Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475485
• Subject: XM_006499422.1
• Aligned Length: 2479
• Identities: 2022
• Gaps: 206

Alignment

Query    1  ATGGTACTTGCGCAAAGACGACGAGGAGGCTGCGAAAAGTTAAGGGCCGGACCGCAGGCTGTGCTCGCTTCCGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAGTGGCTTCTGCGACAACATGCTTGCGGACCTCGGCTTAATCGGAACCATAGGCGAGGATGACGAGGTGCCGG  148
                               |||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------ATGCTGGCGGAGCTCGGCTTCATCCGGACCATCGGCGAGAATGACGAGGTGCCGG  55

Query  149  TGGAGCCCGAGTCTGACTCCGGGGACGAGGAAGAGGAGGGGCCCATTGTGCTGGGCAGACGA-CAAAAAGCTTT  221
            |.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.| |.| ||.|||||.||
Sbjct   56  TTGAGCCCGAGTCGGACTCCGGAGACGAGGAGGAGGAGGGACCCATTGTGCTGGGCCG-CAAGCAGAAAGCCTT  128

Query  222  GGGGAAGAACCGCAGTGCTGATTTCAACCCTGATTTCGTTTTCACTGAGAAGGAGGGGACGTACGATGGCAGCT  295
            |..||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|.|||.||||||||||
Sbjct  129  GCAGAAGAACCGCAGTGCTGACTTCAACCCTGACTTTGTTTTCACTGAGAAGGAGGGCATGTATGATGGCAGCT  202

Query  296  GGGCCCTGGCTGATGTCATGAGCCAACTCAAGAAGAAGAGGGCAGCCACTACATTAGATGAGAAGATTGAGAAA  369
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  203  GGGCCCTGGCTGATGTCATGAGCCAGCTCAAGAAGAAGCGGGCAGCCACTACACTAGATGAGAAGATTGAGAAA  276

Query  370  GTTCGAAAGAAAAGGAAAACAGAGGATAAAGAAGCCAAGTCTGGGAAGTTGGAAAAGGAGAAAGAAGCAAAGGA  443
            ||.||.||||.||||||..|||||||.||.||||||||||||||||||.|||   ||||||||||||...|||.
Sbjct  277  GTCCGGAAGAGAAGGAAGGCAGAGGACAAGGAAGCCAAGTCTGGGAAGGTGG---AGGAGAAAGAAGGCCAGGC  347

Query  444  AGGCTCTGAACCAAAGGAGCAGGAAGACCTTCAAGAGAAT---------GATGAGGAAGGCTCAGAAGATGAAG  508
            ||.||||||.|..||||.||||            ||||||         |||||||.||||||..|.|||||||
Sbjct  348  AGACTCTGACCTGAAGGGGCAG------------GAGAATCCGGGTGAGGATGAGGCAGGCTCCAAGGATGAAG  409

Query  509  CCTCGGAGACTGACTACTCATCAGCTGATGAGAACATCCTCACCAAAGCAGATACACTCAAAGTAAAGGATCGG  582
            .|||.||||||||||||||.||.|..||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||...|
Sbjct  410  ACTCTGAGACTGACTACTCCTCTGAGGATGAGGAAATCCTCACCAAAGCAGACACACTCAAAGTGAAGGAGAAG  483

Query  583  AAGAAGAAGAAGAA------------------------------GAAAGGA-----------------------  603
            ||||||||||||||                              |||||||                       
Sbjct  484  AAGAAGAAGAAGAAGGGCCAGGTGAGCCTGGGTCTGAGGTTGCTGAAAGGACATGCAGGCTTGCTTGCTTTGCT  557

Query  604  ----------------------------CAGGAAGCAGGAGGATTTTTTGAAGATGCATCTCAGTACGATGAAA  649
                                        ||||.||||||||||||.||||||||||||||..||||.||..|||
Sbjct  558  GAGTTCTTTCCTGTCGTCTGATCTGTTGCAGGCAGCAGGAGGATTCTTTGAAGATGCATCCGAGTATGACAAAA  631

Query  650  ACCTCTCGTTCCAGGACATGAACCTTTCCCGCCCTCTTCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCC  723
            .|||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  632  GCCTGTCCTTCCAGGACATGAACCTCTCCCGGCCCCTCCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCC  705

Query  724  ACCCCGATCCAGAAGGCGTGCATACCTGTGGGTCTATTGGGGAAGGACATCTGTGCCTGTGCAGCCACTGGGAC  797
            ||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  706  ACGCCAATCCAGAAGGCGTGTATCCCTGTGGGTCTGCTGGGGAAGGACATCTGCGCCTGTGCAGCCACTGGGAC  779

Query  798  AGGTAAAACTGCCGCCTTTGCCCTGCCTGTTTTGGAGCGTCTGATTTATAAACCCCGCCAGGCTCCAGTCACCC  871
            |||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||.|
Sbjct  780  AGGCAAAACTGCAGCCTTTGCACTGCCCGTCTTGGAGCGTCTGATCTACAAGCCCCGCCAGGCTGCAGTCACTC  853

Query  872  GCGTGCTGGTGCTAGTGCCCACCCGAGAGCTGGGCATCCAGGTGCACTCTGTCACCAGACAGCTGGCCCAGTTC  945
            |||||||||||||.||.|||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct  854  GCGTGCTGGTGCTGGTCCCCACGAGAGAGCTGGGCATCCAAGTGCACTCTGTCACCAAGCAGCTGGCCCAGTTC  927

Query  946  TGCAACATCACCACCTGCCTGGCTGTGGGCGGCTTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCAGCTCTTCGGGCAGCGCC  1019
            ||||.||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  928  TGCAGCATCACTACCTGCCTGGCTGTGGGTGGCCTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCCGCTCTTCGGGCAGCACC  1001

Query 1020  TGACATCCTCATCGCCACCCCAGGCCGGCTCATCGATCACCTCCACAACTGCCCTTCCTTCCACCTGAGCAGCA  1093
            .|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1002  AGACATCCTCATTGCCACACCTGGCCGGCTCATCGACCACCTCCATAACTGCCCCTCCTTCCACCTGAGCAGCA  1075

Query 1094  TCGAGGTGCTCATCCTGGACGAGGCTGACAGGATGCTGGATGAGTACTTTGAGGAGCAGATGAAGGAGATCATC  1167
            |.||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1076  TTGAAGTGCTCATCTTGGATGAGGCTGACAGGATGCTGGATGAGTATTTCGAGGAGCAGATGAAGGAGATTATC  1149

Query 1168  CGAATGTGTTCCCACCACCGCCAGACCATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGACGAGGTGAAAGATCTGGCTTC  1241
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1150  CGAATGTGTTCCCACCACCGCCAGACCATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGATGAGGTGAAAGATCTGGCTTC  1223

Query 1242  TGTCTCCTTGAAGAATCCTGTCCGGATATTTGTGAACAGCAACACAGATGTGGCTCCCTTCCTGCGGCAGGAGT  1315
            .||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1224  GGTCTCCTTAAAGAATCCTGTGCGGATATTTGTGAACAGCAACACAGATGTCGCTCCCTTCCTGCGGCAAGAGT  1297

Query 1316  TCATCCGGATCCGGCCTAATCGTGAAGGAGACCGGGAAGCCATCGTGGCAGCTTTGTTGACGAGGACCTTCACT  1389
            ||||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.|||||||||.||.|||.|||.|||||||||
Sbjct 1298  TCATACGGATCCGGCCTAATAGGGAAGGGGACCGGGAGGCCATTGTGGCAGCTCTGCTGATGAGAACCTTCACT  1371

Query 1390  GACCATGTGATGCTGTTCACGCAAACCAAGAAGCAGGCCCACCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTCATGGGGCT  1463
            |||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1372  GACCACGTGATGCTCTTCACCCAGACCAAGAAGCAGGCCCATCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTGCTGGGGCT  1445

Query 1464  GCAGGTGGGTGAGCTCCATGGCAACTTGTCACAGACGCAGCGGCTGGAGGCCCTCCGGCGTTTTAAGGATGAAC  1537
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1446  GCAGGTGGGCGAGCTCCACGGCAACTTGTCACAGACCCAGCGCCTGGAGGCCCTCCGGCGCTTTAAGGACGAAC  1519

Query 1538  AGATTGACATCCTCGTGGCCACTGATGTGGCAGCCCGTGGACTTGACATTGAGGGGGTCAAAACGGTAATCAAC  1611
            |||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 1520  AGATTGACATCCTGGTGGCCACAGATGTGGCAGCCCGCGGTCTTGACATTGAAGGAGTGAAAACAGTGATCAAC  1593

Query 1612  TTCACAATGCCTAATACCATCAAACATTATGTCCACCGGGTGGGGCGAACAGCACGTGCTGGCAGGGCTGGGCG  1685
            |||||.|||||.||.||..|.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1594  TTCACCATGCCCAACACTGTTAAACACTATGTGCACCGGGTGGGGCGGACGGCCCGTGCTGGCAGGGCTGGACG  1667

Query 1686  CTCAGTCTCTCTGGTGGGAGAAGATGAGCGGAAGATGCTGAAGGAGATTGTAAAAGCTGCCAAGGCCCCTGTGA  1759
            |||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1668  CTCTGTCTCCCTAGTGGGAGAGGAGGAGCGGAAGATGCTGAAGGAGATCGTGAAGGCTGCCAAGGCGCCAGTGA  1741

Query 1760  AGGCCAGGATACTTCCCCAAGATGTCATCCTCAAATTCCGGGACAAGATTGAGAAAATGGAGAAAGATGTGTAT  1833
            ||||..||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1742  AGGCTCGGATCCTTCCCCAGGATGTTATCCTCAAGTTCCGGGACAAGATTGAGAAATTGGAGAAAGATGTGTAT  1815

Query 1834  GCAGTTCTGCAGCTAGAGGCGGAGGAAAAAGAGATGCAGCAGTCAGAAGCCCAGATCAATACAGCAAAGCGGCT  1907
            |||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||||||.||||.||
Sbjct 1816  GCAGTGCTGCAGCTGGAGGCGGAGGAAAAAGAGATGCAGCAGTCGGAAGCCCAGATTGACACAGCACAGCGACT  1889

Query 1908  CCTGGAGAAGGGGAAGGAGGCAGTGGTCCAAGAGCCCGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAAGA  1981
            |.|.|..||.|||||.|||.|||..|.|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1890  CTTAGCCAAAGGGAAAGAGACAGCAGACCAGGAGCCTGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAAGA  1963

Query 1982  AGGAGAAAATTGCCAAAGCTCTGCAGGAATTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTATG  2055
            |||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1964  AGGAGAAGATTGCTAAGGCTCTACAGGAGTTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTATG  2037

Query 2056  AAGGATGCCAAAAAAAAGGGGGAGATGACAGCAGAGGAAAGGTCTCAGTTTGAAACCCTCAAGGCGCAGATGTT  2129
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||.|||||||||.||||||||
Sbjct 2038  AAGGATGCCAAGAAAAAGGGGGAGATGACGGCAGAGGAGAGGTCCCAGTTTGAAATCCTCAAGGCACAGATGTT  2111

Query 2130  TGCTGAACGGCTAGCGAAGAGGAATCGCAGAGCCAAGCGGGCCCGAGCAATGCCCGAGGAGGAGCCAGTGAGAG  2203
            |||.||.|||||.||.|||||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||   .|.||
Sbjct 2112  TGCAGAGCGGCTGGCCAAGAGGAATCGCAGAACCAAGCGAGCACGGGCAATGCCTGAGGACGAGCC---TACAG  2182

Query 2204  GTCCTGCCAAGAAGCAAAAGCAGGGGAAGAAATCTGTATTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGGCC  2277
            |.|||||.||.|||||.||||||..|.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2183  GCCCTGCTAAAAAGCAGAAGCAGCAGCAGAAGTCTGTGTTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGGCC  2256

Query 2278  CTGAAACAGTATCGAGCTGGCCCTTCCTTTGAAGAAAGGAAACAGTTGGGCTTGCCCCACCAGAGACGAGGAGG  2351
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||..||..||||||.||||||  || ||||
Sbjct 2257  CTGAAACAGTATCGGGCTGGCCCTTCCTTTGAAGAGAGGAAACAGTCAGGTCTGCCCCGCCAGAG--GA-GAGG  2327

Query 2352  AAACTTTAAATCTAAATCCAGATACAAGAGGAGGAAG  2388
            .|||||.||||||||.|||||.||||||||.|.||||
Sbjct 2328  GAACTTCAAATCTAAGTCCAGGTACAAGAGAAAGAAG  2364