Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475880
- Subject:
- NM_001289616.1
- Aligned Length:
- 1398
- Identities:
- 1094
- Gaps:
- 237
Alignment
Query 1 ATGAAGGAGCCGGATGCCATCAAGCTGTTTGTGGGGCAGATCCCGAGGCACCTGGAGGAGAAGGACCTGAAGCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATCTTCGAACAGTTTGGTCGGATCTTTGAGCTGACTGTCATCAAGGACAAGTACACCGGGCTGCACAAGGGAT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GTGCCTTCCTGACATACTGTGCCCGGGATTCAGCCCTGAAGGCCCAGAGCGCCCTGCACGAACAGAAGACGCTT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCAGGGATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGCCGAGGAGAAGACCGGAAGCTCTTTGT 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------ATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGTCGAGG---AGACCGGAAGCTCTTTGT 65
Query 297 GGGGATGCTAGGGAAGCAGCAGACAGATGAGGACGTCCGGAAGATGTTTGAGCCCTTCGGGACCATCGACGAGT 370
|||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 66 GGGCATGCTAGGAAAGCAGCAGACAGATGAGGATGTCCGGAAGATGTTTGAACCATTTGGGACTATAGACGAGT 139
Query 371 GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGATGGCACCAGCAAAGGCTGCGCCTTCGTGAAGTTCCAGACCCACGCTGAGGCC 444
||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 140 GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGACGGTACCAGCAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAGTTCCAGACTCACGCTGAGGCC 213
Query 445 AAGGCGGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTGCCAGGTGCCTCGTCCAGCCTGGTGGTGAAGTTTGC 518
.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 214 CAGGCAGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTACCGGGTGCCTCATCCAGCCTGGTGGTAAAGTTTGC 287
Query 519 TGACACTGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGCCGCATGCAGCAGGTGGCCACCCAGTTGGGCATGTTCAGCCCCATCA 592
||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||.
Sbjct 288 TGACACGGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGTCGAATGCAGCAGGTGGCTACCCAGCTGGGCATGTTCAGCCCGATCG 361
Query 593 CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCGGCTCAC 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 362 CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCAGCTCAC 435
Query 667 AGTGCCTACCTCAGCCCCATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAATGCCAATGG 740
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 436 AGTGCCTACCTCAGCCCTATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAGTGCCAATGG 509
Query 741 CCTCATCGCCACCCCCATCACCCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATCGCTGCCACGCCTGTCTCTG 814
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 510 CCTCATCGCCACCCCCATCACTCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATTGCTGCCACGCCCGTCTCTG 583
Query 815 CCATTCCGGCTGCCCTGGGCGTCAACGGCTACAGCCAGGTGCCCACCCAGCCCACTGGGCAGCCTGCCCCTGAT 888
||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 584 CCATCCCTGCTGCCTTGGGCGTCAACGGCTACAGCCCGGTGCCCACCCAGCCTACAGGGCAGCCTGCCCCGGAT 657
Query 889 GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCCTACCCAGCCCAGAGCCCCGCGGCCCCCGTGGACCCCCTGCAGCAGGC 962
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 658 GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCTTACCCAGCCCAGAGCCCGGCAGCCCCCGTGGACCCTCTCCAGCAGGC 731
Query 963 CTACGCGGGGATGCAGCACTACA---CAGCCTACCCAGCAGCCTACAGCCTGGTTGCACCTGCGTTCCCGCAGC 1033
|||.||.||.||||||||||||| ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 CTATGCAGGAATGCAGCACTACACAGCAGCGTACCCCGCAGCCTACAGCCTGGTTGCACCTGCGTTCCCGCAGC 805
Query 1034 CTCCAGCCCTGGTCGCCCAGCAGCCCCCACCACCACCTCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAG--- 1104
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 806 CTCCAGCCCTGGTTGCCCAGCAGCCCCCACCACCACCTCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAA 879
Query 1105 CAGCAGCAGCAAAGAGAAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGAGTTCACTGACTC 1178
||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 880 CAGCAGCAGCAACGGGAAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGAGTTCACAGACTC 953
Query 1179 AGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCCTTTGGCCACGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACCGAGCCACCAATC 1252
||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 954 AGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCTTTTGGTCATGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACCGGGCCACCAATC 1027
Query 1253 AAAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAGGCCATGAATGGC 1326
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1028 AGAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAGGCTATGAACGGT 1101
Query 1327 TTCCAGATCGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCCAACCGGCCCTAC 1392
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1102 TTCCAGATTGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCAAACAGGCCCTAC 1167