Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475780
• Subject: NM_001003674.3
• Aligned Length: 932
• Identities: 722
• Gaps: 193

Alignment

Query   1  ATGCCGGAAGCTGGTTTTCAGGCCACAAATGCTTTCACAGAGTGCAAATTCACCTGCACCAGTGGTAAATGCTT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GTATCTTGGTTCGCTGGTCTGTAACCAACAGAACGACTGTGGGGACAACAGTGACGAAG-----------AGAA  137
                        .||..|.||.||||.|.||||.||       |..|||.|||.|.||           |||.
Sbjct   1  -------------ATGTCCAGTGACCACCTGAACAAC-------AGCACACTGAAGGAGGCTCAGTTCAAAGAC  54

Query 138  CTGTCTCCTGGTGACCGAGCACCCGCCTCCGGGCATCTT---CAACTCGGAGCTGGAGTTCGCCCAAATCATCA  208
           ||||                               ||||   .||..|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  55  CTGT-------------------------------TCTTAAAAAAAGCGGAGCTGGAGTTCGCCCAAATCATCA  97

Query 209  TCATCGTCGTGGTGGTCACGGTGATGGTGGTGGTCATCGTCTGCCTGCTGAACCACTACAAAGTCTCCACGCGG  282
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  98  TCATCGTCGTGGTGGTCACGGTGATGGTGGTGGTCATCGTCTGCCTGCTGAACCACTACAAAGTCTCCACGCGG  171

Query 283  TCCTTCATCAACCGCCCGAACCAGAGCCGGAGGCGGGAGGACGGGCTGCCGC----------------------  334
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct 172  TCCTTCATCAACCGCCCGAACCAGAGCCGGAGGCGGGAGGACGGGCTGCCGCAGGAAGGGTGCCTGTGGCCTTC  245

Query 335  --------------------------------AGATCATGCATGCCCCGCGGTCCAGGGACAGGTTCACAGCGC  376
                                           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 246  AGACAGCGCCGCACCGCGGCTGGGCGCCTCGGAGATCATGCATGCCCCGCGGTCCAGGGACAGGTTCACAGCGC  319

Query 377  CGTCCTTCATCCAGAGGGATCGCTTCAGCCGCTTCCAGCCCACCTACCCCTATGTGCAGCACGAGATTGATCTT  450
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 320  CGTCCTTCATCCAGAGGGATCGCTTCAGCCGCTTCCAGCCCACCTACCCCTATGTGCAGCACGAGATTGATCTT  393

Query 451  CCTCCCACCATCTCCCTGTCCGACGGTGAAGAGCCACCTCCTTACCAGGGGCCCTGCACCCTGCAGCTCCGGGA  524
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 394  CCTCCCACCATCTCCCTGTCCGACGGTGAAGAGCCACCTCCTTACCAGGGGCCCTGCACCCTGCAGCTCCGGGA  467

Query 525  CCCTGAACAGCAGATGGAACTCAACCGAGAGTCCGTGAGGGCCCCACCCAACCGAACCATATTTGACAGTGATT  598
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 468  CCCTGAACAGCAGATGGAACTCAACCGAGAGTCCGTGAGGGCCCCACCCAACCGAACCATATTTGACAGTGATT  541

Query 599  TAATAGACATTGCTATGTATAGCGGGGGTCCATGCCCACCCAGCAGCAACTCGGGCATCAGTGCAAGCACCTGC  672
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542  TAATAGACATTGCTATGTATAGCGGGGGTCCATGCCCACCCAGCAGCAACTCGGGCATCAGTGCAAGCACCTGC  615

Query 673  AGCAGTAACGGGAGGATGGAGGGGCCACCCCCCACATACAGCGAGGTGATGGGCCACCACCCAGGCGCCTCTTT  746
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 616  AGCAGTAACGGGAGGATGGAGGGGCCACCCCCCACATACAGCGAGGTGATGGGCCACCACCCAGGCGCCTCTTT  689

Query 747  CCTCCATCACCAGCGCAGCAACGCACACAGGGGCAGCAGACTGCAGTTTCAGCAGAACAATGCAGAGAGCACAA  820
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 690  CCTCCATCACCAGCGCAGCAACGCACACAGGGGCAGCAGACTGCAGTTTCAGCAGAACAATGCAGAGAGCACAA  763

Query 821  TAGTACCCATCAAAGGCAAAGATAGGAAGCCTGGGAACCTGGTC  864
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 764  TAGTACCCATCAAAGGCAAAGATAGGAAGCCTGGGAACCTGGTC  807