Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475662
• Subject: NM_001366038.2
• Aligned Length: 1292
• Identities: 911
• Gaps: 340

Alignment

Query    1  ATGCTTGATACCAACTTGATTCTTCTACCTTTGTTCCAATTT-----------ATTGTG----CCTAAAGAATG  59
                .|||||..|.|.|  |||||.|   |||.||    |||           |||.||    ||   ||..||
Sbjct    1  ----ATGATAAAACCCT--TTCTTTT---TTTTTT----TTTGAGACGCAGTCATTCTGTCACCC---AGTCTG  58

Query   60  GAACAGCAAATATAGACCTGTATGC-AT-TCATCTTGCTGGAA-----------------CAGGAGATCATC--  112
            | |..|||         ||| .||| || |||.||..||||||                 ||.|.|||..||  
Sbjct   59  G-AGTGCA---------CTG-GTGCGATCTCAGCTCACTGGAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCTG  121

Query  113  -----------------------ATTACTGG-AGGCGACGAACA-------CTAA----TGGCCCGTCCTATGA  151
                                   |||||.|| |.|| ||.|.||       ||||    ||        ||||.
Sbjct  122  CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGCATGC-ACCACCACACCTGGCTAATTTTTG--------TATGT  186

Query  152  TTA-AAGAAGCCCGAATGGCTT----CTTTATTGTTAG--------AAAAC-----------------------  189
            ||| .|||     ||..|||||    |.|..|.||.||        .||||                       
Sbjct  187  TTAGTAGA-----GATGGGCTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCC  255

Query  190  -CCTT-------------------ATTATGGCTGCAGGAAAC------CCAAG--GACC-----------AAGT  224
             ||||                   |||||.|  |||.||..|      ||.||  .|||           ||| 
Sbjct  256  ACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAG--GCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTACCTTTTCCTTTTTAAG-  326

Query  225  AAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCTCT  298
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  327  AAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCTCT  400

Query  299  TGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTTCC  372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  401  TGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTTCC  474

Query  373  TTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTCTT  446
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  475  TTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTCTT  548

Query  447  CACTACG-------------------------------------------------------------------  453
            |||||||                                                                   
Sbjct  549  CACTACGGGTGTGTTGAGTAAATCAATTAATTGGAGGGAGCTGGAAAAGCAATATTATACCCAGACAGTTTATG  622

Query  454  -----------------------------------ACAGATTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAACAC  492
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  623  AAGAAGAAATTATTCACATGCTTGAATACTGTGGAACAGATTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAACAC  696

Query  493  TTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAACCA  566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  697  TTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAACCA  770

Query  567  AGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACTCT  640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  771  AGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACTCT  844

Query  641  TATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTCGC  714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  845  TATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTCGC  918

Query  715  AACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTTAT  788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  919  AACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTTAT  992

Query  789  GAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGTGG  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  993  GAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGTGG  1066

Query  863  TTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTGAA  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1067  TTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTGAA  1140

Query  937  ATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAGG--------------  996
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.              
Sbjct 1141  ATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAGACAAGCCATCTATGA  1214

Query  997  ----------------------------------  996
                                              
Sbjct 1215  TGCATTTGACCGCTTCCTCCATAAATACGCTAAC  1248