Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475780
• Subject: XM_006526086.3
• Aligned Length: 920
• Identities: 777
• Gaps: 58

Alignment

Query   1  ATGCCGGAAGCTGGTTTTCAGGCCACAAATGCTTTCACAGAGTGCAAATTCACCTGCACCAGTGGTAAATGCTT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct   1  ATGCCGGAAGCTGGTTTTCAGGCCACAAATGCGTTCACAGAGTGCAAATTCACCTGCACCAGCGGTAAATGCTT  74

Query  75  GTATCTTGGTTCGCTGGTCTGTAACCAACAGAACGACTGTGGGGACAACAGTGACGAAGAGAACTGTCTCCTGG  148
           ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  75  GTATCTTGGTTCTCTGGTCTGTAACCAACAGAACGACTGTGGGGACAACAGTGACGAAGAGAACTGCCTCCTGG  148

Query 149  TGACCGAGCACCCGCCTCCGGGCATCTTCAACTCGGAGCTGGAGTTCGCCCAAATCATCATCATCGTCGTGGTG  222
           |||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||.|.|||||.||.||||||
Sbjct 149  TGACCGAGCACCCACCGCCGGGCATCTTCAACTCCGAGCTGGAATTCGCGCAGATCCTTATCATTGTTGTGGTG  222

Query 223  GTCACGGTGATGGTGGTGGTCATCGTCTGCCTGCTGAACCACTACAAAGTCTCCACGCGGTCCTTCATCAACCG  296
           ||.||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 223  GTGACGGTGATGGTGGTGGTCGTTGTCTGCCTACTGAACCACTACAAAGTCTCCACACGCTCCTTCATCAACCG  296

Query 297  CCCGAACCAGAGCCGGAGGCGGGAGGACGGGCTGCCGC------------------------------------  334
           |||.||||||||||.|||.|.||||||||||||||.||                                    
Sbjct 297  CCCCAACCAGAGCCAGAGACAGGAGGACGGGCTGCAGCCGGAAGGATCCCTGTGGCCTTCTGATAGCTCCGTGC  370

Query 335  ------------------AGATCATGCATGCCCCGCGGTCCAGGGACAGGTTCACAGCGCCGTCCTTCATCCAG  390
                             ||||||||..||||||.|||..||||||.|||||.||..|.||.||.|||||||||
Sbjct 371  AGCGCCCAGGGGCTTCAGAGATCATGTGTGCCCCACGGGGCAGGGATAGGTTTACTACCCCATCTTTCATCCAG  444

Query 391  AGGGATCGCTTCAGCCGCTTCCAGCCCACCTACCCCTATGTGCAGCACGAGATTGATCTT-CCTCCCACCATCT  463
           |||||||..|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 445  AGGGATCCATTCAGTCGTTTCCAGCCCACCTACCCCTATGTGCAGCACGAGATTGA-CTTGCCTCCCACCATCT  517

Query 464  CCCTGTCCGACGGTGAAGAGCCACCTCCTTACCAGGGGCCCTGCACCCTGCAGCTCCGGGACCCTGAACAGCAG  537
           |||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 518  CCCTGTCAGACGGGGAGGAGCCGCCTCCTTACCAAGGACCCTGCACGCTACAGCTCCGGGACCCAGAGCAGCAG  591

Query 538  ATGGAACTCAACCGAGAGTCCGTGAGGGCCCCACCCAACCGAACCATATTTGACAGTGATTTAATAGACATTGC  611
           ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||||.||.|||||||||.|
Sbjct 592  ATGGAACTCAACCGAGAGTCCGTGAGGGCCCCGCCCAATCGAACCGTTTTTGACAGTGACTTGATAGACATTTC  665

Query 612  TATGTATAGCGGGGGTCCATGCCCACCCAGCAGCAACTCGGGCATCAGTGCAAGC-ACCTGCAGCAGTAACGGG  684
           ||||||.|.||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.|| ||| |||||.|||||||||||.
Sbjct 666  TATGTACAACGGGGGACCATGCCCACCAAGCAGCCACTCGGGCATCAGCGC-AGCTACCTGTAGCAGTAACGGA  738

Query 685  AGGATGGAGGGGCCACCCCCCACATACAGCGAGGTGATGGGCCACCACCCAGGCGCCTCTTTCCTCCATCACCA  758
           ||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||.||||.|||.||||||||||
Sbjct 739  AGAATGGAGGGGCCACCCCCGACCTACAGCGAGGTGATGGGCCACTACCCAGGCACCTCGTTCTTCCATCACCA  812

Query 759  GCGCAGCAACGCACACAGGGGCAGCAGACTGCAGTTTCAGCAGAACAATGCAGAGAGCACAATAGTACCCATCA  832
           ||.|||||||.||||||||||||||||||..||||||||||.||||||..|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 813  GCACAGCAACACACACAGGGGCAGCAGACCACAGTTTCAGCCGAACAACTCAGAGGGCACAATAGTACCCATCA  886

Query 833  AAGGCAAAGATAGGAAGCCTGGGAACCTGGTC  864
           |.||||||||.||||||||.|||.||||||||
Sbjct 887  AGGGCAAAGACAGGAAGCCGGGGGACCTGGTC  918