCGGGCCCGAGCAATGCCCGAGGAGGAGCCAGTGAG 2294
Query 2202 AGGTCCTGCCAAGAAGCAAAAGCAGGGGAAGAAATCTGTATTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGG 2275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AGGTCCTGCCAAGAAGCAAAAGCAGGGGAAGAAATCTGTATTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGG 2368
Query 2276 CCCTGAAACAGTATCGAGCTGGCCCTTCCTTTGAAGAAAGGAAACAGTTGGGCTTGCCCCACCAGAGACGAGGA 2349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCCTGAAACAGTATCGAGCTGGCCCTTCCTTTGAAGAAAGGAAACAGTTGGGCTTGCCCCACCAGAGACGAGGA 2442
Query 2350 GGAAACTTTAAATCTAAATCCAGATACAAGAGGAGGAAG 2388
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GGAAACTTTAAATCTAAATCCAGATACAAGAGGAGGAAG 2481