Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475780
• Subject: XM_017025963.2
• Aligned Length: 918
• Identities: 723
• Gaps: 195

Alignment

Query   1  ATGCCGGAAGCTGGTTTTCAGGCCACAAATGCTTTCACAGAGTGCAAATTCACCTGCACCAGTGGTAAATGCTT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct   1  ATGCCGGAAGCTGGTTTTCAGGCCACAAATGCTTTCACAG----------------------------------  40

Query  75  GTATCTTGGTTCGCTGGTCTGTAACCAACAGAACGACTGTGGGGACAACAGTGACGAAGAGAACTGTCTCCTGG  148
                                                                                     
Sbjct  41  --------------------------------------------------------------------------  40

Query 149  TGACCGAGCACCCGCCTCCGGGCATCTTCAACTCGGAGCTGGAGTTCGCCCAAATCATCATCATCGTCGTGGTG  222
                                            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  41  ---------------------------------CGGAGCTGGAGTTCGCCCAAATCATCATCATCGTCGTGGTG  81

Query 223  GTCACGGTGATGGTGGTGGTCATCGTCTGCCTGCTGAACCACTACAAAGTCTCCACGCGGTCCTTCATCAACCG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  82  GTCACGGTGATGGTGGTGGTCATCGTCTGCCTGCTGAACCACTACAAAGTCTCCACGCGGTCCTTCATCAACCG  155

Query 297  CCCGAACCAGAGCCGGAGGCGGGAGGACGGGCTGCCGC------------------------------------  334
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct 156  CCCGAACCAGAGCCGGAGGCGGGAGGACGGGCTGCCGCAGGAAGGGTGCCTGTGGCCTTCAGACAGCGCCGCAC  229

Query 335  ------------------AGATCATGCATGCCCCGCGGTCCAGGGACAGGTTCACAGCGCCGTCCTTCATCCAG  390
                             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 230  CGCGGCTGGGCGCCTCGGAGATCATGCATGCCCCGCGGTCCAGGGACAGGTTCACAGCGCCGTCCTTCATCCAG  303

Query 391  AGGGATCGCTTCAGCCGCTTCCAGCCCACCTACCCCTATGTGCAGCACGAGATTGATCTTCCTCCCACCATCTC  464
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304  AGGGATCGCTTCAGCCGCTTCCAGCCCACCTACCCCTATGTGCAGCACGAGATTGATCTTCCTCCCACCATCTC  377

Query 465  CCTGTCCGACGGTGAAGAGCCACCTCCTTACCAGGGGCCCTGCACCCTGCAGCTCCGGGACCCTGAACAGCAGA  538
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 378  CCTGTCCGACGGTGAAGAGCCACCTCCTTACCAGGGGCCCTGCACCCTGCAGCTCCGGGACCCTGAACAGCAGA  451

Query 539  TGGAACTCAACCGAGAGTCCGTGAGGGCCCCACCCAACCGAACCATATTTGACAGTGATTTAATAGACATTGCT  612
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 452  TGGAACTCAACCGAGAGTCCGTGAGGGCCCCACCCAACCGAACCATATTTGACAGTGATTTAATAGACATTGCT  525

Query 613  ATGTATAGCGGGGGTCCATGCCCACCCAGCAGCAACTCGGGCATCAGTGCAAGCACCTGCAGCAGTAACGGGAG  686
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 526  ATGTATAGCGGGGGTCCATGCCCACCCAGCAGCAACTCGGGCATCAGTGCAAGCACCTGCAGCAGTAACGGGAG  599

Query 687  GATGGAGGGGCCACCCCCCACATACAGCGAGGTGATGGGCCACCACCCAGGCGCCTCTTTCCTCCATCACCAGC  760
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600  GATGGAGGGGCCACCCCCCACATACAGCGAGGTGATGGGCCACCACCCAGGCGCCTCTTTCCTCCATCACCAGC  673

Query 761  GCAGCAACGCACACAGGGGCAGCAGACTGCAGTTTCAGCAGAACAATGCAGAGAGCACAATAGTACCCATCAAA  834
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 674  GCAGCAACGCACACAGGGGCAGCAGACTGCAGTTTCAGCAGAACAATGCAGAGAGCACAATAGTACCCATCAAA  747

Query 835  GGCAAAGATAGGAAGCCTGGGAACCTGGTC  864
           ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 748  GGCAAAGATAGGAAGCCTGGGAACCTGGTC  777